Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13426
• Subject: NM_001289021.3
• Aligned Length: 2274
• Identities: 2273
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTGAAGCAGACTATCCAGATATTCGCGAGGGTGAAGCCCCCTGTCCGGAAGCACCAACAAGGGATTTATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGAAGCAGACTATCCAGATATTCGCGAGGGTGAAGCCCCCTGTCCGGAAGCACCAACAAGGGATTTATTC  74

Query   75  CATAGATGAAGATGAAAAATTAATACCTAGCTTGGAAATCATCTTACCACGTGATTTGGCAGATGGGTTTGTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATAGATGAAGATGAAAAATTAATACCTAGCTTGGAAATCATCTTACCACGTGATTTGGCAGATGGGTTTGTGA  148

Query  149  ATAATAAGCGAGAAAGCTACAAATTTAAATTTCAAAGAATTTTTGATCAGGATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAATAAGCGAGAAAGCTACAAATTTAAATTTCAAAGAATTTTTGATCAGGATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT  222

Query  223  GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC  296

Query  297  AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC  370

Query  371  TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAGGACAGCAGCAAAATATATACAACACACATTTCCTATTTGGAAATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAGGACAGCAGCAAAATATATACAACACACATTTCCTATTTGGAAATC  444

Query  445  TACAATGAATGTGGTTATGATCTTTTGGATCCAAGACATGAAGCCTCCAGTTTGGAAGATTTGCCGAAAGTGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACAATGAATGTGGTTATGATCTTTTGGATCCAAGACATGAAGCCTCCAGTTTGGAAGATTTGCCGAAAGTGAC  518

Query  519  AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG  592

Query  593  CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT  666

Query  667  TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA  740

Query  741  TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT  814

Query  815  ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT  888

Query  889  TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC  962

Query  963  ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA  1036

Query 1037  AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA  1110

Query 1111  CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT  1184

Query 1185  GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA  1258

Query 1259  AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC  1332

Query 1333  TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA  1406

Query 1407  ACAGAGAGATAACGAAATCAGTATCCTTTCTGAAGTGATGAAGAAACTTCCTCTATCCTGGTTTGAAAGGGGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACAGAGAGATAACGAAATCAGTATCCTTTCTGAAGTGATGAAGAAACTTCCTCTATCCTGGTTTGAAAGGGGAA  1480

Query 1481  TGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGGACCACGCTGACAGCGTTACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGGACCACGCTGACAGCGTTACC  1554

Query 1555  ATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTGGGAGAAAGTATAAATGAAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTGGGAGAAAGTATAAATGAAGC  1628

Query 1629  AAGAAGTAAAATTGGTCACCTGAAGGAAGAAATCACCCAGCGGCATATACAGCAAGTAGCCCTAGGAATCTCGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGAAGTAAAATTGGTCACCTGAAGGAAGAAATCACCCAGCGGCATATACAGCAAGTAGCCCTAGGAATCTCGG  1702

Query 1703  AAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCACAACTGGAGGAAGAAAAGAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCACAACTGGAGGAAGAAAAGAGA  1776

Query 1777  AGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCACTTGCAGCTGCTCATGGACAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCACTTGCAGCTGCTCATGGACAA  1850

Query 1851  AGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCACCAACCTGCAGGTAAATTCTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCACCAACCTGCAGGTAAATTCTC  1924

Query 1925  CAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCCAGCATGAACGGTCCCAACTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1925  CAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCCAGCATGAATGGTCCCAACTC  1998

Query 1999  CTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGATTCGATGTCTGTGATGTGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGATTCGATGTCTGTGATGTGAA  2072

Query 2073  TGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAGCAGCACCAGCACCCCACTGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAGCAGCACCAGCACCCCACTGG  2146

Query 2147  AAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCCAGACGGACTCGGACATCATC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCCAGACGGACTCGGACATCATC  2220

Query 2221  GCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATGTTTGGGAAGCAAT  2274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATGTTTGGGAAGCAAT  2274