Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14200
• Subject: NM_018717.5
• Aligned Length: 3415
• Identities: 3396
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCTGCCGCGAATGGCAGTAGTATTTGCATCAACAGTAGCCTGAACAGCAG  74
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Sbjct    1  ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCTGCCGCGAATGGCAGTAGTATTTGCATCAACAGTAGCCTGAACAGCAG  74

Query   75  CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGTGTGAATAATACTCCCAATAGTACTCCCGCTGCTCCGAGTAGCAATCACCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGTGTGAATAATACTCCCAATAGTACTCCCGCTGCTCCGAGTAGCAATCACCCGG  148

Query  149  CAGCCGGTGGATGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCGGTTCGGCGGCCGTTCCCAAGCACAGCACCGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCCGGTGGATGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCGGTTCGGCGGCCGTTCCCAAGCACAGCACCGTGGTG  222

Query  223  GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGTCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTACCAGCAGGCTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGTCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTACCAGCAGGCTCA  296

Query  297  GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTACCAGCGGACCCTGGAGCAGAGGGCCAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTACCAGCGGACCCTGGAGCAGAGGGCCAAGA  370

Query  371  AATCGGGCGCCGGCACCGGCAAACAGCAGCACCCGAGCAAACCCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCGGCGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCGGGCGCCGGCACCGGCAAACAGCAGCACCCGAGCAAACCCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCGGCGGAG  444

Query  445  CAGAGGAACCACACGCTGATCATGCTACAAGAGACTGTGAAAAGGAAGTTGGAAGGAGCTCGATCACCACTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAGGAACCACACGCTGATCATGCTACAAGAGACTGTGAAAAGGAAGTTGGAAGGAGCTCGATCACCACTTAA  518

Query  519  TGGAGACCAGCAGAATGGTGCTTGTGATGGGAATTTTTCTCCGACTAGCAAACGAATTCGAAAGGACATTTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGACCAGCAGAATGGTGCTTGTGATGGGAATTTTTCTCCGACTAGCAAACGAATTCGAAAGGACATTTCTG  592

Query  593  CGGGGATGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAGTAACATGCCACTGCCTTCAGCTTCTCCTCTTCACCAACTTGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGGGATGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAGTAACATGCCACTGCCTTCAGCTTCTCCTCTTCACCAACTTGAC  666

Query  667  CTGAAACCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGTGGAACTCACACTCCTGGGCTTCTAGAAGATCTAAGTAAGAATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGAAACCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGTGGAACTCACACTCCTGGGCTTCTAGAAGATCTAAGTAAGAATGG  740

Query  741  TAGGCTCCCTGAGATTAAACTTCCTGTCAACGGTTGCAGTGACCTGGAGGATAGCTTCACCATCTTGCAGAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGGCTCCCTGAGATTAAACTTCCTGTCAACGGTTGCAGTGACCTGGAGGATAGCTTCACCATCTTGCAGAGCA  814

Query  815  AAGACCTCAAACAAGAACCTCTCGATGACCCTACTTGCATAGACACATCAGAAACATCTCTTTCAAATCAGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGACCTCAAACAAGAACCTCTCGATGACCCTACTTGCATAGACACATCAGAAACATCTCTTTCAAATCAGAAC  888

Query  889  AAGCTGTTCTCAGACATTAATCTGAATGATCAGGAGTGGCAAGAATTAATAGATGAATTGGCCAACACGGTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCTGTTCTCAGACATTAATCTGAATGATCAGGAGTGGCAAGAATTAATAGATGAATTGGCCAACACGGTTCC  962

Query  963  TGAGGATGACATACAGGACCTGTTCAACGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCCAGAATTCTCGCAGCCAGCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGGATGACATACAGGACCTGTTCAACGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCCAGAATTCTCGCAGCCAGCAA  1036

Query 1037  CTGAGACCCCTCTCTCCCAGGAGAGTGCGAGCGTGAAGAGCGACCCCTCTCACTCTCCCTTCGCACATGTCTCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAGACCCCTCTCTCCCAGGAGAGTGCGAGCGTGAAGAGCGACCCCTCTCACTCTCCCTTCGCACATGTCTCC  1110

