Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13606
• Subject: XM_006529567.1
• Aligned Length: 3501
• Identities: 2843
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCT-----------------------------  637
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|                             
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGTTTTACAGACAAAACAAGAAAGCACATG  666

Query  638  ----------------------------------------------GCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACG  665
                                                          |||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  TATCATGTGACTTTGGGATTTACTGAAACTTTGACATTTTCTCAAAGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACG  740

Query  666  AATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGG  739
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGG  814

Query  740  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCC  813
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  815  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCT  888

Query  814  ATACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGC  887
            |||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  ATACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGC  962

Query  888  TCAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAAT  961
            |||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  963  TCAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGT  1036

Query  962  TCTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGA  1035
            |||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TCTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGG  1110

Query 1036  AGGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCT  1109
            ||.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  AGAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCT  1184

Query 1110  ATTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCAT  1183
            ..||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CCTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCAT  1258

Query 1184  CTGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATA  1257
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1259  CTGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATA  1332

Query 1258  TTAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCAT  1331
            |||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|                                     
Sbjct 1333  TTAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAG-------------------------------------  1369

Query 1332  GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAG  1405
                                                                                    ||
Sbjct 1370  ------------------------------------------------------------------------AG  1371

Query 1406  AAGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGAATGAAGTCTACCACATTGTT  1479
            ||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1372  AAGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGAAACGAAGTCTATCACATCGTT  1445

Query 1480  TTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCCTCTTTCCATGCACACAAAAA  1553
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1446  TTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGCTTCTTTTCATGCCCACAAAAA  1519

Query 1554  GTTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACA  1627
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 1520  --------------------------------------------------------------GTCCTCGATACA  1531

Query 1628  TTATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATTCAGCATTTAAAAACCAAGAC  1701
            ||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1532  TTATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATTCAGCATTTAAGAATCAAGAC  1605

Query 1702  CAGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTACCTGTACATAGCATAATTGC  1775
            ||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1606  CAACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTGCCTGTCCACAGCATCATTGC  1679

Query 1776  CAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAGTGGCCCTACCCTGTCTCTTC  1849
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1680  CAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAGTGGCCCCACCCTGGCTCTTC  1753

Query 1850  CTACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTTGCAGATACATCATCGATT  1923
            ||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1754  CTTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTGGCAGATACATCATCAATT  1827

Query 1924  CAAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAATGTCTTCAAACTTAGA  1997
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||
Sbjct 1828  CAAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAACATCTTCAAATTTAGA  1901

Query 1998  GTATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTTTTGTCATCTCCTTCATGAAA  2071
            ||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1902  GTATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTTTTGTCACCTACTTCAAGAAA  1975

Query 2072  AAGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATGAGGATGCAAAAGCCTATGGA  2145
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1976  AAGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATGAGGACGCAAAAGCCTATGGA  2049

Query 2146  TTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATATAACTTTATTGTTCCTCTCAG  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2050  TTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATATAATTTTATTGTACCTCTCAG  2123

Query 2220  GGCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAACCC-----------------  2276
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||                 
Sbjct 2124  GGCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAACCCGCCAGATATGCATTTTC  2197

Query 2277  -------------------------------------------------------CCTAGATGACTTACTCAGG  2295
                                                                   |||||||||.||.||||||
Sbjct 2198  TGGATGCAATCTGTTGGTTTCCAATGGTTTACTACATGGTGGGCTCTATTGACAACCTAGATGATTTGCTCAGG  2271

Query 2296  TGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATGAGTGCCGAGGAAGACTACAT  2369
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2272  TGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATGAGTGCAGAGGAAGACTACAT  2345

Query 2370  GGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGTCTCAGTATTATCACAGAGC  2443
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2346  GGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAGTCTCAGTATCATCACTGAGC  2419

Query 2444  TAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACTCTCTTGCTCTTTCAAAACTG  2517
            |.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2420  TTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACTCTCTCGCGCTTTCAAAACTG  2493

Query 2518  GAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGTT  2591
            ||||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2494  GAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCGGGAAGAGTGTT  2567

Query 2592  TAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATATGATTTCTATCACGAGACTTC  2665
            .||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2568  CAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATATGATTTCTATCACCAGACTTC  2641

Query 2666  TGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGCAGATGACTTATGGATC  2739
            |.||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 2642  TTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGAAGATGACTTGTGGATC  2715

Query 2740  AGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATTGGAATCTACAGGACTGA  2813
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 2716  AGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATCGGGATCTACAGAACAGA  2789

Query 2814  GTCTCAGAAACTTACTACATCTGAG---------------------TCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGT  2866
            .|||||||||||.||.|||||||||                     |||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2790  ATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCGAGAAATAGGATCTCAATCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGT  2863

Query 2867  GGGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAG  2940
            ||||||||||||||||...||||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2864  GGGAAGACACCAAAGATGTCAAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAG  2937

Query 2941  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTC  3014
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2938  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTC  3011

Query 3015  TGGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTG  3088
            |||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3012  TGGTAAAACTGCAGAAAAAATAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTG  3085

Query 3089  AACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGT  3162
            |||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 3086  AACTTGTGAAAAACAGAATGAAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGC  3159

Query 3163  ACCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCG  3236
            |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 3160  ACCCTGTCCTACATCCTGATTAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCG  3233

Query 3237  ACCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAG  3310
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.|||||
Sbjct 3234  ACCAGATCCACTGTCCTACCTTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAG  3307

Query 3311  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3333
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3308  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3330