Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13342
• Subject: XM_011532640.2
• Aligned Length: 2032
• Identities: 1670
• Gaps: 362

Alignment

Query    1  ATGGACGGTGAGGCAGTCCGCTTCTGCACAGATAACCAGTGTGTCTCCCTGCACCCCCAAGAGGTGGACTCTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGTGAGGCAGTCCGCTTCTGCACAGATAACCAGTGTGTCTCCCTGCACCCCCAAGAGGTGGACTCTGT  74

Query   75  GGCAATGGCTCCTGCAGCCCCCAAGATACCGAGGCTCGTTCAGGCTACCCCGGCATTTATGGCTGTGACCTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAATGGCTCCTGCAGCCCCCAAGATACCGAGGCTCGTTCAGGCTACCCCGGCATTTATGGCTGTGACCTTGG  148

Query  149  TCTTCTCTCTTGTGACTCTCTTTGTAGTG---------------------------------------------  177
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  149  TCTTCTCTCTTGTGACTCTCTTTGTAGTGGGTAAGCCCCCAGGTGACCCAAATCTCACTAACTTTCTCTCCTTT  222

Query  178  --------------------------------------------------------------------------  177
                                                                                      
Sbjct  223  CAGCACAAAGTCCCCAGGGGCCCCAGATGCACACTCTCTGGGCCTCTCTGCTCCCAGAAAGATCATTCCACCTC  296

Query  178  --------------------------------------------------------------------------  177
                                                                                      
Sbjct  297  CAGCTCCAGGCCCAAGCCACAGCTTCCCTGGGAACAGATAAAGGCCACTGTCCAAGGGGGAGCCTCCCAAGAAC  370

Query  178  --------------------------------------------------------------------------  177
                                                                                      
Sbjct  371  TGAGGTTCATGAGGGAAACCCTGGGAGGGTCTTTGCTGCTATCTCCCCGGTTCTGGAACTCTACCTCTGTGTGG  444

Query  178  ---------------------------------------------------------------GTTCAACAGCA  188
                                                                           |||||||||||
Sbjct  445  GACAGCGTATCCTCCCAGGCTCAGGGCTGGGGATTTGCTGACCTGGAAAAATGGAATGTCTCAGTTCAACAGCA  518

Query  189  GACAAGACCTGTTCCGAAGCCTGTGCAAGCCGTAATTCTGGGAGACAACATTACTGGGCATTTACCTTTTGAAC  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAAGACCTGTTCCGAAGCCTGTGCAAGCCGTAATTCTGGGAGACAACATTACTGGGCATTTACCTTTTGAAC  592

Query  263  CCAACAATCATCACCACTTTGGCAGGGAGGCAGAAATGCGAGAGCTTATCCAGACATTTAAAGGCCACATGGAG  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAATCATCACCACTTTGGCAGGGAGGCAGAAATGCGAGAGCTTATCCAGACATTTAAAGGCCACATGGAG  666

Query  337  AATTCCAGTGCCTGGGTAGTAGAAATCCAGATGTTGAAGTGCAGAGTGGACAATGTCAATTCGCAGCTCCAGGT  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTCCAGTGCCTGGGTAGTAGAAATCCAGATGTTGAAGTGCAGAGTGGACAATGTCAATTCGCAGCTCCAGGT  740

Query  411  GCTCGGTGATCATCTGGGAAACACCAATGCTGACATCCAGATGGTAAAAGGAGTTCTAAAGGATGCCACTACAT  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTCGGTGATCATCTGGGAAACACCAATGCTGACATCCAGATGGTAAAAGGAGTTCTAAAGGATGCCACTACAT  814

Query  485  TGAGTTTGCAGACACAGATGTTAAGGAGTTCCCTGGAGGGAACCAATGCTGAGATCCAGAGGCTCAAGGAAGAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAGTTTGCAGACACAGATGTTAAGGAGTTCCCTGGAGGGAACCAATGCTGAGATCCAGAGGCTCAAGGAAGAC  888

Query  559  CTTGAAAAGGCAGATGCTTTAACTTTCCAGACGCTGAATTTCTTAAAAAGCAGTTTAGAAAACACCAGCATTGA  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTGAAAAGGCAGATGCTTTAACTTTCCAGACGCTGAATTTCTTAAAAAGCAGTTTAGAAAACACCAGCATTGA  962

Query  633  GCTCCACGTGCTAAGCAGAGGCTTAGAAAATGCAAACTCTGAAATTCAGATGTTGAATGCCAGTTTGGAAACGG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCCACGTGCTAAGCAGAGGCTTAGAAAATGCAAACTCTGAAATTCAGATGTTGAATGCCAGTTTGGAAACGG  1036

