Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13162
• Subject: NM_080927.4
• Aligned Length: 2367
• Identities: 2185
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGAGCCGGGCGGTGGTGAGAGCCAGGCGCTGCCCGCAGTGTCCCCAAGTCCGGGCCGCGGCCGCCGCCCC  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGCCTCTGT  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct   75  CGCCTGGGCCGCGCTCCCCCTCTCCCGCTCCCTCCCTCCCTGCTCCAACTCCTCCTCCTTCTCCATGCCTCTGT  148

Query   11  TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTGCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC  84
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTCCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC  222

Query   85  ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG  296

Query  159  TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG  370

Query  233  ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT  444

Query  307  GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT  518

Query  381  CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA  592

Query  455  CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA  666

Query  529  TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC  740

Query  603  AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA  814

Query  677  ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG  888

Query  751  GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG  962

Query  825  GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG  1036

Query  899  ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC  1110

Query  973  ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA  1184

Query 1047  CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT  1258

Query 1121  TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG  1332

Query 1195  GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG  1406

Query 1269  CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC  1480

Query 1343  AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC  1554

Query 1417  GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC  1628

Query 1491  TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC  1702

Query 1565  CTTACTGGGACCGGGCAGGTTTTTATTTAATGGTCTCTTTGGCTTGCCGTCACAATGAAGGTTGGTGGAAAGGA  1638
            ||||||||||||||||                                          ||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTTACTGGGACCGGGC------------------------------------------AGGTTGGTGGAAAGGA  1734

Query 1639  ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGTGAAGTTAA  1712
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1735  ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGCGAAGTTAA  1808

Query 1713  TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1809  TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG  1882

Query 1787  GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883  GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA  1956

Query 1861  GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957  GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA  2030

Query 1935  TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031  TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA  2104

Query 2009  AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC  2082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105  AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC  2178

Query 2083  TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA  2156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2179  TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA  2252

Query 2157  GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT  2229
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253  GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT  2325