Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13426
Subject:
NM_001289020.3
Aligned Length:
814
Identities:
730
Gaps:
73

Alignment

Query   1  MVKQTIQIFARVKPPVRKHQQGIYSIDEDEKLIPSLEIILPRDLADGFVNNKRESYKFKFQRIFDQDANQETVF  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MVKQTIQIFARVKPPVRKHQQGIYSIDEDEKLIPSLEIILPRDLADGFVNNKRESYKFKFQRIFDQDANQETVF  74

Query  75  ENIAKPVAGSVLAGYNGTIFAYGQTGSGKTFTITGGAERYSDRGIIPRTLSYIFEQLQKDSSKIYTTHISYLEI  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ENIAKPVAGSVLAGYNGTIFAYGQTGSGKTFTITGGAERYSDRGIIPRTLSYIFEQLQKDSSKIYTTHISYLEI  148

Query 149  YNECGYDLLDPRHEASSLEDLPKVTILEDPDQNIHLKNLTLHQATTEEEALNLLFLGDTNRMIAETPMNQASTR  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  YNECGYDLLDPRHEASSLEDLPKVTILEDPDQNIHLKNLTLHQATTEEEALNLLFLGDTNRMIAETPMNQASTR  222

Query 223  SHCIFTIHLSSKEPGSATVRHAKLHLVDLAGSERVAKTGVGGHLLTEAKYINLSLHYLEQVIIALSEKHRSHIP  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  SHCIFTIHLSSKEPGSATVRHAKLHLVDLAGSERVAKTGVGGHLLTEAKYINLSLHYLEQVIIALSEKHRSHIP  296

Query 297  YRNSMMTSVLRDSLGGNCMTTMIATLSLEKRNLDESISTCRFAQRVALIKNEAVLNEEINPRLVIKRLQKEIQE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  YRNSMMTSVLRDSLGGNCMTTMIATLSLEKRNLDESISTCRFAQRVALIKNEAVLNEEINPRLVIKRLQKEIQE  370

Query 371  LKDELAMVTGEQRTEALTEAELLQLEKLITSFLEDQDSDSRLEVGADMRKVHHCFHHLKKLLNDKKILENNTVS  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  LKDELAMVTGEQRTEALTEAELLQLEKLITSFLEDQDSDSRLEVGADMRKVHHCFHHLKKLLNDKKILENNTVS  444

Query 445  SESKDQDCQEPLKEEEYRKLRDILKQRDNEISILSEVMKK--------LPLSWFER------------------  492
           |||||||||||||||||||||||||||||||.||....||        |.|....|                  
Sbjct 445  SESKDQDCQEPLKEEEYRKLRDILKQRDNEINILVNMLKKEKKKAQEALHLAGMDRREFRQSQSPPFRLGNPEE  518

Query 493  ------------------------------GMREEMSLGCQEAFEIFKRDHADSVTIDDNKQILKQRFSEAKAL  536
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GQRMRLSSAPSQAQDFSILGKRSSLLHKKIGMREEMSLGCQEAFEIFKRDHADSVTIDDNKQILKQRFSEAKAL  592

Query 537  GESINEARSKIGHLKEEITQRHIQQVALGISENMAVPLMPDQQEEKLRSQLEEEKRRYKTMFTRLKALKVEIEH  610
           |||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GESINEARSKI-----------------GISENMAVPLMPDQQEEKLRSQLEEEKRRYKTMFTRLKALKVEIEH  649

Query 611  LQLLMDKAKVKLQKEFEVWWAEEATNLQVNSPAVNSLDHTKPFLQTSDSQHERSQLLSNKSSGGWEVQDQGTGR  684
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 650  LQLLMDKAKVKLQKEFEVWWAEEATNLQVNSPAVNSLDHTKPFLQTSDSQHEWSQLLSNKSSGGWEVQDQGTGR  723

Query 685  FDVCDVNARKILPSPCPSPHSQKQSSTSTPLEDSIPKRPVSSIPLTGDSQTDSDIIAFIKARQSILQKQCLGSN  758
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724  FDVCDVNARKILPSPCPSPHSQKQSSTSTPLEDSIPKRPVSSIPLTGDSQTDSDIIAFIKARQSILQKQCLGSN  797