Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14010
• Subject: XM_011526254.2
• Aligned Length: 970
• Identities: 856
• Gaps: 101

Alignment

Query   1  ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74

Query  75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148

Query 149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222

Query 223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296

Query 297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370

Query 371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444

Query 445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  518

Query 519  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  592

Query 593  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||  |
Sbjct 593  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAG-----------------ATGT--A  647

Query 667  CGAATAAACTTCTTCCGGAA----------------TGCATT--GTGGTTACA----------TGTGAATCAGC  712
           ||||.||     .||||.||                .|||||  |.|| .|||          |||||||||  
Sbjct 648  CGAACAA-----GTCCGAAAGAGTTTAGAAATGTGCAGCATTCAGAGG-GACATTGAATACTTTGTGAATCA--  713

Query 713  TGTCACAACAATG------TGTCACCAGTGATGAACACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGA  780
             .|.|||.|.||      |..||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714  --ACGCAAAACTGGACAGATTCCACCAG-------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGA  778

Query 781  ATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCA  854
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779  ATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCA  852

Query 855  CCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAGCTT  928
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 853  CCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAG-----------------------  903

Query 929  TTTCCGGC  936
                   
Sbjct 904  --------  903