Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13887
- Subject:
- NM_008449.2
- Aligned Length:
- 2874
- Identities:
- 1929
- Gaps:
- 705
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGATCCAGCCGAATGCAGCATCAAAGTGATGTGCCGGTTCCGGCCCCTCAACGAAGCGGAGATCCTCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGGGACAAATTCATCCCCAAATTCAAAGGCGAGGAGACGGTGGTGATCGGGCAAGGGAAGCCGTATGTCTTTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACCGAGTGCTGCCGCCCAACACAACCCAGGAGCAGGTCTACAATGCCTGTGCAAAGCAGATTGTCAAAGATGTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTTGAGGGTTATAATGGAACAATTTTTGCATATGGGCAGACTTCATCAGGAAAAACTCATACCATGGAGGGGAA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GTTACATGATCCTCAGCTTATGGGTATCATTCCAAGGATTGCACATGATATTTTTGATCACATCTATTCCATGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ACGAGAACCTGGAGTTTCATATCAAGGTTTCCTATTTTGAGATCTACTTGGACAAAATAAGGGACTTGCTTGAT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GTGTCCAAGACCAACTTGGCAGTTCATGAAGACAAAAACAGAGTCCCCTATGTAAAGGGGTGCACCGAGAGGTT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TGTGTCAAGCCCGGAGGAGGTCATGGATGTGATCGATGAGGGCAAAGCAAACCGACACGTGGCTGTGACAAACA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TGAACGAACACAGCTCTAGGAGTCACAGTATCTTCCTGATTAACATTAAGCAAGAGAATGTGGAGACTGAAAAA 666
Query 1 ------------------------------ATGGC---CACTTACATCCACGTCAGCAAAACTGGTGCCGAGGG 41
.|||| .|.|.|.| |.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AAACTCAGCGGGAAGCTGTATTTGGTTGATTTGGCTGGGAGTGAAA---AGGTCAGCAAAACCGGTGCCGAGGG 737
Query 42 AGCTGTTCTTGACGAAGCTAAAAATATCAATAAGTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATCTCTGCTTTGGCAG 115
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 738 AGCTGTTCTTGATGAAGCTAAAAATATCAACAAGTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATTTCTGCCTTGGCAG 811
Query 116 AAGGGACAAAAACACATGTGCCATACCGGGACAGCAAGATGACTCGGATTCTTCAGGACTCTTTGGGTGGGAAC 189
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 812 AAGGGACAAAAACACATGTACCGTACCGGGACAGCAAGATGACTCGGATTCTCCAGGACTCTCTGGGTGGGAAC 885
Query 190 TGCAGAACCACCATCGTCATTTGCTGTTCTCCTTCTGTCTTCAATGAGGCTGAGACCAAGTCCACACTGATGTT 263
||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 886 TGTAGGACCACCATTGTCATTTGCTGTTCTCCTTCAGTCTTCAATGAAGCCGAGACCAAGTCCACGCTGATGTT 959
Query 264 CGGACAGAGAGCTAAGACCATCAAGAATACAGTCTCTGTGAACCTAGAACTGACAGCAGAAGAATGGAAGAAGA 337
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 960 TGGACAGAGAGCAAAGACCATCAAGAATACAGTCTCTGTGAACTTGGAACTAACAGCAGAAGAGTGGAAGAAGA 1033
Query 338 AATATGAAAAAGAGAAAGAGAAAAACAAGACTTTGAAGAATGTTATCCAGCATCTGGAGATGGAGCTAAACAGG 411
||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1034 AATATGAAAAAGAGAAAGAGAAGAACAAGGCCTTGAAGAGTGTCCTCCAGCATCTGGAGATGGAGCTGAACAGG 1107
Query 412 TGGAGGAATGGAGAAGCTGTGCCTGAGGATGAACAGATCAGTGCCAAGGACCAGAAGAACCTGGAGCCTTGTGA 485
||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.|||||.|||||
Sbjct 1108 TGGAGGAACGGGGAAGCTGTACCCGAGGACGAACAGATCAGCGCCAAGGACCAGAAGAGCCTAGAGCCCTGTGA 1181
