Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13433
• Subject: XM_017011844.1
• Aligned Length: 2586
• Identities: 2409
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCACTCTTCTTGGATCCCTCGTGGAAACTACATAGAATCTAATCGTGATGACTGCACGGTGTCTTTGATCTA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGCTGTGCACCTTAAGAAGTCAGGCTATGTCTTCTTTGAGTACCAGTATGTCGACAACAACATCTTCTTTGAGT  148

Query    1  -----------------------------ATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTACAGACAATGGA  45
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTTATTCAAAATGATCAGTGCCAGGAGATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTACAGACAATGGA  222

Query   46  GAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACAGGCATCCTTAT  119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACAGGCATCCTTAT  296

Query  120  GGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACACATCAGAATGTT  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACACATCAGAATGTT  370

Query  194  TTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCAGAAACACCTAT  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCAGAAACACCTAT  444

Query  268  TCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGATCCAGTGAGTG  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGATCCAGTGAGTG  518

Query  342  TACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGAAGGAAAGACAC  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGAAGGAAAGACAC  592

Query  416  AGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGATTGCCCCCTTCT  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGATTGCCCCCTTCT  666

Query  490  GGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGCCATCCCTGTCC  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGCCATCCCTGTCC  740

Query  564  TCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGCACTTGGCTTTG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGCACTTGGCTTTG  814

Query  638  AATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCAAAGTGCGAT  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCAAAGTGCGAT  888

Query  712  GGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAATGATTACCTGAT  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAATGATTACCTGAT  962

Query  786  CTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGAACTAGGAAGAA  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGAACTAGGAAGAA  1036

Query  860  TAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTAATAGAAAAAGT  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTAATAGAAAAAGT  1110

Query  934  ACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTCAAGAATGCAAC  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTCAAGAATGCAAC  1184

Query 1008  TTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAATGACATGGTGA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAATGACATGGTGA  1258

Query 1082  AGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTGCCCTCGGTTCT  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTGCCCTCGGTTCT  1332

Query 1156  GAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAACCAGTGCAAGGA  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAACCAGTGCAAGGA  1406

Query 1230  ATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATGCGGGCCTGGGA  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATGCGGGCCTGGGA  1480

Query 1304  GTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAATCAGAGTTTG  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAATCAGAGTTTG  1554

Query 1378  CACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAAGGAACAAA  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAAGGAACAAA  1628

Query 1452  ATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATAA  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATAA  1702

Query 1526  CAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCATTTGTATGCCAG  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCATTTGTATGCCAG  1776

Query 1600  TCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATTCTGGCAGATAC  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATTCTGGCAGATAC  1850

Query 1674  ATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCCAGTTCCAACAA  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCCAGTTCCAACAA  1924

Query 1748  GCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATGGCCGATCAACT  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATGGCCGATCAACT  1998

Query 1822  GCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAGTGCCCAGCAGG  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAGTGCCCAGCAGG  2072

Query 1896  TACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACT  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACT  2146

Query 1970  TCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAACCTAAATGGTGC  2043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAACCTAAATGGTGC  2220

Query 2044  ATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTGAAGGTGGGAGC  2117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTGAAGGTGGGAGC  2294

Query 2118  CGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAATCAAAAACTGG  2191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAATCAAAAACTGG  2368

Query 2192  AATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAGACAGTTGTGCT  2265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAGACAGTTGTGCT  2442

Query 2266  ATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGAAAACTCAAATC  2339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGAAAACTCAAATC  2516

Query 2340  TTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCCAAATATA  2409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCCAAATATA  2586