Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14034
- Subject:
- NM_001077192.3
- Aligned Length:
- 1428
- Identities:
- 1233
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA 74
Query 75 CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA 148
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 75 CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA 148
Query 149 CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG 222
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG 222
Query 223 TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT 296
.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT 296
Query 297 TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
Query 371 TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT 444
||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT 444
Query 445 GTGGGCCATGGTGTCAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAAATCCTCCTAC 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 445 GTGGGCCATGGAGTTAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAGAACAAACCCTCCCAC 518
Query 519 TCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAAC 592
.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 GCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTTACAAAACCCTAGAGC 592
Query 593 CTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGTCAGCATAGTCCAGGC 666
|||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGCCAGCATAGTCCAGGC 666
Query 667 AGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG 740
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 667 AGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGGAAGCCGAGAGAACAG 740
Query 741 TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTGGACCAGCAGCCCCGG 814
|||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||...||.| |||||||.|
Sbjct 741 TGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACTGCGGGCC---CAGCCCCTG 811
Query 815 GCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTCGACA 888
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 812 GCGCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATTTCTCGACACAACTCTACCACTTCTTCGACA 885
Query 889 TCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC 962
||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 TCTTCTGGTGGATATAGACGAACTCCTTCTGTGGCCGCCCAATTCTCTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCC 959
Query 963 ACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGACTCCACAGATACCTC 1036
|||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACTTTATTCTCAAAATTCA------------------------------------------------------- 978
Query 1037 TCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGAT 1110
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 979 --------------------------------ATTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCACCCCCTCCACCAGAT 1020
Query 1111 GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGAAGATGAGGAGGCTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1021 GACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGAAGATGAGGAAGCTGC 1094
Query 1185 AGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGTTG 1258
||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1095 AGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACTATATTGAGAAAGTTG 1168
Query 1259 TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATA 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1169 TTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCAATCATCTATGTTATA 1242
Query 1333 AAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGTTGA 1406
||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 AAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCCTGGGAACTATGTTGA 1316
Query 1407 ATCAATCATGCA-TATACTGAT 1427
|||||||||||| |||||||||
Sbjct 1317 ATCAATCATGCACTATACTGAT 1338