Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14172
- Subject:
- XM_006538171.3
- Aligned Length:
- 856
- Identities:
- 659
- Gaps:
- 122
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGTCAACCCCACCAGCATTGACTCGGGCGTCATCGGGAAGGACCAAGAGAAGAAGCTGCTGCCTGGTCA 74
Query 1 ----------ATGGTGAATGAACTTTATCCATATATTGTAGAGTTTGAGGAAGAGGCAAAGAACCCTGGCCTGG 64
||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||.|||.||||..|||
Sbjct 75 GGTTCTCCACATGGTGAATGGACTTTATCCATACATCGTAGAGTTTGAGGAAGTGGCAGAGAGCCCTAACCT-- 146
Query 65 AAACACACAGGAAGAGAAAGAGATCAGGCAACAGTGATTCTATAGAAAGG-GATGCTGCTCAGGAAGCTGAGGC 137
||||||.||||||||||||||.|||| ||.||| ||||..||| ||| ||||||||||.|
Sbjct 147 -AACACAGAGGAAGAGAAAGAGGTCAG---ACTGTG-----ATAGTGAGGAGAT--------GGAAGCTGAGTC 203
Query 138 TGGGACAGGGCTGGAACCTGGGAGCAACTCTGGCCAATGCTCTGTG-CCCCTAAAGAAGGGAAAAG-ATGCACC 209
||||||||||||||.|||||||||||.|.|..||||.||||||||| ||||| ||||| |||.||| |||.|.|
Sbjct 204 TGGGACAGGGCTGGCACCTGGGAGCAGCCCCAGCCAGTGCTCTGTGTCCCCT-AAGAA-GGACAAGAATGGAGC 275
Query 210 TATCAAAAAGGAATCCCTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGATTTCTATGCAGGACCCCAAAATGCAGGTTT 283
.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 276 CACCAAAAAGGAATCACTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGATGTCTATGAAAGACCCCAAAATGCAGGTTT 349
Query 284 ACAAAGATGAGCAGGTGGTGGTGATAAAGGATAAATACCCAAAGGCCCGTTACCATTGGCTGGTCTTACCGTGG 357
|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 350 ACAAAGACGACCAGGTGGTGGTGATTAAGGATAAATACCCCAAGGCCCGTCACCACTGGCTGGTCTTACCGTGG 423
Query 358 ACCTCCATTTCCAGTCTGAAGGCTGTGGCCAGGGAACACCTTGAACTCCTTAAGCATATGCACACTGTGGGGGA 431
.|||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 424 GCCTCCATTTCCAGTCTGAAGGTTGTGACCAGTGAACACCTTGAACTTCTCAAACATATGCACGCTGTGGGGGA 497
Query 432 AAAGGTGATTGTAGATTTTGCTGGGTCCAGCAAACTCCGCTTCCGATTGGGCTACCACGCCATTCCGAGTATGA 505
.||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 498 GAAGGTGATAGCAGATTTTGCTGGATCCAGCAAACTGCGCTTCCGATTGGGCTACCATGCCATTCCCAGCATGA 571
Query 506 GCCATGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTTGCCTTAAAAACAAAAAACATTGGAATTCT 579
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 572 GCCACGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTTGCCTTAAAAACAAAAAGCATTGGAATTCT 645
Query 580 TTCAATACAGAATACTTCCTAGAATCACAAGCTGTGATCGAGATGGTACAAGAGGCTGGTAGAGTAACTGTCCG 653
||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||||.|||||...
Sbjct 646 TTTAATACAGAATACTTTCTGGAATCACAAGCTGTGATCAAGATGGTTCAGGAAGCCGGCAGAGTGACTGTTAA 719
Query 654 AGATGGGA--TGCCTGAGCTCTTGAAGCTGCCCCTTCGTTGTCATGAGTGCCAGCAGCTGCTGCCTTCCATTCC 725
||||||.| || ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 720 AGATGGCACTTG--TGAGCTCTTGAAGCTGCCTCTCCGTTGCCATGAGTGTCAGCAGCTGCTGCCTTCCATCCC 791
Query 726 TCAGCTGAAAGAACATCTCAGGAAGCACTGGACACAG----- 762
.|||||||||||.||.||||||||||||||| |
Sbjct 792 GCAGCTGAAAGAGCACCTCAGGAAGCACTGG-----GGCGGG 828