Query  707  CAAATACCCAGGCTCAGTTAGCCAATAGCAGTTTAAAGAACGCTAATGCTGAGATCTATGTTTTGAGAGGCCAT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAATACCCAGGCTCAGTTAGCCAATAGCAGTTTAAAGAACGCTAATGCTGAGATCTATGTTTTGAGAGGCCAT  1110

Query  781  CTAGATAGTGTCAATGACTTGAGGACCCAGAACCAGGTTTTAAGAAATAGTTTGGAAGGAGCCAATGCTGAGAT  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTAGATAGTGTCAATGACTTGAGGACCCAGAACCAGGTTTTAAGAAATAGTTTGGAAGGAGCCAATGCTGAGAT  1184

Query  855  CCAGGGACTAAAGGAAAATTTGCAGAACACAAATGCTTTAAACTCCCAGACCCAGGCCTTTATAAAAAGCAGTT  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGGGACTAAAGGAAAATTTGCAGAACACAAATGCTTTAAACTCCCAGACCCAGGCCTTTATAAAAAGCAGTT  1258

Query  929  TTGACAACACTAGTGCTGAGATCCAGTTCTTAAGAGGTCATTTGGAAAGAGCTGGTGATGAAATTCACGTGTTA  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGACAACACTAGTGCTGAGATCCAGTTCTTAAGAGGTCATTTGGAAAGAGCTGGTGATGAAATTCACGTGTTA  1332

Query 1003  AAAAGGGATTTGAAAATGGTCACAGCCCAGACCCAAAAAGCAAATGGCCGTCTGGACCAGACAGATACTCAGAT  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAAGGGATTTGAAAATGGTCACAGCCCAGACCCAAAAAGCAAATGGCCGTCTGGACCAGACAGATACTCAGAT  1406

Query 1077  TCAGGTATTCAAGTCAGAGATGGAAAATGTGAATACCTTAAATGCCCAGATTCAGGTCTTAAATGGTCATATGA  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGTATTCAAGTCAGAGATGGAAAATGTGAATACCTTAAATGCCCAGATTCAGGTCTTAAATGGTCATATGA  1480

Query 1151  AAAATGCCAGCAGAGAGATACAGACCCTAAAACAAGGAATGAAGAATGCTTCAGCCTTAACTTCCCAGACCCAG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAATGCCAGCAGAGAGATACAGACCCTAAAACAAGGAATGAAGAATGCTTCAGCCTTAACTTCCCAGACCCAG  1554

Query 1225  ATGTTAGACAGCAATCTGCAGAAGGCCAGTGCCGAGATCCAGAGGTTAAGAGGGGATCTAGAGAACACCAAAGC  1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGTTAGACAGCAATCTGCAGAAGGCCAGTGCCGAGATCCAGAGGTTAAGAGGGGATCTAGAGAACACCAAAGC  1628

Query 1299  TCTAACCATGGAAATCCAGCAGGAGCAGAGTCGCCTGAAGACCCTCCATGTGGTCATTACTTCACAGGAACAGC  1372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTAACCATGGAAATCCAGCAGGAGCAGAGTCGCCTGAAGACCCTCCATGTGGTCATTACTTCACAGGAACAGC  1702

Query 1373  TACAAAGAACCCAAAGTCAGCTTCTCCAGATGGTCCTGCAAGGCTGGAAGTTCAATGGTGGAAGCTTATATTAT  1446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TACAAAGAACCCAAAGTCAGCTTCTCCAGATGGTCCTGCAAGGCTGGAAGTTCAATGGTGGAAGCTTATATTAT  1776

Query 1447  TTTTCTAGTGTCAAGAAGTCTTGGCATGAGGCTGAGCAGTTCTGCGTGTCCCAGGGAGCCCATCTGGCATCTGT  1520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTTCTAGTGTCAAGAAGTCTTGGCATGAGGCTGAGCAGTTCTGCGTGTCCCAGGGAGCCCATCTGGCATCTGT  1850

Query 1521  GGCCTCCAAGGAGGAGCAGGCATTTCTGGTAGAGTTCACAAGTAAAGTGTACTACTGGATCGGTCTCACTGACA  1594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCCTCCAAGGAGGAGCAGGCATTTCTGGTAGAGTTCACAAGTAAAGTGTACTACTGGATCGGTCTCACTGACA  1924

Query 1595  GGGGCACAGAGGGCTCCTGGCGCTGGACAGATGGGACACCATTCAACGCCGCCCAGAACAAAGCGAGCCAC-AG  1667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1925  GGGGCACAGAGGGCTCCTGGCGCTGGACAGATGGGACACCATTCAACGCCGCCCAGAACAAAGCG-GCCACTAG  1997

Query 1668  CACCAGGAAGGGATGCTGCCTTCATCTAACAGTA  1701
                     ||||                     
Sbjct 1998  ---------GGGA---------------------  2001