Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13039
- Subject:
- XM_006498093.3
- Aligned Length:
- 1813
- Identities:
- 1096
- Gaps:
- 626
Alignment
Query 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTGGCCACTTCTCTGATGTGGGTGCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
Query 75 GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA 148
.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 CCTGTACTTCAGCGAGTGTAACAAGTGTGATGACAAGAAGGAGAGATCCCTGCTGCCTGCGCTGAGGGCTGTTA 148
Query 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG 222
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGTCCAGGAGAAATGGGAAAGGCTGTGCTTATTCCAAAAGATGACCAAGAGAAAATG 222
Query 223 AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA 296
||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 223 AAAGAGTTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTCATGGCCAGTGACTTGATCGCACTTAACCGAAGTCTGCCGGA 296
Query 297 TGTAAGATTAGAAG------------------------------------------------------------ 310
|||.||||||||||
Sbjct 297 TGTGAGATTAGAAGGACAGTACTGTTGTGGTAGATGTGAAGAACTTCAAACAATGCAGCAAGAAAGATATGCTA 370
Query 311 ------------------------------------------------------------------GATGTAAG 318
||||.|||
Sbjct 371 GAGTTTACATCTCTACCAACTTCTGCTCCAGTATCCTCTTCTGGTTGAAATGTAACACTGAGTTGAGATGCAAG 444
Query 319 ACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTCATAATGAAGCTTGGAGCACTCT 392
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTCCATAATGAAGCTTGGAGCACTCT 518
Query 393 CCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCAGAGGTCATCTTGGTAGATGATG 466
.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 ACTTAGAACTGTCTATAGTGTCATAAATCGCTCCCCACACTACCTGCTCTCTGAGGTCATCTTGGTTGATGATG 592
Query 467 CCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTTAGAAGTGCCAGTAAAAATTATT 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 593 CCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAACTACGTGAAAACTTTAGAAGTGCCAGTGAAGATTATC 666
Query 541 AGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTGCTTCAAAAGGGCAGGTCATAAC 614
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AGGATGGAAGAGCGCTCTGGGTTAATACGCGCCCGTCTCCGAGGAGCAGCAGCTTCAAAAGGACAGGTCATAAC 740
Query 615 TTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTGGCAAGAATAAAGGAAGACAGGA 688
||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTCTGGATGCACACTGCGAGTGCACCTTAGGATGGCTGGAGCCCTTGCTGGCGAGAATAAAGGAAGACAGGA 814
Query 689 AAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATATATGGCTGGGTCAGACATGACT 762
||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAACAGTTGTGTGCCCGATCATTGATGTTATTAGTGATGATACGTTTGAGTACATGGCTGGGTCAGACATGACT 888
Query 763 TATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAAGAGAAATGGACAGGAGGAAAGG 836
|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 889 TATGGTGGTTTCAACTGGAAGCTAAATTTCCGATGGTATCCTGTCCCTCAAAGAGAAATGGATAGGAGAAAAGG 962
Query 837 AGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCTATTGACAGAAACTACTTTGAAG 910
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGACAGGACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCTATTGACAGAAACTACTTTGAAG 1036
Query 911 AGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGAAATGTCTTTTAGGATTTGGCAA 984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 AGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGAAATGTCTTTTAGGATCTGGCAA 1110
Query 985 TGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTCGGAAGGCAACTCCATACACTTT 1058
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 TGTGGAGGTTCTTTGGAGATTGTGACTTGCTCTCATGTCGGTCATGTTTTTCGAAAGGCAACTCCATACACATT 1184
Query 1059 TCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAAGTTTGGATGGATGAATTTAAAG 1132
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 CCCTGGTGGCACTGGCCATGTCATTAACAAGAACAACAGAAGACTGGCAGAAGTGTGGATGGATGAATTCAAAG 1258
Query 1133 ATTTCTTCTACATCATATCCCCAGG----TGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGTGTCAGTCAGAAAAACACT 1202
||||||||||.|||||||||||||| |||| |.|| .|||||...|
Sbjct 1259 ATTTCTTCTATATCATATCCCCAGGGCTTTGTT-----ACTG----------------------CAAAAATGTT 1305
Query 1203 AAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGGACTCCCAGATCCCAAGAC 1276
||.|||| ||| ||
Sbjct 1306 AACAGAA---CTG------------TT----------------------------------------------- 1317
Query 1277 GTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAACATGGGCCGCAAGGAAAAT 1350
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1351 GAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTACACTGCTGACAAAGAAAT 1424
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1425 CCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGTTAAAATGCCACCATATGA 1498
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1499 GAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAGTCTTGTCTCTCAGTGAACAAAGTAGCTGATGGCTCCCAGCAT 1572
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1573 CCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAGCACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTATACAAGAATGGAAATTTT 1646
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1647 TAGAAATATTTTTGGGAATTCTACTGATTACATTCTC 1683
Sbjct 1318 ------------------------------------- 1317