Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13920
• Subject: XM_017004340.2
• Aligned Length: 2991
• Identities: 2988
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGCCATCGG-AAAGAAAATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAA  73
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCATCGGAAAAGAAAATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAA  74

Query   74  AGTCCGGCCAAATTCTCGCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAAC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCCGGCCAAATTCTCGCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAAC  148

Query  148  CTTCAAAGAAAGACCTCGAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACG  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTCAAAGAAAGACCTCGAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACG  222

Query  222  GAAACATTTAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAACATTTAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAA  296

Query  296  CTATGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGG  370

Query  370  TTTCTCGAAGTAAGCAGCCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTCTCGAAGTAAGCAGCCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACA  444

Query  444  GTGTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACT  518

Query  518  CAACCCTACTCTGAAGGAAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACCCTACTCTGAAGGAAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCA  592

Query  592  CCCGCGTGACCGAAGAGGAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTT  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGCGTGACCGAAGAGGAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTT  666

Query  666  GTACAGATATCTAAAAACAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTACAGATATCTAAAAACAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGT  740

Query  740  CACCCATATCACCGAGGATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACCCATATCACCGAGGATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAG  814

Query  814  GGTTTCTTGCAATTGATGGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTTCTTGCAATTGATGGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAG  888

Query  888  AAGGTTGCCCAAGATATGACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGTTGCCCAAGATATGACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGA  962

Query  962  AGACCAGTTCAGGGGGCCAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAAC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACCAGTTCAGGGGGCCAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAAC  1036

Query 1036  TCGATGTAAGTGATGGTTCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTT  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGATGTAAGTGATGGTTCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTT  1110

Query 1110  CGAAGTGTCATAGAGGTAATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGAAGTGTCATAGAGGTAATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAA  1184

Query 1184  TCACTGCTCCTTGCCGCAGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCACTGCTCCTTGCCGCAGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTG  1258

Query 1258  AAGCACCTTTGCCCTCAGAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAG  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGCACCTTTGCCCTCAGAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAG  1332

Query 1332  AAGTTGCCTTCTGATCCAGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAG  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTTGCCTTCTGATCCAGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAG  1406

Query 1406  GATGTCGGTAGATTACAATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTT  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATGTCGGTAGATTACAATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTT  1480

Query 1480  GTAAATCTGTTCAATACAGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGT  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTAAATCTGTTCAATACAGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGT  1554

Query 1554  GAAACAGAGGCCAGCCGCATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAG  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAACAGAGGCCAGCCGCATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAG  1628

Query 1628  AATCTATCCAAGTGCCATGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGA  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATCTATCCAAGTGCCATGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGA  1702

Query 1702  TTATAGCAATGAATTTTCAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCATCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGA  1775
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGTAGCAATGAATTTTCAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCTTCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGA  1776

Query 1776  TGTGGTTATGTTCTAAGGCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCT  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTGGTTATGTTCTAAGGCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCT  1850

Query 1850  ACCTGGGGTGTCTCCTCTAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTT  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCTGGGGTGTCTCCTCTAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTT  1924

Query 1924  GTGCCAAAGGGGATGTCATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAA  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTGCCAAAGGGGATGTCATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAA  1998

Query 1998  AGAACTAAAACTGTACAGCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACC  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGAACTAAAACTGTACAGCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACC  2072

Query 2072  TGAGCTGGCCATGATCCGTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGA  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAGCTGGCCATGATCCGTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGA  2146

Query 2146  TACCATTTGAATGTTTGCAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCAC  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TACCATTTGAATGTTTGCAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCAC  2220

Query 2220  GTAACCCTTTTTGTCCACATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGT  2293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTAACCCTTTTTGTCCACATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGT  2294

Query 2294  GAGAATGGGGAAGAAAGTTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTA  2367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAGAATGGGGAAGAAAGTTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTA  2368

Query 2368  AAATAGCGGTTCATCCATTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAG  2441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAATAGCGGTTCATCCATTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAG  2442

Query 2442  GAACTATGTGGACTCCCTCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAG  2515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAACTATGTGGACTCCCTCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAG  2516

Query 2516  TGACAATACTCCTTCAGTCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAG  2589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGACAATACTCCTTCAGTCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAG  2590

Query 2590  ATGTGCAGAAAAAGATGCTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGAC  2663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATGTGCAGAAAAAGATGCTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGAC  2664

Query 2664  ACAGTCCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGC  2737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACAGTCCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGC  2738

Query 2738  AAAAGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGG  2811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AAAAGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGG  2812

Query 2812  GCCAAGGAGATCTGTTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTG  2885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GCCAAGGAGATCTGTTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTG  2886

Query 2886  TCCTGTGGACTGAGTAAAGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGA  2959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TCCTGTGGACTGAGTAAAGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGA  2960

Query 2960  GAAGGAAAGTAGTGAGGAGAATGGGAAGCTG  2990
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GAAGGAAAGTAGTGAGGAGAATGGGAAGCTG  2991