Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13606
• Subject: XM_011247997.1
• Aligned Length: 3501
• Identities: 2879
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCT-----------------------------  637
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|                             
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGTTTTACAGACAAAACAAGAAAGCACATG  666

Query  638  ----------------------------------------------GCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACG  665
                                                          |||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  TATCATGTGACTTTGGGATTTACTGAAACTTTGACATTTTCTCAAAGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACG  740

Query  666  AATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGG  739
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGG  814

Query  740  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCC  813
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  815  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCT  888

Query  814  ATACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGC  887
            |||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  ATACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGC  962

Query  888  TCAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAAT  961
            |||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  963  TCAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGT  1036

Query  962  TCTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGA  1035
            |||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TCTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGG  1110

Query 1036  AGGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCT  1109
            ||.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  AGAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCT  1184

Query 1110  ATTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCAT  1183
            ..||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CCTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCAT  1258

Query 1184  CTGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATA  1257
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1259  CTGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATA  1332

Query 1258  TTAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCAT  1331
            |||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  TTAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCAT  1406

Query 1332  GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAG  1405
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1407  GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGC---  1477

Query 1406  AAGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGAATGAAGTCTACCACATTGTT  1479
                                                                                      
Sbjct 1478  --------------------------------------------------------------------------  1477

Query 1480  TTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCCTCTTTCCATGCACACAAAAA  1553
                                                                                     |
Sbjct 1478  -------------------------------------------------------------------------A  1478

Query 1554  GTTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACA  1627
            ||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  GTTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACA  1552

Query 1628  TTATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATTCAGCATTTAAAAACCAAGAC  1701
            ||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1553  TTATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATTCAGCATTTAAGAATCAAGAC  1626

Query 1702  CAGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTACCTGTACATAGCATAATTGC  1775
            ||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1627  CAACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTGCCTGTCCACAGCATCATTGC  1700

Query 1776  CAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAGTGGCCCTACCCTGTCTCTTC  1849
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1701  CAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAGTGGCCCCACCCTGGCTCTTC  1774

Query 1850  CTACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTTGCAGATACATCATCGATT  1923
            ||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1775  CTTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTGGCAGATACATCATCAATT  1848

Query 1924  CAAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAATGTCTTCAAACTTAGA  1997
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||
Sbjct 1849  CAAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAACATCTTCAAATTTAGA  1922

Query 1998  GTATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTTTTGTCATCTCCTTCATGAAA  2071
            ||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1923  GTATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTTTTGTCACCTACTTCAAGAAA  1996

Query 2072  AAGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATGAGGATGCAAAAGCCTATGGA  2145
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1997  AAGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATGAGGACGCAAAAGCCTATGGA  2070

Query 2146  TTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATATAACTTTATTGTTCCTCTCAG  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2071  TTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATATAATTTTATTGTACCTCTCAG  2144

Query 2220  GGCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAACCC-----------------  2276
            |||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||                 
Sbjct 2145  GGCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAACCCGCCAGATATGCATTTTC  2218

Query 2277  -------------------------------------------------------CCTAGATGACTTACTCAGG  2295
                                                                   |||||||||.||.||||||
Sbjct 2219  TGGATGCAATCTGTTGGTTTCCAATGGTTTACTACATGGTGGGCTCTATTGACAACCTAGATGATTTGCTCAGG  2292

Query 2296  TGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATGAGTGCCGAGGAAGACTACAT  2369
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2293  TGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATGAGTGCAGAGGAAGACTACAT  2366

Query 2370  GGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGTCTCAGTATTATCACAGAGC  2443
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2367  GGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAGTCTCAGTATCATCACTGAGC  2440

Query 2444  TAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACTCTCTTGCTCTTTCAAAACTG  2517
            |.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2441  TTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACTCTCTCGCGCTTTCAAAACTG  2514

Query 2518  GAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGTT  2591
            ||||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2515  GAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCGGGAAGAGTGTT  2588

Query 2592  TAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATATGATTTCTATCACGAGACTTC  2665
            .||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2589  CAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATATGATTTCTATCACCAGACTTC  2662

Query 2666  TGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGCAGATGACTTATGGATC  2739
            |.||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 2663  TTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGAAGATGACTTGTGGATC  2736

Query 2740  AGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATTGGAATCTACAGGACTGA  2813
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 2737  AGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATCGGGATCTACAGAACAGA  2810

Query 2814  GTCTCAGAAACTTACTACATCTGAG---------------------TCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGT  2866
            .|||||||||||.||.|||||||||                     |||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2811  ATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCGAGAAATAGGATCTCAATCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGT  2884

Query 2867  GGGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAG  2940
            ||||||||||||||||...||||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2885  GGGAAGACACCAAAGATGTCAAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAG  2958

Query 2941  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTC  3014
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2959  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTC  3032

Query 3015  TGGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTG  3088
            |||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3033  TGGTAAAACTGCAGAAAAAATAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTG  3106

Query 3089  AACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGT  3162
            |||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 3107  AACTTGTGAAAAACAGAATGAAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGC  3180

Query 3163  ACCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCG  3236
            |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 3181  ACCCTGTCCTACATCCTGATTAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCG  3254

Query 3237  ACCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAG  3310
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.|||||
Sbjct 3255  ACCAGATCCACTGTCCTACCTTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAG  3328

Query 3311  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3333
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3329  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3351