Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13293
• Subject: NM_152548.3
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1241
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAATTACAATTCCTTGGTACATTGGCTTCCTCAGAAAAAAGAAAAAAATCACAGAGATTGTTTTTCAAAAA  74

Query    1  ----------------------------------------ATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCT  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATCAAATCTACAAAAAATAAAGCTGGAAAAGCAAGCATCATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCT  148

Query   35  CTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGATGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAA  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGATGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAA  222

Query  109  AAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGAATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAG  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGAATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAG  296

Query  183  TCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGTCAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTA  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGTCAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTA  370

Query  257  CCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGAGGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGC  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGAGGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGC  444

Query  331  TTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAAGCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAA  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAAGCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAA  518

Query  405  ACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGAGCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTG  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGAGCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTG  592

Query  479  CAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGGAGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCA  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGGAGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCA  666

Query  553  AGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGCAAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGA  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGCAAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGA  740

Query  627  ATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGACATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATTGAAA  700
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  ATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGACATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATAGAAA  814

Query  701  CTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCAGGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAA  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCAGGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAA  888

Query  775  TTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAGTTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATT  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAGTTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATT  962

Query  849  TCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAATGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGT  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAATGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGT  1036

Query  923  CTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAGCAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAG  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAGCAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAG  1110

Query  997  GAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAATTGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGAT  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAATTGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGAT  1184

Query 1071  CTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCAGGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCC  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCAGGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCC  1258

Query 1145  TCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATATAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGC  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATATAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGC  1332

Query 1219  AAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1242
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1356