Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13547
Subject:
NM_001353158.1
Aligned Length:
952
Identities:
596
Gaps:
349

Alignment

Query   1  MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKAKIAKCPLRTKTGHILKSTQDTCIGSEKLLQKKPVG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  SETSQAKGEKNGMTFSSTKDLCKQCIDKDCLHIQKEISPATPNMQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  SDKIIWEKHQILDQSR---ETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHF  367
                 ..|..|..|.   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct   1  ------MGHSQLRASQTLEETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSK-----------  57

Query 368  DSLKSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNF  441
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  58  --------------------------------ELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNF  99

Query 442  LRSMTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDI  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100  LRSMTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDI  173

Query 516  LKQKQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHD  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174  LKQKQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHD  247

Query 590  SDEISGKMNTYMNSTTSSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQEL  663
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248  SDEISGKMNTYMNSTT-SKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQEL  320

Query 664  TQDKGASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQM  737
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321  TQDKGASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQM  394

Query 738  ELLHLVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQ  811
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395  ELLHLVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQ  468

Query 812  NTLHLPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKR  885
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469  NTLHLPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKR  542

Query 886  QLFDSDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  949
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543  QLFDSDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  606