Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14033
• Subject: XM_011534313.2
• Aligned Length: 3018
• Identities: 2441
• Gaps: 576

Alignment

Query    1  ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTAGAACGAAAGTATGGGGGGCGCCTGGTAACCCGCCATGCGGCCCGCACCATCCAGACGGCGTTTCGCCA  74

Query   75  GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTACCAGATGAACAAGAACTTCGAGCGCTTGCGCAGCTCCATGTCAGAGAACCGCATGTCACGCCGGATTGTGC  148

Query  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCCAACATGAGGATGCAGTTCTCCTTTGAGGGGCCTGAGAAAGTGCACAGCTCCTACTTCGAGGGGAAGCAG  222

Query  223  GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTCAGTGACTAACGACGGCTCCCAGCTGGGAGCCCTGGTGTCCCCTGAGTGTGGTGACCTCAGCGAGCCCAC  296

Query  297  CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACCCTCAAGTCTCCGGCCCCCTCCAGTGACTTTGCGGACGCCATCACCGAGCTGGAGGACGCCTTCTCTAGGC  370

Query  371  AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTGAAATCACTGGCCGAGTCCATCGACGATGCCCTCAACTGCCGCAGCCTGCACACTGAGGAGGCACCGGCC  444

Query  445  CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGATGCGGCGCGGGCCCGGGACACCGAACCCCAGACAGCCCTGCACGGCATGGACCACCGCAAACTGGACGA  518

Query  519  GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGACGGCCTCGTACAGTGATGTCACCCTGTACATCGATGAGGAGGAGCTGTCGCCCCCTCTGCCCCTCTCGC  592

Query  593  AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCAGGGGACCGGCCGTCCAGCACCGAGTCGGACCTGCGGCTACGGGCTGGGGGCGCAGCCCCAGACTACTGG  666

Query  667  GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGN  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  667  GCCCTGGCCCACAAAGAGGACAAGGCTGACACGGACACGAGCTGCCGGAGCACGCCGTCGCTGGAGCGGCAGGA  740

Query  741  GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCGGCTGCGGGTGGAGCATCTGCCGCTGCTCACCATCGAGCCACCCAGCGACAGCTCTGTGGACCTTAGTG  814

Query  815  ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCTCGGAGCGGGGGTCACTCAAGAGGCAGAGTGCTTACGAGCGCAGCCTTGGCGGGCAGCAGGGCAGTCCC  888

Query  889  AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCATGGTCCCCACAGCGGCGCCCCCAAGAGCCTCCCCCGGGAGGAGCCTGAGTTGCGGCCCCGGCCCCCCAG  962

Query  963  GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCCTGGACAGCCACTTGGCCATCAATGGCTCAGCCAACCGGCAGAGCAAGTCTGAGTCGGACTACTCAGACG  1036

Query 1037  GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGACAATGACAGCATCAACAGCACGTCCAACTCCAACGATACCATCAACTGCAGCTCCGAGTCATCGTCCCGT  1110

Query 1111  GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAGCCTGCGGGAGCAGACGCTCAGCAAGCAGACCTACCACAAGGAGGCCCGCAACAGCTGGGACTCGCCTGC  1184

Query 1185  CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTTAGCAACGATGTCATCCGCAAGAGGCACTACCGCATCGGCCTGAACCTCTTCAACAAGAAGCCTGAGAAGG  1258

Query 1259  GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTCCAGTACCTCATCGAGCGTGGCTTTGTGCCCGACACGCCCGTCGGGGTGGCCCACTTCCTGCTGCAGCGC  1332

Query 1333  AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGGCCTCAGCCGGCAGATGATCGGCGAGTTCCTGGGCAACCGGCAGAAGCAGTTCAACCGTGACGTGCTCGA  1406

Query 1407  CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCGTCGTGGACGAGATGGACTTCTCTACCATGGAGCTGGATGAGGCCCTCAGGAAATTCCAGGCGCACATCC  1480

Query 1481  GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGTCCAAGGGGAGGCTCAGAAAGTGGAGCGGCTCATAGAGGCGTTCAGCCAGCGCTACTGCATCTGCAACCCT  1554

