Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13606
- Subject:
- XM_006529566.3
- Aligned Length:
- 3333
- Identities:
- 3010
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA 74
Query 75 AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT 148
|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct 75 AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC 148
Query 149 TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC 222
|.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct 149 TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC 222
Query 223 TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA 296
||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 223 TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA 296
Query 297 CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT 370
|.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 297 CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT 370
Query 371 ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT 444
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC 444
Query 445 CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC 518
||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 445 CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC 518
Query 519 CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC 592
Query 593 AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCTGCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACGA 666
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 593 AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACGA 666
Query 667 ATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGGA 740
||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 ATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGGA 740
Query 741 TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 741 TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCTA 814
Query 815 TACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGCT 888
||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 815 TACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGCT 888
Query 889 CAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAATT 962
||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 889 CAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGTT 962
Query 963 CTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGAA 1036
||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 963 CTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGGA 1036
Query 1037 GGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCTA 1110
|.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037 GAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCTC 1110
Query 1111 TTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCATC 1184
.||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111 CTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCATC 1184
Query 1185 TGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATAT 1258
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1185 TGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATAT 1258
Query 1259 TAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCATG 1332
||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 TAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCATG 1332
Query 1333 TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA 1406
Query 1407 AGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGAATGAAGTCTACCACATTGTTT 1480
|||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407 AGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGAAACGAAGTCTATCACATCGTTT 1480
Query 1481 TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCCTCTTTCCATGCACACAAAAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1481 TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGCTTCTTTTCATGCCCACAAAAAG 1554
Query 1555 TTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT 1628
|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT 1628
Query 1629 TATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATTCAGCATTTAAAAACCAAGACC 1702
|||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629 TATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATTCAGCATTTAAGAATCAAGACC 1702
Query 1703 AGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTACCTGTACATAGCATAATTGCC 1776
|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1703 AACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTGCCTGTCCACAGCATCATTGCC 1776
Query 1777 AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAGTGGCCCTACCCTGTCTCTTCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1777 AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAGTGGCCCCACCCTGGCTCTTCC 1850
Query 1851 TACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTTGCAGATACATCATCGATTC 1924
|.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1851 TTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTGGCAGATACATCATCAATTC 1924
Query 1925 AAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAATGTCTTCAAACTTAGAG 1998
|||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1925 AAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAACATCTTCAAATTTAGAG 1998
Query 1999 TATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTTTTGTCATCTCCTTCATGAAAA 2072
|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1999 TATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTTTTGTCACCTACTTCAAGAAAA 2072
Query 2073 AGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATGAGGATGCAAAAGCCTATGGAT 2146
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATGAGGACGCAAAAGCCTATGGAT 2146
Query 2147 TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATATAACTTTATTGTTCCTCTCAGG 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2147 TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATATAATTTTATTGTACCTCTCAGG 2220
Query 2221 GCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAACCCCCTAGATGACTTACTCAG 2294
||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2221 GCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAACCCCCTAGATGATTTGCTCAG 2294
Query 2295 GTGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATGAGTGCCGAGGAAGACTACA 2368
||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 GTGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATGAGTGCAGAGGAAGACTACA 2368
Query 2369 TGGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGTCTCAGTATTATCACAGAG 2442
|||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2369 TGGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAGTCTCAGTATCATCACTGAG 2442
Query 2443 CTAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACTCTCTTGCTCTTTCAAAACT 2516
||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2443 CTTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACTCTCTCGCGCTTTCAAAACT 2516
Query 2517 GGAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGT 2590
|||||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2517 GGAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCGGGAAGAGTGT 2590
Query 2591 TTAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATATGATTTCTATCACGAGACTT 2664
|.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2591 TCAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATATGATTTCTATCACCAGACTT 2664
Query 2665 CTGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGCAGATGACTTATGGAT 2738
||.||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 2665 CTTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGAAGATGACTTGTGGAT 2738
Query 2739 CAGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATTGGAATCTACAGGACTG 2812
||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 2739 CAGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATCGGGATCTACAGAACAG 2812
Query 2813 AGTCTCAGAAACTTACTACATCTGAGTCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGACTCC 2886
|.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||...|
Sbjct 2813 AATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGATGTC 2886
Query 2887 AAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCG 2960
|||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCG 2960
Query 2961 GAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTCTGGTAAAACAGCTGAAAAAA 3034
|||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2961 GAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTCTGGTAAAACTGCAGAAAAAA 3034
Query 3035 TAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAATAGAATG 3108
||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3035 TAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAACAGAATG 3108
Query 3109 AAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGTACCCTCTCCTACATCCTGAT 3182
||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3109 AAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGCACCCTGTCCTACATCCTGAT 3182
Query 3183 TAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCGACCAGATCCACTGGCCTACC 3256
|||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 3183 TAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCGACCAGATCCACTGTCCTACC 3256
Query 3257 TTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAA 3330
|||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAA 3330
Query 3331 CTC 3333
|||
Sbjct 3331 CTC 3333