Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14067
• Subject: XM_011239519.2
• Aligned Length: 2856
• Identities: 2173
• Gaps: 524

Alignment

Query    1  ATGGGAGTCCCGGCGTTCTTCCGCTGGCTCAGCCGCAAGTACCCGTCCATCATAGTCAACTGCGTGGAAGAGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGGAGTCCCGGCGTTCTTCCGCTGGCTCAGCCGCAAGTACCCGTCCATCATTGTCAACTGCGTGGAGGAGAA  74

Query   75  GCCAAAAGAATGCAATGGTGTAAAGATTCCAGTTGATGCCAGTAAACCTAATCCAAATGATGTGGAGTTTGATA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAAAAGAATGCAACGGTGTAAAGATTCCAGTTGATGCCAGTAAACCTAATCCAAATGATGTGGAGTTTGATA  148

Query  149  ATCTGTATTTGGATATGAATGGAATCATCCATCCCTGTACTCATCCTGAAGACAAACCAGCACCAAAAAATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCTGTATTTGGATATGAATGGGATCATCCACCCCTGCACTCATCCTGAAGACAAACCAGCACCAAAAAATGAA  222

Query  223  GATGAAATGATGGTTGCAATTTTTGAGTACATTGACAGACTTTTCAGTATTGTAAGACCAAGAAGACTTCTCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGAAATGATGGTTGCAATTTTTGAGTACATTGACAGACTTTTCAATATTGTAAGACCAAGAAGACTTCTCTA  296

Query  297  CATGGCAATAGATGGAGTGGCACCACGTGCTAAAATGAACCAGCAGCGTTCAAGGAGGTTCAGGGCATCAAAAG  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  CATGGCAATAGATGGGGTGGCACCACGTGCAAAAATGAATCAGCAGCGTTCAAGGAGGTTCAGAGCATCAAAGG  370

Query  371  AAGGAATGGAAGCAGCAGTCGAGAAGCAGCGAGTCAGGGAAGAAATATTGGCAAAAGGTGGCTTTCTTCCTCCA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGAATGGAAGCAGCAGTTGAGAAGCAGCGAGTCAGAGAGGAAATACTTGCAAAAGGTGGCTTTCTTCCTCCA  444

Query  445  GAAGAAATAAAAGAAAGATTTGACAGCAACTGTATTACACCAGGAACTGAATTCATGGACAATCTTGCTAAATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAATAAAAGAAAGATTTGACAGCAACTGTATTACCCCAGGAACTGAGTTCATGGACAATCTTGCTAAATG  518

Query  519  CCTTCGCTATTACATAGCTGATCGTTTAAATAATGACCCTGGGTGGAAAAATTTGACAGTTATTTTATCTGATG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  CCTTCGCTATTACATAGCTGATCGTTTAAATAATGACCCTGGGTGGAAAAATTTGACAGTTATATTATCTGATG  592

Query  593  CTAGTGCTCCTGGTGAAGGAGAACATAAAATCATGGATTACATTAGAAGGCAAAGAGCCCAGCCTAACCATGAC  666
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAGTGCACCTGGTGAAGGAGAACACAAAATCATGGATTACATTAGAAGACAAAGAGCCCAGCCTAACCATGAC  666

Query  667  CCAAATACTCATCATTGTTTATGTGGAGCAGATGCTGATCTCATTATGCTTGGCCTTGCCACACATGAACCGAA  740
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  CCAAATACTCATCATTGTTTGTGTGGAGCTGATGCTGATCTAATTATGCTTGGTCTTGCTACACATGAACCTAA  740

Query  741  CTTTACCATTATTAGAGAAGAATTCAAACCAAACAAGCCCAAACCATGTGGTCTTTGTAATCAGTTTGGACATG  814
            |||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CTTCACCATAATCAGAGAAGAATTCAAACCAAATAAACCTAAACCATGTGCTCTTTGTAATCAGTTTGGACACG  814

Query  815  AGGTCAAAGATTGTGAAGGTTTGCCAAGAGAAAAGAAGGGAAAGCATGATGAACTTGCCGATAGTCTTCCTTGT  888
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTCAAGGATTGTGAAGGTTTGCCAAGAGAAAAGAAGGGAAAGCATGATGAACTTGCAGATAGTCTTCCTTGT  888

Query  889  GCAGAAGGAGAGTTTATCTTCCTTCGGCTTAATGTTCTTCGTGAGTATTTGGAAAGAGAACTCACAATGGCCAG  962
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GCAGAAGGGGAGTTTATCTTCCTTCGGCTGAATGTCCTTCGAGAGTATCTGGAAAGAGAACTCACCATGGCCAG  962

Query  963  CCTACCATTCACATTTGATGTTGAGAGGAGCATTGATGACTGGGTTTTCATGTGCTTCTTTGTGGGAAATGACT  1036
            |.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  963  CTTACCATTCCCATTTGATGTGGAGAGGAGCATTGATGACTGGGTGTTCATGTGCTTCTTTGTGGGGAATGATT  1036

Query 1037  TCCTCCCTCATTTGCCATCGTTAGAGATTAGGGAAAATGCAATTGACCGTTTGGTTAACATATACAAAAATGTG  1110
            ||||.|||||.||||||||..||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  TCCTTCCTCACTTGCCATCACTAGAGATTAGGGAAGGTGCAATTGATCGTTTGGTTAACATATACAAAAACGTG  1110

Query 1111  GTACACAAAACTGGGGGTTACCTTACAGAAAGTGGTTATGTCAATCTGCAAAGAGTACAGATGATCATGTTAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTACACAAAACTGGGGGTTACCTTACAGAAAGTGGTTATGTCAATCTGCAAAGAGTACAGATGATCATGTTAGC  1184

Query 1185  AGTTGGTGAAGTTGAGGATAGCATTTTTAAAAAGAGAAAGGATGATGAGGACAGTTTTAGAAGACGACAGAAAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTTGGTGAAGTTGAGGATAGCATTTTTAAAAAGAGAAAAGATGATGAGGACAGTTTTAGAAGACGACAGAAAG  1258

Query 1259  AAAAAAGAAAGAGAATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTCACTCCTAGTGGAATATTAACTCCTCATGCCTTGGGT  1332
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAAAGAAAGAGGATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTTACTCCTAGTGGAATATTAACACCTCATGCCTTGGGT  1332

Query 1333  TCAAGAAATTCACCAGGTTCTCAAGTAGCCAGTAATCCGAGACAAGCAGCCTATGAAATGAGGATGCAGAATAA  1406
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1333  TCAAGAAATTCACCAGGTTGTCAAGTAGCCAGTAATCCAAGACAAGCAGCCTATGAAATGAGGATGCAGAGAAA  1406

Query 1407  CTCTAGTCCTTCGATATCTCCTAATACGAGTTTCACATCTGATGGCTCCCCGTCTCCATTAGGAGGAATTAAGC  1480
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1407  CTCTAGTCCTTCAATATCTCCTAATACAAGTTTTGCATCTGATGGCTCCCCATCTCCACTAGGAGGAATTAAGA  1480

Query 1481  GAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAACCTGAGCCAGAGGATAATGTCAGGTTATGGGAAGCTGGCTGGAAGCAG  1554
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1481  GAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAGCCAGAGCCAGAGGATAACGTCAGGTTATGGGAAGCTGGTTGGAAGCAA  1554

Query 1555  CGGTACTACAAGAACAAATTTGATGTGGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGTCGGAAAGTTGTGCAGTCGTACGT  1628
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1555  CGATACTACAAGAACAAATTTGATGTAGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGACGTAAGGTTGTTCAGTCCTACGT  1628

Query 1629  TGAAGGACTTTGCTGGGTTCTTAGATATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTATTATCCATTTCATT  1702
            |||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  TGAAGGACTGTGCTGGGTTCTTCGCTATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTATTATCCATTCCATT  1702

Query 1703  ATGCACCATTTGCTTCAGACTTTGAAGGCATTGCAGACATGCCATCTGATTTTGAGAAGGGTACGAAACCGTTT  1776
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1703  ATGCACCATTTGCCTCAGACTTTGAAGGTATTGCAGACATGTCCTCTGAATTTGAAAAGGGCACAAAACCGTTT  1776

Query 1777  AAACCACTAGAACAACTTATGGGGGTATTTCCAGCTGCAAGTGGTAATTTTCTACCTCCATCATGGCGGAAGCT  1850
            ||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1777  AAGCCACTGGAACAACTAATGGGGGTTTTCCCAGCTGCAAGTGGTAACTTTCTACCTCCAACATGGCGGAAGCT  1850

