Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13957
Subject:
NM_000578.4
Aligned Length:
550
Identities:
421
Gaps:
118

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MTGDKGPQRLSGSSYGSISSPTSPTSPGPQQAPPRETYLSEKIPIPDTKPGTFSLRKLWAFTGPGFLMSIAFLD  74

Query   1  ----------------------------MVRCQLTATSTS----------------QVPRTVLWLTIELAIVGS  30
                                       ...||..|....                .|||||||||||||||||
Sbjct  75  PGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLLWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEVCHLYYPKVPRTVLWLTIELAIVGS  148

Query  31  DMQEVIGTAIAFNLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGLLITIMALTFGYEYVVARPEQG  104
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  DMQEVIGTAIAFNLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGLLITIMALTFGYEYVVARPEQG  222

Query 105  ALLRGLFLPSCPGCGHPELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRARRADIREANMYFLIEATIALSVSF  178
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ALLRGLFLPSCPGCGHPELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRARRADIREANMYFLIEATIALSVSF  296

Query 179  IINLFVMAVFGQAFYQKTNQAAFNICANSSLHDYAKIFPMNNATVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAIGLLA  252
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  IINLFVMAVFGQAFYQKTNQAAFNICANSSLHDYAKIFPMNNATVAVDIYQGGVILGCLFGPAALYIWAIGLLA  370

Query 253  AGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVL  326
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGQSSTMTGTYAGQFVMEGFLRLRWSRFARVLLTRSCAILPTVLVAVFRDLRDLSGLNDLLNVLQSLLLPFAVL  444

Query 327  PILTFTSMPTLMQEFANGLLNKVVTSSIMVLVCAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLAALLAAAYPGLSTYLVWTC  400
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 445  PILTFTSMPTLMQEFANGLLNKVVTSSIMVLVCAINLYFVVSYLPSLPHPAYFGLAALLAAAYLGLSTYLVWTC  518

Query 401  CLAHGATFLAHSSHHHFLYGLLEEDQKGETSG  432
           ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CLAHGATFLAHSSHHHFLYGLLEEDQKGETSG  550