Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13606
Subject:
XM_006529566.3
Aligned Length:
3333
Identities:
3010
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCTGCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACGA  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACGA  666

Query  667  ATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGGA  740
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGGA  740

Query  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCTA  814

Query  815  TACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGCT  888
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  TACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGCT  888

Query  889  CAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAATT  962
            ||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  889  CAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGTT  962

Query  963  CTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGAA  1036
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  963  CTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGGA  1036

Query 1037  GGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCTA  1110
            |.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037  GAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCTC  1110

Query 1111  TTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCATC  1184
            .||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  CTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCATC  1184

Query 1185  TGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATAT  1258
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1185  TGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATAT  1258

Query 1259  TAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCATG  1332
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCATG  1332

Query 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA  1406

Query 1407  AGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGAATGAAGTCTACCACATTGTTT  1480
            |||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407  AGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGAAACGAAGTCTATCACATCGTTT  1480

Query 1481  TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCCTCTTTCCATGCACACAAAAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1481  TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGCTTCTTTTCATGCCCACAAAAAG  1554

Query 1555  TTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT  1628
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT  1628

Query 1629  TATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATTCAGCATTTAAAAACCAAGACC  1702
            |||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  TATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATTCAGCATTTAAGAATCAAGACC  1702

Query 1703  AGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTACCTGTACATAGCATAATTGCC  1776
            |.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTGCCTGTCCACAGCATCATTGCC  1776

Query 1777  AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAGTGGCCCTACCCTGTCTCTTCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1777  AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAGTGGCCCCACCCTGGCTCTTCC  1850

Query 1851  TACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTTGCAGATACATCATCGATTC  1924
            |.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  TTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTGGCAGATACATCATCAATTC  1924

Query 1925  AAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAATGTCTTCAAACTTAGAG  1998
            |||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1925  AAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAACATCTTCAAATTTAGAG  1998

Query 1999  TATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTTTTGTCATCTCCTTCATGAAAA  2072
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1999  TATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTTTTGTCACCTACTTCAAGAAAA  2072

Query 2073  AGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATGAGGATGCAAAAGCCTATGGAT  2146
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATGAGGACGCAAAAGCCTATGGAT  2146

Query 2147  TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATATAACTTTATTGTTCCTCTCAGG  2220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2147  TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATATAATTTTATTGTACCTCTCAGG  2220

Query 2221  GCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAACCCCCTAGATGACTTACTCAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2221  GCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAACCCCCTAGATGATTTGCTCAG  2294

Query 2295  GTGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATGAGTGCCGAGGAAGACTACA  2368
            ||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295  GTGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATGAGTGCAGAGGAAGACTACA  2368

Query 2369  TGGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGTCTCAGTATTATCACAGAG  2442
            |||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2369  TGGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAGTCTCAGTATCATCACTGAG  2442

Query 2443  CTAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACTCTCTTGCTCTTTCAAAACT  2516
            ||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2443  CTTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACTCTCTCGCGCTTTCAAAACT  2516

Query 2517  GGAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGT  2590
            |||||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2517  GGAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCGGGAAGAGTGT  2590

Query 2591  TTAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATATGATTTCTATCACGAGACTT  2664
            |.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2591  TCAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATATGATTTCTATCACCAGACTT  2664

Query 2665  CTGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGCAGATGACTTATGGAT  2738
            ||.||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 2665  CTTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGAAGATGACTTGTGGAT  2738

Query 2739  CAGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATTGGAATCTACAGGACTG  2812
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 2739  CAGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATCGGGATCTACAGAACAG  2812

Query 2813  AGTCTCAGAAACTTACTACATCTGAGTCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGACTCC  2886
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||...|
Sbjct 2813  AATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGATGTC  2886

Query 2887  AAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCG  2960
            |||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCG  2960

Query 2961  GAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTCTGGTAAAACAGCTGAAAAAA  3034
            |||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2961  GAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTCTGGTAAAACTGCAGAAAAAA  3034

Query 3035  TAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAATAGAATG  3108
            ||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3035  TAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAACAGAATG  3108

Query 3109  AAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGTACCCTCTCCTACATCCTGAT  3182
            ||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3109  AAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGCACCCTGTCCTACATCCTGAT  3182

Query 3183  TAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCGACCAGATCCACTGGCCTACC  3256
            |||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 3183  TAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCGACCAGATCCACTGTCCTACC  3256

Query 3257  TTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAA  3330
            |||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAA  3330

Query 3331  CTC  3333
            |||
Sbjct 3331  CTC  3333