Query 1851  CATGAGTGATCCTGATTCTAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTTGAATGGGAAGAAAT  1924
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATGAGTGACCCTGATTCCAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTTGAATGGGAAGAAAT  1924

Query 1925  ATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTCTTGCCATTCGTGGATGAGCGAAGGCTACGAGCTGCCCTAGAAGAGGTATAC  1998
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1925  ATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTATTGCCATTTGTGGATGAGCGAAGGCTGCGAGCGGCTCTAGAAGAGGTGTAC  1998

Query 1999  CCAGACCTCACTCCAGAAGAGACCAGAAGAAACAGCCTTGGAGGTGATGTCTTATTTGTGGGGAAACATCACCC  2072
            ||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||.|||.||
Sbjct 1999  CCAGACCTCACTCCAGAAGAGAACAGGAGAAATAGTCTTGGAGGTGATGTTTTGTTTGTGGGAAAACTTCATCC  2072

Query 2073  ACTCCATGACTTCATTTTAGAGCTGTACCAGACAGGTTCCACAGAGCCAGTGGAGGTACCCCCTGAACTATGTC  2146
            |||.|..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|.||||
Sbjct 2073  ACTACGCGACTTCATTTTAGAGCTGTATCAGACGGGTTCCACAGAGCCAGTTGATGTGCCACCTGAATTGTGTC  2146

Query 2147  ATGGGATTCAAGGAAAGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGATCAAAATAGTATGTTCTCCTGTTCC  2220
            |.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|||.|||||||||.|||||.||
Sbjct 2147  ACGGGATTCAAGGGACGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGA-CCAAACAGTATGTTCCCCTGTGCC  2219

Query 2221  TATGTTAAGGGATCTGACACAGAACACTGTAGTCAGTATTAATTTTAAAGACCCACAGTTTGCTGAAGATTACA  2294
            .|||||..||||.||||||||||||||||.||||||                         |..||||  ||||
Sbjct 2220  CATGTTGCGGGACCTGACACAGAACACTGCAGTCAG-------------------------GGAGAAG--TACA  2266

Query 2295  -TTTTTAAAGCTGTAATGCTTCCAGGAGCAAGAAAGCCAGCAGCAGTACTGAAACCTAGTGACTGGGAAAAATC  2367
             ..||.|||||   .|||||  ||..|||       |||.|| ||                      ||.||||
Sbjct 2267  GACTTGAAAGC---CATGCT--CATAAGC-------CCATCA-CA----------------------AACAATC  2305

Query 2368  CAGCAATGGACGGCAGTGGAAGCCTCAGCTTGGC---TTTAACCGTGACCGGAGGCCTGTGCAC-CTGGATCAG  2437
                  |||              |||    ||.|   ||||               .||||.|| |||.||   
Sbjct 2306  ------TGG--------------CTC----TGTCAAATTTA---------------TTGTGGACACTGCAT---  2337

Query 2438  GCAGCCTTCAGGACTTTGGGCCATGTGATGCCAAGAGGCTCAGGAACTGGCATTTACAGCAATGCTGCACCACC  2511
                                                                                      
Sbjct 2338  --------------------------------------------------------------------------  2337

Query 2512  ACCTGTGACTTACCAGGGAAACTTATACAGGCCGCTTTTGAGAGGACAAGCCCAGATTCCAAAACTTATGTCAA  2585
                                                                                      
Sbjct 2338  --------------------------------------------------------------------------  2337

Query 2586  ATATGAGGCCCCAGGATTCCTGGCGAGGTCCTCCTCCCCTTTTCCAGCAGCAAAGGTTTGACAGAGGCGTTGGG  2659
                                                                                      
Sbjct 2338  --------------------------------------------------------------------------  2337

Query 2660  GCTGAACCTCTGCTCCCATGGAACCGGATGCTGCAAACCCAGAATGCAGCCTTCCAGCCAAACCAGTACCAGAT  2733
                                                                                      
Sbjct 2338  --------------------------------------------------------------------------  2337

Query 2734  GCTAGCTGGGCCTGGTGGGTATCCACCCAGACGAGATGATCGTGGAGGGAGACAGGGATATCCCAGAGAAGGAA  2807
                                                                                      
Sbjct 2338  --------------------------------------------------------------------------  2337

Query 2808  GGAAATACCCTTTGCCACCACCCTCAGGAAGATACAATTGGAAT  2851
                                                        
Sbjct 2338  --------------------------------------------  2337