Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13606
- Subject:
- XM_011247999.2
- Aligned Length:
- 3429
- Identities:
- 2065
- Gaps:
- 1152
Alignment
Query 1 ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA 74
Query 75 AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT 148
|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct 75 AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC 148
Query 149 TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC 222
|.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct 149 TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC 222
Query 223 TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA 296
||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 223 TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA 296
Query 297 CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT 370
|.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 297 CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT 370
Query 371 ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT 444
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC 444
Query 445 CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC 518
||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 445 CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC 518
Query 519 CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC 592
Query 593 AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCT----------------------------- 637
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGTTTTACAGACAAAACAAGAAAGCACATG 666
Query 638 ----------------------------------------------GCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACG 665
|||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 667 TATCATGTGACTTTGGGATTTACTGAAACTTTGACATTTTCTCAAAGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACG 740
Query 666 AATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGG 739
|||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 AATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGG 814
Query 740 ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCC 813
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.
Sbjct 815 ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCT 888
Query 814 ATACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGC 887
|||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 889 ATACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGC 962
Query 888 TCAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAAT 961
|||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 963 TCAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGT 1036
Query 962 TCTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGA 1035
|||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 TCTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGG 1110
Query 1036 AGGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCT 1109
||.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111 AGAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCT 1184
Query 1110 ATTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCAT 1183
..||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 CCTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCAT 1258
Query 1184 CTGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATA 1257
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1259 CTGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATA 1332
Query 1258 TTAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCAT 1331
|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 TTAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCAT 1406
Query 1332 GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCA-- 1403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAGT 1480
Query 1404 -------------------AGAAGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGG 1458
||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.
Sbjct 1481 GTGTGTGCTTGTGTTGCAGAGAAGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGA 1554
Query 1459 AATGAAGTCTACCACATTGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGC 1532
||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1555 AACGAAGTCTATCACATCGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGC 1628
Query 1533 CTCTTTCCATGCACACAAAAAGTTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGC 1606
.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTCTTTTCATGCCCACAAAAAGTTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGC 1702
Query 1607 TGAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAAT 1680
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 TGAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAAT 1776
Query 1681 TCAGCATTTAAAAACCAAGACCAGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATT 1754
|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 TCAGCATTTAAGAATCAAGACCAACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATT 1850
Query 1755 ACCTGTACATAGCATAATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAA 1828
.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct 1851 GCCTGTCCACAGCATCATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAA 1924
Query 1829 GTGGCCCTACCCTGTCTCTTCCTACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAG 1902
|||||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GTGGCCCCACCCTGGCTCTTCCTTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAG 1998
Query 1903 GTTGCAGATACATCATCGATTCAAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGA 1976
||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGGCAGATACATCATCAATTCAAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGA 2072
Query 1977 AGAAATGTCTTCAAACTTAGAGTATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTT 2050
|||||..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2073 AGAAACATCTTCAAATTTAGAGTATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTT 2146
Query 2051 TTTGTCATCTCCTTCATGAAAAAGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTAT 2124
|||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2147 TTTGTCACCTACTTCAAGAAAAAGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTAT 2220
Query 2125 GAGGATGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATA 2198
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2221 GAGGACGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATA 2294
Query 2199 TAACTTTATTGTTCCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATA 2272
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 TAATTTTATTGTACCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATA 2368
Query 2273 ACCCCCTAGATGACTTACTCAGGTGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACC 2346
||||.
Sbjct 2369 ACCCA--------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2347 ATGAGTGCCGAGGAAGACTACATGGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTC 2420
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2421 CAGTCTCAGTATTATCACAGAGCTAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTT 2494
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2495 ACTCTCTTGCTCTTTCAAAACTGGAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTG 2568
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2569 CCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGTTTAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTA 2642
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2643 TATGATTTCTATCACGAGACTTCTGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAA 2716
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2717 TCACTGCAGATGACTTATGGATCAGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTT 2790
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2791 CCCATTGGAATCTACAGGACTGAGTCTCAGAAACTTACTACATCTGAGTCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGA 2864
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2865 GTGGGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACC 2938
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 2939 AGTCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACAC 3012
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 3013 TCTGGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGC 3086
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 3087 TGAACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAA 3160
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 3161 GTACCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATT 3234
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 3235 CGACCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCA 3308
Sbjct 2374 -------------------------------------------------------------------------- 2373
Query 3309 AGATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC 3333
Sbjct 2374 ------------------------- 2373
