Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13293
• Subject: XM_017009118.1
• Aligned Length: 1242
• Identities: 1106
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCTCTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAAAAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGA  148
                                                                         |||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATGTCAACCAAGA  13

Query  149  ATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAGTCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   14  ATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAGTCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGT  87

Query  223  CAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTACCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   88  CAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTACCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGA  161

Query  297  GGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGCTTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  GGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGCTTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAA  235

Query  371  GCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAAACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  GCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAAACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGA  309

Query  445  GCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTGCAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  GCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTGCAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGG  383

Query  519  AGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCAAGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  AGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCAAGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGC  457

Query  593  AAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGAATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  AAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGAATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGAC  531

Query  667  ATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATTGAAACTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  ATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATAGAAACTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCA  605

Query  741  GGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAATTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  GGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAATTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAG  679

Query  815  TTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATTTCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  TTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATTTCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAA  753

Query  889  TGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGTCTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  TGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGTCTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAG  827

Query  963  CAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAGGAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  CAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAGGAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAAT  901

Query 1037  TGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGATCTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  TGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGATCTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCA  975

Query 1111  GGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCCTCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  GGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCCTCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATA  1049

Query 1185  TAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGCAAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  TAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGCAAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1107