Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13287
- Subject:
- NM_175613.2
- Aligned Length:
- 2094
- Identities:
- 2087
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGG 74
Query 75 CGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAG 148
Query 149 ATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATA 222
Query 223 GCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCAT 296
Query 297 TGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATG 370
Query 371 AAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACC 444
Query 445 TGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAAT 518
Query 519 GGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACT 592
Query 593 CGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAA 666
Query 667 AGAGTTGGAGG---GGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGT 737
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAGTTGGAGGGCAGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGT 740
Query 738 CTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCC 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGCATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCC 814
Query 812 CAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAATCAC 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 CAGAGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAACCAC 888
Query 886 AGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCGTTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCC 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCCCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCATTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCC 962
Query 960 AGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCA 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCA 1036
Query 1034 CAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTC 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGTTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTC 1110
Query 1108 CCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGT 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCGAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGT 1184
Query 1182 CCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGTGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGA 1255
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCTGAGGAATTACAGAATGGTCGAGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGA 1258
Query 1256 TGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGACGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCC 1329
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGACAGTGCTGGCCTCAGCTGATGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCC 1332
Query 1330 TTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGC 1406
Query 1404 AGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCT 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAAGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCT 1480
Query 1478 GGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAA 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGGCCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAA 1554
Query 1552 GAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGT 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGT 1628
Query 1626 GCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAA 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTGTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAA 1702
Query 1700 CCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAAT 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCGAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAAT 1776
Query 1774 TGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGGGATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACA 1850
Query 1848 AAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAA 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AAGCAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAA 1924
Query 1922 TAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAAT 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TAGAAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAAT 1998
Query 1996 GCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTC 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCCTACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTC 2072
Query 2070 CCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 2091
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCTCACAGCTAGGTCCAGTTTA 2094