Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13274
• Subject: NM_152523.2
• Aligned Length: 867
• Identities: 714
• Gaps: 153

Alignment

Query   1  ATGCCCGAAGATTTAGCTTTGGAGTCAAACCCTTCTGACCATCCAAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCCGAAGATTTAGCTTTGGAGTCAAACCCTTCTGACCATCCAAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC  74

Query  75  TCAAACGGATGTGCGAGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTGAACCAT----------------------------  120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  75  TCAAACGGATGTGCGAGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTGAACCATGTATCTCCAGGGCAGCTTACTAAAAAGT  148

Query 121  -------------------------------------------------------------------------T  121
                                                                                    |
Sbjct 149  ATAGCTCATGCTCAACAATATTTCTAGATGACAGCACAGTCAGCCAGCCTAATCTTAGAACCACAGTAAAATGT  222

Query 122  GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAG---------------------------------------  156
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 223  GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAGAGATGCAAATAGATCCCTGGATATTTTTGATGAGAGATC  296

Query 157  -------------CGAGAAAAAGTTCCAGAGGAATACTTTAAGCATGATCCTGAGCACAAATTTATTTACAGAT  217
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACATCCACTTACACGAGAAAAAGTTCCAGAGGAATACTTTAAGCATGATCCTGAGCACAAATTTATTTACAGAT  370

Query 218  TTGTTCGTACTCTTTTTAGTGCTGCACAGCTAACAGCTGAATGTGCAATAGTAACTTTGGTTTACTTAGAAAGG  291
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGTTCGTACTCTTTTTAGTGCTGCACAGCTAACAGCTGAATGTGCAATAGTAACTTTGGTTTACTTAGAAAGG  444

Query 292  CTTTTAACTTATGCTGAAATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGGATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC  365
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTTTTAACTTATGCTGAAATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGGATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC  518

Query 366  CTCCAAGGTTTGGGACGATCAGGCTGTATGGAATGTGGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACAGTTGAGG  439
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CTCCAAGGTTTGGGACGATCAGGCTGTATGGAATGTGGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACAGTTGAGG  592

Query 440  ACATGAATGAAATGGAAAGGCATTTTCTGGAGCTTCTTCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC  513
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACATGAATGAAATGGAAAGGCATTTTCTGGAGCTTCTTCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC  666

Query 514  AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTATTTGCTCCTCTTAGCAAAGA  587
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTATTTGCTCCTCTTAGCAAAGA  740

Query 588  AAGAGCACAGAACCTAGAGGCTATTTCTAGATTGTGTGAAGACAAAGACTTGTGTAGAGCCGCTATGAGAAGGT  661
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  AAGAGCACAGAACCTAGAGGCTATTTCTAGATTGTGTGAAGACAAAGACTTGTGTAGAGCCGCTATGAGAAGGT  814

Query 662  CTTTCAGTGCTGATAACTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAAAGCCATCCTCTCT  714
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  CTTTCAGTGCTGATAACTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAAAGCCATCCTCTCT  867