Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13957
- Subject:
- XM_017004765.2
- Aligned Length:
- 1535
- Identities:
- 1280
- Gaps:
- 247
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGGTGACAAGGGTCCCCAAAGGCTAAGCGGGTCCAGCTATGGTTCCATCTCCAGCCCGACCAGCCCGAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGCCCAGGGCCACAGCAAGCACCTCCCAGAGAGACCTACCTGAGTGAGAAGATCCCCATCCCAGACACAAAAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGCTTCTCTGGGTGCTGCTCTGGGCCACCGTGTTGGGCTTGCTCTGCCAGCGACTGGCTGCACGTCTGGGCGTG 222
Query 1 ---------------ATGGTGCGATGTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCC--AGGTGCCCCGCACCGTCCTC 57
.||| ||||.|| ||||.|.||||||..||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGACAGGCAAGGACTTGG-GCGAGGT-------CTGCCATCTCTACTACCCTAAGGTGCCCCGCACCGTCCTC 288
Query 58 TGGCTGACCATCGAGCTAGCCATTGTGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCT 131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 TGGCTGACCATCGAGCTAGCCATTGTGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCT 362
Query 132 GCTCTCAGCTGGACGAATCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCC 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GCTCTCAGCTGGACGAATCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCC 436
Query 206 TCGATAACTACGGGCTGCGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGC 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 TCGATAACTACGGGCTGCGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGC 510
Query 280 TATGAGTATGTGGTGGCGCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTG 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 TATGAGTATGTGGTGGCGCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTG 584
Query 354 CGGCCACCCCGAGCTGCTGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACT 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 CGGCCACCCCGAGCTGCTGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACT 658
Query 428 CGGCCCTGGTCAAGTCTCGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCGGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTG 501
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 CGGCCCTGGTCAAGTCTCGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCAGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTG 732
Query 502 ATTGAGGCCACCATCGCCCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTT 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 ATTGAGGCCACCATCGCCCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTT 806
Query 576 CTACCAGAAAACCAACCAGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCC 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 CTACCAGAAAACCAACCAGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCC 880
Query 650 CCATGAACAACGCCACCGTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCG 723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CCATGAACAACGCCACCGTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCG 954
Query 724 GCCCTCTACATCTGGGCCATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACA 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GCCCTCTACATCTGGGCCATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACA 1028
Query 798 GTTCGTGATGGAGGGCTTCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCA 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 GTTCGTGATGGAGGGCTTCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCA 1102
Query 872 TCCTGCCCACCGTGCTCGTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TCCTGCCCACCGTGCTCGTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTG 1176
Query 946 CTGCAGAGCCTGCTGCTCCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGA 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 CTGCAGAGCCTGCTGCTCCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGA 1250
Query 1020 GTTTGCCAATGGCCTGCTGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACT 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GTTTGCCAATGGCCTGCTGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACT 1324
Query 1094 TCGTGGTCAGCTATCTGCCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTAC 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TCGTGGTCAGCTATCTGCCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTAC 1398
Query 1168 CCGGGCCTCAGCACCTACCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCA 1241
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 CTGGGCCTCAGCACCTACCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCA 1472
Query 1242 CCACCACTTCCTGTATGGGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 CCACCACTTCCTGTATGGGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1527