Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13606
• Subject: XM_017320509.1
• Aligned Length: 3447
• Identities: 3010
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCTGCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACGA  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACGA  666

Query  667  ATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGGA  740
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGGA  740

Query  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCTA  814

Query  815  TACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGCT  888
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  TACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGCT  888

Query  889  CAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAATT  962
            ||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  889  CAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGTT  962

Query  963  CTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGAA  1036
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  963  CTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGGA  1036

Query 1037  GGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCTA  1110
            |.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037  GAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCTC  1110

Query 1111  TTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCATC  1184
            .||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  CTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCATC  1184

Query 1185  TGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATAT  1258
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1185  TGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATAT  1258

Query 1259  TAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCATG  1332
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCATG  1332

Query 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCA---  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAGTG  1406

Query 1404  ------------------AGAAGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGA  1459
                              ||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1407  TGTGTGCTTGTGTTGCAGAGAAGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGAA  1480

Query 1460  ATGAAGTCTACCACATTGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCC  1533
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481  ACGAAGTCTATCACATCGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGCT  1554

Query 1534  TCTTTCCATGCACACAAAAAGTTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCT  1607
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTTTTCATGCCCACAAAAAGTTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCT  1628

Query 1608  GAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATT  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATT  1702

Query 1682  CAGCATTTAAAAACCAAGACCAGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTA  1755
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1703  CAGCATTTAAGAATCAAGACCAACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTG  1776

Query 1756  CCTGTACATAGCATAATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAG  1829
            |||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||
Sbjct 1777  CCTGTCCACAGCATCATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAG  1850

Query 1830  TGGCCCTACCCTGTCTCTTCCTACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGG  1903
            ||||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGCCCCACCCTGGCTCTTCCTTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGG  1924

Query 1904  TTGCAGATACATCATCGATTCAAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAA  1977
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGCAGATACATCATCAATTCAAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAA  1998

Query 1978  GAAATGTCTTCAAACTTAGAGTATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTT  2051
            ||||..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999  GAAACATCTTCAAATTTAGAGTATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTT  2072

Query 2052  TTGTCATCTCCTTCATGAAAAAGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATG  2125
            ||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2073  TTGTCACCTACTTCAAGAAAAAGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATG  2146

Query 2126  AGGATGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATAT  2199
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2147  AGGACGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATAT  2220

Query 2200  AACTTTATTGTTCCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAA  2273
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2221  AATTTTATTGTACCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAA  2294

Query 2274  CCC-----------------------------------------------------------------------  2276
            |||                                                                       
Sbjct 2295  CCCGCCAGATATGCATTTTCTGGATGCAATCTGTTGGTTTCCAATGGTTTACTACATGGTGGGCTCTATTGACA  2368

Query 2277  -CCTAGATGACTTACTCAGGTGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATG  2349
             |||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 2369  ACCTAGATGATTTGCTCAGGTGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATG  2442

Query 2350  AGTGCCGAGGAAGACTACATGGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAG  2423
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 2443  AGTGCAGAGGAAGACTACATGGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAG  2516

Query 2424  TCTCAGTATTATCACAGAGCTAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACT  2497
            |||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2517  TCTCAGTATCATCACTGAGCTTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACT  2590

Query 2498  CTCTTGCTCTTTCAAAACTGGAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCT  2571
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTCTCGCGCTTTCAAAACTGGAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCT  2664

Query 2572  TTTGCTGCTGGGAGGGTGTTTAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATAT  2645
            ||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2665  TTTGCTGCGGGAAGAGTGTTCAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATAT  2738

Query 2646  GATTTCTATCACGAGACTTCTGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCA  2719
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GATTTCTATCACCAGACTTCTTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCA  2812

Query 2720  CTGCAGATGACTTATGGATCAGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCC  2793
            |||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGAAGATGACTTGTGGATCAGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCC  2886

Query 2794  ATTGGAATCTACAGGACTGAGTCTCAGAAACTTACTACATCTGAG---------------------TCTCAAAT  2846
            ||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||                     ||||||||
Sbjct 2887  ATCGGGATCTACAGAACAGAATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCGAGAAATAGGATCTCAATCTCAAAT  2960

Query 2847  ATCTATCAGTGTAGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCA  2920
            |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||...||||||.|.||||||||||||||||...|||||||
Sbjct 2961  ATCCATTAGTGTGGAAGAGTGGGAAGACACCAAAGATGTCAAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCA  3034

Query 2921  ACTCAACATCCAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGC  2994
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3035  ACTCAACGTCTAGTGACCAGTCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGC  3108

Query 2995  AGAAAAGGCCCAAAACACTCTGGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTC  3068
            ||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 3109  AGAAAAGGGCCGAAGCACTCTGGTAAAACTGCAGAAAAAATAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATC  3182

Query 3069  AGAAAGACAAGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATG  3142
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 3183  CGAAAGACAGGAGCTTGCTGAACTTGTGAAAAACAGAATGAAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATG  3256

Query 3143  AAATGAATGATCATCAAAGTACCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAAT  3216
            ||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..|.|||||||||
Sbjct 3257  AAATGAATGATCATCAGAGCACCCTGTCCTACATCCTGATTAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAAT  3330

Query 3217  GATGTTGTATACTTAATTCGACCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCAT  3290
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||
Sbjct 3331  GATGTTGTATATTTGATCCGACCAGATCCACTGTCCTACCTTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCAT  3404

Query 3291  CTGCAATGTCACTGGTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3333
            ||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  CTGCAATGCCGCTGTTCAAGATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3447