Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13477
- Subject:
- NM_001284350.2
- Aligned Length:
- 1035
- Identities:
- 914
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ----------------------ATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGT-------------------------- 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGATTATTCTAAGTACAATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTT 74
Query 27 ------------------------------------------------------------------------AG 28
||
Sbjct 75 GGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCATTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAG 148
Query 29 GACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTTCCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCA 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTTCCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCA 222
Query 103 GAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACTTCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAA 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACTTCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAA 296
Query 177 GGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTCTATTTTTGGTCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCAT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTCTATTTTTGATCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCAT 370
Query 251 TGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCACAACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCG 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCACAACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCG 444
Query 325 GACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGTACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGTACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGC 518
Query 399 TGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTGAAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAG 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTGAAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAG 592
Query 473 CAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCATGAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTC 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCATGAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTC 666
Query 547 TACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGGTCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACC 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGGTCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACC 740
Query 621 AACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGTCTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAAT 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGTCTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAAT 814
Query 695 TTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAAGAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACA 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAAGAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACA 888
Query 769 GGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGTTTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTT 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGTTTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTT 962
Query 843 TAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATCGATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC 915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATCGATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC 1035