Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13548
• Subject: NM_001353149.1
• Aligned Length: 948
• Identities: 822
• Gaps: 124

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKAKIAKCPLRTKTGHILKSTQDTCIGSEKLLQKKPVG  74

Query   1  -------------------------------------------MQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  31
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SETSQAKGEKNGMTFSSTKDLCKQCIDKDCLHIQKEISPATPNMQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  148

Query  32  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  105
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  222

Query 106  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  179
           ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EHQETSKQ-------ENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  289

Query 180  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  363

Query 254  KSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  327
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364  KSYPGSQSQLFSQSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  437

Query 328  MTALLDPAQIEERDRQRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  401
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438  MTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  511

Query 402  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  585

Query 476  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  659

Query 550  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  733

Query 624  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  807

Query 698  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  771
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  881

Query 772  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  831
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  941