Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13846
- Subject:
- NM_144491.2
- Aligned Length:
- 1328
- Identities:
- 928
- Gaps:
- 253
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGCTGGTTGTGTCCGAGACTGCGGAGCCAGGAAGCCGAGTCGGCCCTGGCAGAGGTCGCATCTCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGGGCGACTGGCCAATCAGATCCCCCCTGAGGTCCTGAACAACCCCCAGTTACAGGCTGCTGTCCAAGTTCTGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTTCTAACTACAACTTTGAGATCCCCAAAACCATCTGGAGAATCCAGCAGGCCCAGGCCAAGAAGGTGGCCTTA 222
Query 1 ---ATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTTCACGGAGGCCGAAGT 71
|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 223 CAAATGCCAGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGCACTATTGTGGATATCTTGGAAAGGTTCACAGAGGCTGAGGT 296
Query 72 GATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGGCCCTGGGAGCTGACT 145
|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||.|||||
Sbjct 297 GATGGTGATGGGTGATGTCACCTATGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACTGCAAGGGCCTTGGGAGTTGACT 370
Query 146 TCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTCCGGGTGCTGTACGTC 219
||.||||||||||.||.|||||.||.||..|.||||||||||||||.|..|||||||||||.||..||||.|||
Sbjct 371 TCCTGGTGCACTATGGTCACAGCTGTCTAGTCCCCATGGACACCTCCGTTCAAGACTTCCGAGTCTTGTATGTC 444
Query 220 TTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCCCCCAGCCA-CTGCCC 292
||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||..||||||||||||||.||||||.|| || |.|
Sbjct 445 TTCGTGGATATCCGGATAGACACTGCCCACCTTCTGGACTCGGTCCGCCTCACCTTTACCCCAGGCAGCT-CAC 517
Query 293 TTGCCCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGAAAGCCGAGTATCGT 366
|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||..
Sbjct 518 TCGCTCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCAACCTTACAGGCAGCTGCACAGGAGCTGAAAGCTGATTATCAC 591
Query 367 GTGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCCCGACTGTCCAAAGA 440
.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 592 ATCAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGGGAGATCCTAGGCTGCACATCCCCTCGGCTATCCAAGGA 665
Query 441 GGTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCCAATGTCC 514
.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|
Sbjct 666 AGTGGAAGCTGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTTCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCTAATATAC 739
Query 515 CCGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGCGCATGCAGGCTGCT 588
|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||..||
Sbjct 740 CTGCTTACCGGTATGACCCATATGGCAAAGTCCTATCCAGAGAATACTATGACCATCAGCGCATGCAGGCCACT 813
Query 589 CGCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACTTTGGGCCGCCAGGG 662
|||||.||||||||.||..||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 814 CGCCAGGAAGCCATTGCTGCTGCACGCTCAGCCAAATCCTGGGGCCTTATTCTGGGAACCTTGGGCCGCCAGGG 887
Query 663 CAGTCCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTT-GTGAGGCTGCTGCTC 735
||||||.|||||||||||||||.|||||||||..|||.||..||||||.| ||||||| |||||||||.|||||
Sbjct 888 CAGTCCCAAGATCCTGGAGCACTTGGAATCTCAGCTCAGAAACTTGGGAC-TTCCTTTCGTGAGGCTGTTGCTC 960
Query 736 TCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCCGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGTCT 809
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 961 TCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTCAGTCTACTTCCTGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGCCT 1034
Query 810 CTCCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTGGCTCTGAGGGACA 883
|||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||.|||||
Sbjct 1035 CTCCATTGACTGGGGTTCAGCCTTTCCCAAGCCACTGCTGACACCGTACGAGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGACA 1108
Query 884 TTTCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGACGGTGAACCACGGC 957
||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.
Sbjct 1109 TTTCTTGGCAGCAACCCTACCCCATGGACTTCTACTCTGGCAGCTCCTTAGGGCCATGGACAGTGAACTACGGT 1182
Query 958 CAGGACCGCCGTCCCCA-CGCCCCGG-------GCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCC----GC 1019
|.|||||| | |.||.||| |||.|||.||....|..|||||||||.|.|||||| ||
Sbjct 1183 CGGGACCG--------AGCACCTCGGGGTCTCTGCCAGCCTGCATCTGACAAGGTGCAGCAAGGGTCCAGAGGC 1248
Query 1020 GCGTCCCCCTTCGGCCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT 1089
| .|.||.|.|||...||.||.|||...||||.||||...|||.||||||...|..|||.||||||.
Sbjct 1249 G----GCTCTCCAGCCCCAGCCTGTGAGAGTTGCAACTGCGCAGACCAGAAGGCTACTTCGCCGGCTCCC 1314