Query 486 TAACACCCCCATCATAGACAATATTGCTCCTGTTGTTGCTGGCATCTCTACAGAGGAGAAAGAGAAGTACGATG 559
.|||||.||||||||||||||.||..|.||||||||.|..||||||||| |..|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1182 CAACACACCCATCATAGACAACATCACGCCTGTTGTGGACGGCATCTCT---GCCGAGAAGGAGAAGTATGACG 1252
Query 560 AGGAGATCTCCAGTCTCTACAGACAACTGGATGACAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGCTGAA 633
||||||||.|||||.|.|||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 AGGAGATCACCAGTTTGTACCGACAGCTCGATGATAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGCTGAA 1326
Query 634 AAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAGCTTTTAGCTTCCACAAGAAGAGACTATGAGAAGATACAGGA 707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1327 AAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAGCTCCTGGCTTCCACGAGAAGGGACTATGAGAAGATCCAGGA 1400
Query 708 GGAGCTGACACGTCTCCAGATTGAAAATGAGGCAGCCAAGGATGAGGTGAAAGAAGTTCTCCAGGCCCTGGAGG 781
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1401 GGAGCTGACACGCCTCCAGATCGAAAATGAGGCAGCTAAAGACGAAGTGAAAGAAGTCCTCCAGGCCCTGGAGG 1474
Query 782 AGCTGGCTGTCAATTATGACCAGAAATCACAGGAAGTGGAGGATAAGACCCGGGCCAATGAGCAGCTGACAGAC 855
||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1475 AGCTGGCTGTCAATTACGACCAGAAGTCACAAGAAGTGGAGGACAAGACCAGGGCCAACGAGCAACTGACTGAT 1548
Query 856 GAGCTGGCCCAGAAAACGACTACATTGACAACCACACAGAGAGAGCTGAGCCAGCTACAAGAGCTTAGCAACCA 929
||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1549 GAGCTGGCCCAGAAAACGACGACACTGACAACCACCCAGCGAGAGCTGAGTCAGCTGCAAGAGCTTAGTAACCA 1622
Query 930 CCAGAAGAAAAGGGCAACTGAGATCCTGAATTTGCTGTTGAAAGATCTGGGGGAGATAGGTGGAATTATTGGCA 1003
||||||.||.|||||.||.|||||||||||..||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1623 CCAGAAAAAGAGGGCCACAGAGATCCTGAACCTGCTTCTCAAGGACCTGGGGGAGATAGGCGGAATTATTGGCA 1696
Query 1004 CCAATGATGTGAAAACTTTGGCAGATGTGAATGGAGTCATTGAGGAGGAGTTTACCATGGCCCGCCTGTACATC 1077
||||.||||||||.|||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1697 CCAACGATGTGAAGACTCTGGCAGATGTGAACGGGGTCATTGAGGAGGAGTTCACCATGGCACGCCTGTACATT 1770
Query 1078 AGCAAGATGAAGTCAGAGGTCAAGTCCCTGGTGAACCGCAGCAAACAGCTCGAGAGCGCCCAGATGGACTCCAA 1151
||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1771 AGCAAGATGAAGTCGGAGGTCAAGTCTCTCGTGAACCGCAGCAAGCAGCTGGAGAGTGCCCAGATGGACTCTAA 1844
Query 1152 CAGGAAGATGAATGCCAGCGAGCGGGAGCTGGCAGCCTGCCAGCTGCTCATCTCCCAGCACGAAGCCAAGATCA 1225
||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1845 CAGGAAGATGAACGCCAGTGAGCGCGAGCTGGCAGCGTGCCAGTTGCTTATCTCACAGCACGAAGCCAAGATCA 1918
Query 1226 AGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAACAGAAGAGGAGGCAGCTAGAAGAGTCCCAGGACTCGCTCAGC 1299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1919 AGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAACAGAAGAGGCGGCAGCTGGAAGAGTCCCAGGACTCCCTCAGC 1992
Query 1300 GAAGAGCTGGCAAAGCTCCGATCCCAGGAAAAAATGCACGAAGTCAGCTTCCAGGATAAGGAGAAGGAACATCT 1373
