Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14033
• Subject: NM_014869.7
• Aligned Length: 2889
• Identities: 2439
• Gaps: 447

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGTGCCTGCACTGCAACTCGGAGAGGACCCAGTCCCTTCTGGAGCTAGAGCTTGACAGCGGCGTCGAGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGAGGCCCCCAGCAGTGAGACTGGCACATCCCTGGACAGCCCCTCAGCCTACCCCCAGGGCCCCTTGGTGCCCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTTCCAGCCTGAGCCCGGATCACTACGAGCACACGTCAGTGGGAGCCTATGGGCTGTACTCGGGGCCGCCGGGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAACAGCAGCGCACGCGGAGGCCCAAGCTGCAGCACTCGACCTCCATCCTGCGCAAGCAGGCTGAGGAGGAGGC  296

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGC  4
                                                                                  ||||
Sbjct  297  CATCAAGCGCTCACGCTCACTCTCCGAGAGCTATGAGCTCTCCTCGGACCTGCAGGACAAGCAGGTGGAGATGC  370

Query    5  TAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAGTAC  78
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCAGTAC  444

Query   79  CAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCTGTC  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGCTGTC  518

Query  153  CAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGGTCT  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAGGTCT  592

Query  227  CAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACCACC  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCACCACC  666

Query  301  CTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCAAGT  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGCAAGT  740

Query  375  GAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCCTGG  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCCCTGG  814

Query  449  ATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAGATG  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGAGATG  888

Query  523  ACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCAGGC  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGCAGGC  962

Query  597  AGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGGCCC  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGGGCCC  1036

Query  671  TGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGNGCAG  744
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1037  TGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGAGCAG  1110

Query  745  CGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGACCG  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTGACCG  1184

Query  819  CTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCAAGC  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCCAAGC  1258

Query  893  ATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGGCCC  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAGGCCC  1332

Query  967  CTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGGTGA  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACGGTGA  1406

Query 1041  CAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTGACA  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGTGACA  1480

Query 1115  GCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCCTTT  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGCCTTT  1554

Query 1189  AGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGAGT  1262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGGGAGT  1628

Query 1263  CCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGG  1336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGCAAGG  1702

Query 1337  GCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGACTGC  1410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGACTGC  1776

Query 1411  GTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCGTGT  1484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCCGTGT  1850

Query 1485  CCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTGGGG  1558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCTGGGG  1924

Query 1559  TGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGACATG  1632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGACATG  1998

Query 1633  TACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGACGA  1706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGGACGA  2072

Query 1707  TGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCAATG  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACCAATG  2146

Query 1781  AGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCATCCC  1854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCATCCC  2220

Query 1855  GGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGACCC  1928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAGACCC  2294

Query 1929  AAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCAAGA  2002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACCAAGA  2368

Query 2003  TCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTCCTG  2076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGTCCTG  2442

Query 2077  CTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGTGTT  2150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAGTGTT  2516

Query 2151  AATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGGAAG  2224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCGGAAG  2590

Query 2225  TCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATGTCC  2298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCATGTCC  2664

Query 2299  CAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGCCAG  2372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATGCCAG  2738

Query 2373  CGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGG----------GTC  2436
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||
Sbjct 2739  CGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGAAGCGAGGGCGTC  2812

Query 2437  -CATCAT-------------------------------------------------------------------  2442
             ||.||.                                                                   
Sbjct 2813  GCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAATTTCAGCCTTTCGAGCCACTGCAGCCGTCAGTGCTGTGC  2886

Query 2443  ---  2442
               
Sbjct 2887  TCC  2889