Query 1555  GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGGTGGTGCGGCAATTCCGGAACCCAGACACCATTTTCATCCTGGCCTTCGCCATCATCCTGCTGAACACCGA  1628

Query 1629  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGTACAGCCCCAATGTCAAGCCCGAGCGGAAAATGAAGCTAGAGGACTTCATCAAGAACCTCCGAGGTGTGG  1702

Query 1703  ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGATGGTGAGGACATTCCCCGTGAGATGCTGATGGGGATCTATGAACGGATCCGTAAGCGAGAGCTAAAGACC  1776

Query 1777  AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATGAGGACCATGTGTCCCAGGTGCAGAAGGTGGAGAAGCTCATTGTGGGGAAAAAGCCGATCGGATCCCTGCA  1850

Query 1851  TCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCCCGGGCTCGGCTGTGTGCTCTCTCTGCCCCACCGTCGGTTGGTCTGCTACTGCCGGCTCTTTGAGGTTCCAG  1924

Query 1925  ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCCAAACAAGCCCCAGAAACTCGGACTACACCAGCGAGAAATCTTCCTGTTCAACGACCTCCTGGTGGTCACC  1998

Query 1999  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGATCTTCCAGAAGAAGAAGAACTCGGTGACGTACAGCTTCCGACAGTCCTTCTCCTTGTACGGCATGCAGGT  2072

Query 2073  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTGCTCTTCGAGAACCAGTACTACCCCAATGGCATCCGGCTCACCTCGTCTGTCCCCGGAGCAGATATCAAAG  2146

Query 2147  TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGTTAATAAACTTCAACGCCCCCAACCCTCAAGACCGGAAGAAATTCACCGATGACCTGCGGGAGTCCATTGCG  2220

Query 2221  GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAAGTCCAAGAGATGGAGAAGCACAGGATAGAGTCGGAGCTCGAGAAGCAGAAAGGCGTCGTGCGGCCCAGCAT  2294

Query 2295  GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTCCCAGTGCTCTAGCCTCAAAAAGGAGTCGGGCAACGGAACACTGAGCCGGGCCTGCCTGGACGACAGCTATG  2368

Query 2369  CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCG-----------  2431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 2369  CCAGCGGTGAGGGCCTCAAGCGCAGCGCCCTCAGCAGCTCCCTGCGGGACCTCTCGGAAGCCGGGAAGCGAGGG  2442

Query 2432  ---------------------------------------GGGTCCATCAT------------------------  2442
                                                   |||||||||||                        
Sbjct 2443  CGTCGCAGCAGTGCGGGATCGCTAGAGAGCAATGTGGAAGGGTCCATCATTAGCAGTCCTCACATGCGCCGGAG  2516

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2517  AGCTACATCAACACGAGAGTGTCCATCTCGCCCACACCAGACTATGCCCAACTCATCTTCCCTCCTGGGCTCCT  2590

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2591  TATTCGGGAGCAAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCCAGGCCCACCTGCCCTCAGCCCCAGCCCTGCCACCCCCCCAC  2664

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2665  CCACCGGTGGTCCTGCCTCACTTGCAGCACTCTGTGGCTGGCCACCACCTGGGGCCCCCAGAGGGGCTGCCGCA  2738

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2739  GGCCGCCATGCACGGGCATCACACCCAGTACTGCCACATGCAGAACCCTCCCCCGTACCACCATCACCACCACC  2812

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2813  ACCACCCACCCCAGCACATCCAGCACGCACACCAGTACCACCACGGCCCCCATGGGGGCCACCCAGCCTACGGG  2886

Query 2443  --------------------------------------------------------------------------  2442
                                                                                      
Sbjct 2887  GCCCATGCCCACGGCCACCCGCCGCTGCCCTCGGCCCACGTGGGGCACACAGTGCACCACCATGGGCAGCCCCC  2960

Query 2443  ----------------------------------------------------------  2442
                                                                      
Sbjct 2961  TGCCCCGCCGCCCCCCACCAGCAGCAAGGCCAAACCCAGCGGCATCAGCACAATTGTG  3018