Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14033
Subject:
NM_001134383.1
Aligned Length:
962
Identities:
777
Gaps:
149

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MWCLHCNSERTQSLLELELDSGVEGEAPSSETGTSLDSPSAYHQGPLVPGSSLSPDHYEHTSVGAYGLYAGPGP  74

Query   1  -----------------------------------------------MLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQ  27
                                                          |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  QQRTRRPRLQHSTSVLRKQAEEEAIKRSRSLSESYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQ  148

Query  28  MNKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVSPECGDLSEPTTL  101
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.| .|
Sbjct 149  MNKNFERLRSSMSENRMSRRIVLSNMRMQFSFEGPEKVHSSYFEGKQVSVTNDGSQLGALVPSECGDLSDP-AL  221

Query 102  KSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHTEEAPALDAARARDTEPQTALHGMDHRKLDEMT  175
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|.||||||||...|||||||||||||
Sbjct 222  KSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCRSLHSEEVPASDTARARDTEPKPGLHGMDHRKLDEMT  295

Query 176  ASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAGGAAPDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERQXQR  249
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||...|
Sbjct 296  ASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRSGGAAQDYWALAHKEDKADTDTSCRSTPSLERPEPR  369

Query 250  LRVEHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHSGAPKSLPREEPELRPRPPRPL  323
           |||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||
Sbjct 370  LRVEHLPLLTIEPPSDSSVELSDRSDRSSLKRQSAYERSLGGQQGSPKHGPHGGPPKGLPREEPELRPRPPRPL  443

Query 324  DSHLAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFS  397
           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 444  ESHLAINGSANRQSKSESDYSDGDNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKETRNSWDSPAFS  517

Query 398  NDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV  471
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  NDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCV  591

Query 472  VDEMDFSTMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMY  545
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  VDEMDFSAMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMY  665

Query 546  SPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPG  619
           |||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666  SPNVKPERKMKLEDFVKNLRGVDDGEDIPRETLIGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHHG  739

Query 620  LGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLL  693
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  LGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLL  813

Query 694  FENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQ  767
           ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814  FENQYYPNGIRLTSAVPGADIKVLINFNAPNPQDRKKFTDDLRESVAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQ  887

Query 768  CSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGVHH---------------------------  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...                           
Sbjct 888  CSSLKKESGNGTLSRACLDDSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFQPPQPPVLCS  961