Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14034
- Subject:
- NM_001331044.1
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1237
- Gaps:
- 103
Alignment
Query 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAGGGCGCTGATAGAGAGTTACCAGAA 74
Query 75 CCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTGAAAACAACTACATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTAGAGGAGA 148
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 75 CCTGACCCGGGTGGCGGACTACTGTGAAAACAACTATATACAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTCTAGAAGAGA 148
Query 149 CCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAG 222
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CCAAAGCATATACAACTCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCAAATAAATGCATTGGCCAACAATGTGCTCCAG 222
Query 223 TTGCTGGATATCCAAGCCTCTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGACTGTGGATAT 296
.||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCTGGATATCCAAGCATCTCAGCTGCGGAGGATGGAGTCATCCATCAATCACATCTCACAGACTGTGGATAT 296
Query 297 TCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATAAAGAAAAAGTGGCTCGAAGAGAGATTGGTATTTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAA 370
Query 371 TAATAGCACCTGCGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACAGTTCTGGATGAT 444
||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TAATCGCACCCGCAAATATGGAGCGTCCTGTCAGGTATATTCGGAAACCTATCGACTATACAGTTCTGGATGAT 444
Query 445 GTGGGCCATGGTGT---------------CAAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAG 503
|||||||||||.|| ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GTGGGCCATGGAGTTAAGTGGCTAAAAGCCAAGCACGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACATTGTCGAG 518
Query 504 AACAAATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACACTGGGACGGAATACTCCTT 577
||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||
Sbjct 519 AACAAACCCTCCCACGCAGAAACCACCAAGCCCTCCCGTGTCGGGCCGAGGGACTTTGGGACGGAATACCCCTT 592
Query 578 ATAAAACCCTGGAACCTGTTAAACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAAGT 651
|.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 ACAAAACCCTAGAGCCTGTTAAGCCTCCAACAGTTCCCAATGACTACATGACTAGTCCTGCGAGGCTTGGAAGC 666
Query 652 CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACACACAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGG 725
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 CAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCTTCTTTAAATCAGAGACCAAGGACGCATAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGCGG 740
Query 726 AAGTCGAGAAAACAGTGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCACCCACTATTG 799
|||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||...|
Sbjct 741 AAGCCGAGAGAACAGTGGGAGCAGCAGCATTGGCATTCCTATTGCTGTGCCTACGCCCTCACCGCCCACTGCGG 814
Query 800 GACCAGCAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCT 873
|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCAGCAGCCCCTGGCGCAGCTCCTGGTTCCCAGTATGGCACAATGACCAGGCAGATTTCTCGACACAACTCT 888
Query 874 ACTACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTTCTGCTCAGCCTCA 947
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 889 ACCACTTCTTCGACATCTTCTGGTGGATATAGACGAACTCCTTCTGTGGCCGCCCAATTCTCTGCTCAGCCTCA 962
Query 948 TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAATTTCTATTGCTCCACCCCCTCCCCCTATGCCTCAGTTGA 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCA---------------------------------------- 996
Query 1022 CTCCACAGATACCTCTCACAGGCTTCGTGGCCAGGGTGCAGGAAAACATTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCA 1095
|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 997 -----------------------------------------------ATTGCTGATAGCCCAACTCCACCACCA 1023
Query 1096 CCACCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGGATTATGA 1169
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 1024 CCCCCTCCACCAGATGACATTCCCATGTTTGATGACTCTCCGCCTCCTCCGCCACCTCCTCCTGTGGACTATGA 1097
Query 1170 AGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCAGATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATT 1243
|||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1098 AGATGAGGAAGCTGCAGTAGTTCAGTATAGTGACCCATATGCAGATGGGGACCCTGCATGGGCTCCCAAGAACT 1171
Query 1244 ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCATTTATGGAGGGTGCA 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||
Sbjct 1172 ATATTGAGAAAGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCCTTTAAAGAGGGTGCA 1245
Query 1318 ATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCC 1391
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1246 ATCATCTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGGTTTGAAGGAGTTTGCAATCGAGTGACTGGACTCTTCCC 1319
Query 1392 TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCA-TATACTGAT 1427
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1320 TGGGAACTATGTTGAATCAATCATGCACTATACTGAT 1356