Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13944
- Subject:
- NM_001289916.1
- Aligned Length:
- 1404
- Identities:
- 1282
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATC 71
Query 75 ATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATG 148
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 72 GTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAGAGCAATG 145
Query 149 CCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGA 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 146 CCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGGACCAGCAGAAACCGCTGCCAGCATTGTCGG 219
Query 223 TTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGA 296
.|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 220 CTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTGGTCGGATGTCCAAGAAGCAGAGAGA 293
Query 297 CAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGG 370
|||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 294 CAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGAGACCACCAGCAGCAGCCTGGGGAGG 367
Query 371 CTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTAC 444
|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|.|||.
Sbjct 368 CGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGAACTGCATGATGACCTCAGCACCTAT 441
Query 445 ATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTC 518
||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 442 ATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATCCAGCCCTC 515
Query 519 CCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCT 592
||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 516 CCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATATGTGACTACACACCAGCATCTGGCT 589
Query 593 TCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCA 666
||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 590 TCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTCCATGGCAGAACTAGAACACCTTGCC 663
Query 667 CAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC 740
|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 CAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC 737
Query 741 CTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAA 814
|||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct 738 CTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTGATGTGGCAGCTGTGTGCCATCAAGA 811
Query 815 TTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGAT 888
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 812 TTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAGCTGTGTCAAAATGAT 885
Query 889 CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA 962
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA 959
Query 963 CAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTA 1036
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct 960 CAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAGTCCCTAGGTTGTGAAGACTTCATCA 1033
Query 1037 GCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCA 1110
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034 GCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGAAGACGAAATCGCGTTATTTTCTGCA 1107
Query 1111 TTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCA 1184
||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108 TTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAATAGAAAAGCTGCAACAGAAAATTCA 1181
Query 1185 GCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGT 1258
|||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1182 GCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATTCTAACCAAGCTAATATGCAAGGTGT 1255
Query 1259 CTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG 1332
||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG 1329
Query 1333 CGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGC-AATTGATGGG 1403
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||| |||.||||||
Sbjct 1330 CGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCCATGCAAATCGATGGG 1401