Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14041
• Subject: NM_005857.5
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1421
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGGGATGTGGGCGTCGCTGGACGCTTTGTGGGAGATGCCGGCCGAGAAGCGTATCTTCGGGGCCGTGCTGCT  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGATGTGGGCATCGCTGGACGCTTTGTGGGAGATGCCGGCCGAGAAGCGTATCTTCGGGGCCGTGCTGCT  74

Query   75  CTTTTCCTGGACAGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATATAAAACAACAACTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTTCCTGGACAGTGTATCTTTGGGAGACCTTCCTAGCACAGCGGCAGAGAAGGATATATAAAACAACAACTC  148

Query  149  ATGTACCACCGGAGTTAGGACAGATCATGGATTCTGAAACATTTGAGAAATCTCGACTCTATCAACTGGATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTACCACCGGAGTTAGGACAGATCATGGATTCTGAAACATTTGAGAAATCTCGACTCTATCAACTGGATAAA  222

Query  223  AGCACTTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTATTCAGAGACTGAAGGCACTCTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCACTTTCAGCTTCTGGTCAGGACTCTATTCAGAGACTGAAGGCACTCTTATTCTTCTCTTTGGAGGAATACC  296

Query  297  TTATCTCTGGAGACTTTCTGGACGGTTCTGTGGTTATGCTGGCTTTGGACCAGAATATGAGATCACTCAGTCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTATCTCTGGAGACTTTCTGGACGGTTCTGTGGTTATGCTGGCTTTGGACCAGAATATGAGATCACTCAGTCCC  370

Query  371  TGGTGTTTCTGCTGTTGGCTACACTTTTCAGTGCATTGGCTGGTTTGCCATGGAGTCTTTATAATACTTTTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGTTTCTGCTGTTGGCTACACTTTTCAGTGCATTGACTGGTTTGCCATGGAGTCTTTATAATACTTTTGTG  444

Query  445  ATAGAAGAAAAACATGGCTTCAATCAACAGACTTTGGGGTTCTTCATGAAAGATGCAATCAAGAAATTTGTTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATAGAAGAAAAACATGGCTTCAATCAACAGACTTTGGGGTTCTTCATGAAAGATGCAATCAAGAAATTTGTTGT  518

Query  519  GACTCAGTGCATTTTGTTGCCTGTGTCTTCACTTCTACTTTACATTATTAAAATTGGGGGTGACTATTTTTTTA  592
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACTCAGTGTATTTTGTTGCCTGTGTCTTCACTTCTACTTTACATTATTAAAATTGGGGGTGACTATTTTTTTA  592

Query  593  TTTATGCCTGGCTGTTCACATTAGTTGTGTCTCTGGTTCTTGTCACAATCTATGCTGATTATATTGCCCCTTTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTATGCCTGGCTGTTCACATTAGTTGTGTCTCTGGTTCTTGTCACAATCTATGCTGATTATATTGCCCCTTTA  666

Query  667  TTTGACAAATTCACACCTCTGCCTGAGGGAAAGCTTAAAGAAGAAATTGAAGTAATGGCAAAGAGTATTGACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGACAAATTCACACCTCTGCCTGAGGGAAAGCTTAAAGAAGAAATTGAAGTAATGGCAAAGAGTATTGACTT  740

Query  741  TCCTTTGACGAAGGTGTATGTTGTGGAAGGATCTAAACGCTCTTCCCACAGCAATGCTTATTTTTATGGCTTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTTTGACGAAGGTGTATGTTGTGGAAGGATCTAAACGCTCTTCCCACAGCAATGCTTATTTTTATGGCTTCT  814

Query  815  TCAAGAACAAGCGAATAGTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACTAAACAAAGACATCCAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAAGAACAAGCGAATAGTTTTGTTTGACACTCTACTAGAAGAGTACTCTGTACTAAACAAAGACATCCAGGAG  888

Query  889  GATTCTGGCATGGAACCCCGCAATGAGGAAGAAGGGAACAGTGAAGAAATAAAAGCTAAAGTTAAAAATAAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATTCTGGCATGGAACCCCGCAATGAGGAAGAAGGGAACAGTGAAGAAATAAAAGCTAAAGTTAAAAATAAGAA  962

Query  963  ACAAGGATGTAAAAATGAGGAGGTACTCGCTGTACTAGGCCATGAACTGGGGCACTGGAAGTTGGGACATACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAAGGATGTAAAAATGAGGAGGTACTCGCTGTACTAGGCCATGAACTGGGGCACTGGAAGTTGGGACATACAG  1036

Query 1037  TCAAAAATATCATTATTAGCCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTTTTATTTGCTGTATTAATTGGTCGAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAAAAATATCATTATTAGCCAGATGAATTCTTTCCTGTGTTTTTTTTTATTTGCTGTATTAATTGGTCGAAAG  1110

Query 1111  GAGCTTTTTGCTGCATTTGGTTTTTATGATAGCCAACCCACTCTTATTGGACTATTGATCATCTTCCAGTTTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCTTTTTGCTGCATTTGGTTTTTATGATAGCCAACCCACTCTTATTGGACTATTGATCATCTTCCAGTTTAT  1184

Query 1185  TTTTTCACCTTACAATGAGGTTCTTTCTTTTTGCCTAACAGTCCTAAGCCGCAGATTTGAGTTTCAAGCTGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTTCACCTTACAATGAGGTTCTTTCTTTTTGCCTAACAGTCCTAAGCCGCAGATTTGAGTTTCAAGCTGATG  1258

Query 1259  CATTTGCCAAGAAACTTGGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTAATCAAACTTAACAAAGATAACTTGGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATTTGCCAAGAAACTTGGGAAGGCTAAAGACTTATATTCTGCTTTAATCAAACTTAACAAAGATAACTTGGGA  1332

Query 1333  TTCCCTGTTTCTGACTGGTTGTTCTCAATGTGGCATTATTCTCATCCTCCACTGCTAGAGAGACTTCAAGCTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCCCTGTTTCTGACTGGTTGTTCTCAATGTGGCATTATTCTCATCCTCCACTGCTAGAGAGACTTCAAGCTTT  1406

Query 1407  GAAAACTATGAA-CAACAC  1424
            |||||||||||| ||||||
Sbjct 1407  GAAAACTATGAAGCAACAC  1425