||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1993 GAGGAACTGGCCAAGCTCCGGGCCCAGGAAAAAATGCACGAAGTCAGTTTCCAAGATAAGGAAAAGGAGCACCT 2066
Query 1374 GACGCGGTTGCAGGATGCTGAAGAAATGAAGAAGGCGCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCTCACC 1447
||||.||.|||||||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2067 GACGAGGCTGCAGGATGCTGAGGAGGTGAAGAAAGCTCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCGCACC 2140
Query 1448 AGAAGCAGCTGTCCAGACTCCGAGACGAAATTGAGGAGAAGCAGAAAATCATTGATGAGATTCGGGATTTGAAT 1521
|.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2141 AAAAGCAGCTGTCCAGACTTCGCGATGAGATTGAGGAGAAGCAGAGAATCATTGATGAGATCCGGGATTTGAAT 2214
Query 1522 CAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAAGCTTAGTTCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAAGAGAGAGA 1595
|||||||||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2215 CAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAGGCTCAGCTCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAGGAGAGAGA 2288
Query 1596 AATGAAGCTGGAAAAGCTCTTATTGCTCAACGATAAAAGGGAACAAGCCAGAGAAGACCTCAAAGGGCTGGAGG 1669
|.||||.|||||.||||||.||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2289 AGTGAAACTGGAGAAGCTCCTATTGCTCAATGACAAAAGGGAGCAAGCCAGGGAGGACCTCAAGGGACTGGAGG 2362
Query 1670 AGACAGTGTCTAGAGAATTGCAGACACTGCACAACCTTCGGAAACTCTTTGTCCAGGATCTGACCACCCGAGTT 1743
||||.||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.||.
Sbjct 2363 AGACTGTGTCTAGAGAACTCCAGACCCTTCATAACCTGCGCAAACTCTTCGTCCAGGATTTGACAACCCGGGTG 2436
Query 1744 AAAAAAAGTGTGGAGTTGGACAACGATGATGGAGGGGGCAGTGCTGCCCAGAAGCAGAAAATTTCCTTCTTGGA 1817
|||||.|||||||||.||||||.|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct 2437 AAAAAGAGTGTGGAGCTGGACAGCGACGATGGAGGGGGCAGCGCTGCTCAGAAGCAGAAGATCTCCTTCCTGGA 2510
Query 1818 GAATAACCTGGAGCAGCTCACCAAAGTTCACAAGCAGCTGGTCCGGGACAACGCAGACCTGCGCTGTGAACTGC 1891
|||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||.|
Sbjct 2511 GAACAACCTGGAACAGCTTACCAAGGTGCACAAGCAGCTGGTCCGGGACAATGCAGATTTGCGCTGTGAACTCC 2584
Query 1892 CCAAGCTGGAGAAGCGGCTGCGTGCCACGGCGGAGCGCGTCAAGGCTCTGGAGAGCGCGCTGAAGGAGGCCAAG 1965
||||||||||||||.||||.|||||.||.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2585 CCAAGCTGGAGAAGAGGCTTCGTGCTACCGCAGAACGCGTCAAGGCCTTGGAGAGTGCGCTGAAAGAGGCCAAG 2658
Query 1966 GAGAACGCCATGCGGGACCGTAAGCGCTACCAGCAGGAGGTGGATCGTATCAAGGAGGCCGTGCGGGCCAAGAA 2039
|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2659 GAGAATGCCATGAGGGACCGAAAACGCTACCAGCAGGAAGTAGATCGCATCAAGGAGGCTGTGCGAGCCAAGAA 2732
Query 2040 CATGGCCAGAAGGGCCCATTCAGCCCAGATCGCCAAGCCCATCCGCCCCGGACACTACCCGGCCTCATCTCCAA 2113
|||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 2733 CATGGCCAGGAGGGCACATTCGGCTCAGATCGCCAAGCCCATCCGCCCAGGCCATTACCCAGCATCATCTCCGA 2806
Query 2114 CGGCCGTCCATGCCATTCGAGGGGGAGGAGGCAGCTCTTCAAATTCCACTCACTACCAGAAA 2175
|.||.|||||||||.|.|||||.||||||||..||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2807 CAGCTGTCCATGCCGTCCGAGGAGGAGGAGGTGGCTCTTCAAACTCTACTCACTACCAGAAA 2868
