Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14010
• Subject: NM_024430.4
• Aligned Length: 1033
• Identities: 904
• Gaps: 128

Alignment

Query    1  ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74

Query   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148

Query  149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222

Query  223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296

Query  297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370

Query  371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444

Query  445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  518

Query  519  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  592

Query  593  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTGAA  666

Query  667  CGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCACCAGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCACCAGTGATGA  740

Query  741  A-------------------------------------------------------------------------  741
            |                                                                         
Sbjct  741  AATGTACGAACAAGTCCGAAAGAGTTTAGAAATGTGCAGCATTCAGAGGGACATTGAATACTTTGTGAATCAAC  814

Query  742  ------------------------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGAATGCAGTCCCA  791
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAAAACTGGACAGATTCCACCAGCACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGAATGCAGTCCCA  888

Query  792  GCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCACCAGATGATCC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCACCAGATGATCC  962

Query  866  CAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAGCTTTTTCCGGC  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  963  CAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAG-------------------------------  1002