Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13548
Subject:
NM_001353150.1
Aligned Length:
948
Identities:
806
Gaps:
140

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKAKIAKCPLRTKTGHILKSTQDTCIGSEKLLQKKPVG  74

Query   1  -------------------------------------------MQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  31
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SETSQAKGEKNGMTFSSTKDLCKQCIDKDCLHIQKEISPATPNMQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  148

Query  32  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  105
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  222

Query 106  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  296

Query 180  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 297  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSK--------------  356

Query 254  KSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  327
                    |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  ---------LFSQSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  421

Query 328  MTALLDPAQIEERDRQRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  401
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422  MTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  495

Query 402  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  569

Query 476  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  643

Query 550  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  717

Query 624  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  791

Query 698  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  771
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  865

Query 772  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  831
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  925