Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14172
• Subject: NM_001025445.2
• Aligned Length: 856
• Identities: 659
• Gaps: 122

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGGGGGTCAACCCCACCAGCATTGACTCGGGCGTCATCGGGAAGGACCAAGAGAAGAAGCTGCTGCCTGGTCA  74

Query   1  ----------ATGGTGAATGAACTTTATCCATATATTGTAGAGTTTGAGGAAGAGGCAAAGAACCCTGGCCTGG  64
                     ||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||.|||.||||..|||  
Sbjct  75  GGTTCTCCACATGGTGAATGGACTTTATCCATACATCGTAGAGTTTGAGGAAGTGGCAGAGAGCCCTAACCT--  146

Query  65  AAACACACAGGAAGAGAAAGAGATCAGGCAACAGTGATTCTATAGAAAGG-GATGCTGCTCAGGAAGCTGAGGC  137
            ||||||.||||||||||||||.||||   ||.|||     ||||..||| |||        ||||||||||.|
Sbjct 147  -AACACAGAGGAAGAGAAAGAGGTCAG---ACTGTG-----ATAGTGAGGAGAT--------GGAAGCTGAGTC  203

Query 138  TGGGACAGGGCTGGAACCTGGGAGCAACTCTGGCCAATGCTCTGTG-CCCCTAAAGAAGGGAAAAG-ATGCACC  209
           ||||||||||||||.|||||||||||.|.|..||||.||||||||| ||||| ||||| |||.||| |||.|.|
Sbjct 204  TGGGACAGGGCTGGCACCTGGGAGCAGCCCCAGCCAGTGCTCTGTGTCCCCT-AAGAA-GGACAAGAATGGAGC  275

Query 210  TATCAAAAAGGAATCCCTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGATTTCTATGCAGGACCCCAAAATGCAGGTTT  283
           .|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 276  CACCAAAAAGGAATCACTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGATGTCTATGAAAGACCCCAAAATGCAGGTTT  349

Query 284  ACAAAGATGAGCAGGTGGTGGTGATAAAGGATAAATACCCAAAGGCCCGTTACCATTGGCTGGTCTTACCGTGG  357
           |||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 350  ACAAAGACGACCAGGTGGTGGTGATTAAGGATAAATACCCCAAGGCCCGTCACCACTGGCTGGTCTTACCGTGG  423

Query 358  ACCTCCATTTCCAGTCTGAAGGCTGTGGCCAGGGAACACCTTGAACTCCTTAAGCATATGCACACTGTGGGGGA  431
           .|||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 424  GCCTCCATTTCCAGTCTGAAGGTTGTGACCAGTGAACACCTTGAACTTCTCAAACATATGCACGCTGTGGGGGA  497

Query 432  AAAGGTGATTGTAGATTTTGCTGGGTCCAGCAAACTCCGCTTCCGATTGGGCTACCACGCCATTCCGAGTATGA  505
           .||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 498  GAAGGTGATAGCAGATTTTGCTGGATCCAGCAAACTGCGCTTCCGATTGGGCTACCATGCCATTCCCAGCATGA  571

Query 506  GCCATGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTTGCCTTAAAAACAAAAAACATTGGAATTCT  579
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 572  GCCACGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTTGCCTTAAAAACAAAAAGCATTGGAATTCT  645

Query 580  TTCAATACAGAATACTTCCTAGAATCACAAGCTGTGATCGAGATGGTACAAGAGGCTGGTAGAGTAACTGTCCG  653
           ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||||.|||||...
Sbjct 646  TTTAATACAGAATACTTTCTGGAATCACAAGCTGTGATCAAGATGGTTCAGGAAGCCGGCAGAGTGACTGTTAA  719

Query 654  AGATGGGA--TGCCTGAGCTCTTGAAGCTGCCCCTTCGTTGTCATGAGTGCCAGCAGCTGCTGCCTTCCATTCC  725
           ||||||.|  ||  ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 720  AGATGGCACTTG--TGAGCTCTTGAAGCTGCCTCTCCGTTGCCATGAGTGTCAGCAGCTGCTGCCTTCCATCCC  791

Query 726  TCAGCTGAAAGAACATCTCAGGAAGCACTGGACACAG-----  762
           .|||||||||||.||.|||||||||||||||     |     
Sbjct 792  GCAGCTGAAAGAGCACCTCAGGAAGCACTGG-----GGCGGG  828