Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13548
• Subject: NM_001141947.3
• Aligned Length: 948
• Identities: 829
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKAKIAKCPLRTKTGHILKSTQDTCIGSEKLLQKKPVG  74

Query   1  -------------------------------------------MQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  31
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SETSQAKGEKNGMTFSSTKDLCKQCIDKDCLHIQKEISPATPNMQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  148

Query  32  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  105
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  222

Query 106  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  296

Query 180  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  370

Query 254  KSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  327
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  KSYPGSQSQLFSQSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  444

Query 328  MTALLDPAQIEERDRQRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  401
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  MTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  518

Query 402  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  592

Query 476  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  666

Query 550  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  740

Query 624  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  814

Query 698  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  771
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  888

Query 772  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  831
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  948