Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13548
Subject:
NM_001353158.1
Aligned Length:
834
Identities:
595
Gaps:
231

Alignment

Query   1  MQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSSLVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSI  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  SNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLNEHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKA  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  QWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSESDKIIWEKHQILDQSR---ETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEEL  219
                                                ..|..|..|.   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------MGHSQLRASQTLEETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEEL  37

Query 220  NKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSLKSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTP  293
           ||||||||||||||||||||                                           |||||||||||
Sbjct  38  NKQIEDDRQRKIEEKIIYSK-------------------------------------------ELADVSSVCTP  68

Query 294  TTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRSMTALLDPAQIEERDRQRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQL  367
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  69  TTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRSMTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQL  142

Query 368  EEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQKQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQK  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  EEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQKQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQK  216

Query 442  GHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDEISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSL  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217  GHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDEISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSL  290

Query 516  MERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDKGASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNIN  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291  MERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDKGASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNIN  364

Query 590  KPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLHLVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKE  663
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365  KPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLHLVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKE  438

Query 664  EEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLHLPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNE  737
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439  EEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLHLPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNE  512

Query 738  IYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFDSDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKE  811
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513  IYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFDSDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKE  586

Query 812  LESSLLPLAENQEESFGSSF  831
           ||||||||||||||||||||
Sbjct 587  LESSLLPLAENQEESFGSSF  606