Query 1111  ATGGGATCTCCCCAGGCGAGGCCTTCTTCTTCTGGTCCTCCCTTTTCTACTGTCTCCACGGCCACTAGTTTACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGGATCTCCCCAGGCGAGGCCTTCTTCTTCTGGTCCTCCCTTTTCTACTGTCTCCACGGCCACTAGTTTACC  1184

Query 1185  TTCTGTTGCCAGCACTCCCGCAGCTCCAAACCCTGCAAGCTCACCAGCAAACTGTGCTGTCCAGTCCCCTCAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCTGTTGCCAGCACTCCCGCAGCTCCAAACCCTGCAAGCTCACCAGCAAACTGTGCTGTCCAGTCCCCTCAAA  1258

Query 1259  CTCCAAACCAAGCCCACACTCCAGGCCAAGCTCCACCTCGGCCTGGAAATGGTTATCTCCTGAATCCGGCAGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCAAACCAAGCCCACACTCCAGGCCAAGCTCCACCTCGGCCTGGAAATGGTTATCTCCTGAATCCGGCAGCA  1332

Query 1333  GTGACAGTGGCCGGTTCAGCGTCAGGGCCTGTGGCTGTGCCCAGCTCTGACATGTCTCCAGCAGAACAGCTCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGACAGTGGCCGGTTCAGCGTCAGGGCCTGTGGCTGTGCCCAGCTCTGACATGTCTCCAGCAGAACAGCTCAA  1406

Query 1407  ACAGATGGCTGCACAGCAGCAACAAAGGGCCAAACTCATGCAGCAGAAGCAGCAACAGCAA------------C  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||            |
Sbjct 1407  ACAGATGGCTGCACAGCAGCAACAAAGGGCCAAACTCATGCAGCAGAAACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAGC  1480

Query 1469  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTCAAATCAGACTTCAAATTGG  1542
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTCAAATCAGACTTCAAATTGG  1554

Query 1543  TCTCCCTTAGGACCTCCCTCTAGTCCATATGGAGCAGCTTTTACTGCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTA  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTCCCTTAGGACCTCCCTCTAGTCCATATGGAGCAGCTTTTACTGCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTA  1628

Query 1617  CCCCCAAGCCTTTAACAACCAAAACCCTATAGTGCCTCCAATGGCAAACAACCTGCAGAAGACAACAATGAATA  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCCAAGCCTTTAACAACCAAAACCCTATAGTGCCTCCAATGGCAAACAACCTGCAGAAGACAACAATGAATA  1702

Query 1691  ACTACCTCCCTCAGAATCACATGAATATGATCAATCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAA  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTACCTCCCTCAGAATCACATGAATATGATCAATCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAA  1776

Query 1765  CAGCACAATATTCTGACTTATGGCAACACTAAACCCCTGACCCACTTCAATGCAGACCTGAGTCAGAGGATGAC  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGCACAATATTCTGACTTATGGCAACACTAAACCCCTGACCCACTTCAATGCAGACCTGAGTCAGAGGATGAC  1850

Query 1839  ACCACCAGTGGCCAACCCCAACAAAAACCCCTTGATGCCGTATATCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGC  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCACCAGTGGCCAACCCCAACAAAAACCCCTTGATGCCGTATATCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGC  1924

Query 1913  AACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCACCTCCACAGCTCCAGGCCCCCAGGGCACACCTGAGCGAAGAC  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACCTCCACAGCTCCAGGCCCCCAGGGCACACCTGAGCGAAGAC  1998

Query 1987  CAGAAACGCCTGCTTCTCATGAAGCAGAAAGGAGTGATGAATCAGCCCATGGCTTACGCTGCACTTCCATCCCA  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGAAACGCCTGCTTCTCATGAAGCAGAAAGGAGTGATGAATCAGCCCATGGCTTACGCTGCACTTCCATCCCA  2072

Query 2061  CGGTCAGGAGCAGCATCCAGTTGGACTTCCCCGAACCACAGGCCCCATGCAGTCCTCCGTGCCCCCAGGCTCAG  2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGGTCAGGAGCAGCATCCAGTTGGACTTCCCCGAACCACAGGCCCCATGCAGTCCTCCGTGCCCCCAGGCTCAG  2146

Query 2135  GTGGCATGGTCTCAGGAGCCAGTCCCGCAGGCCCCGGCTTCCTGGGCAGCCAGCCCCAAGCAGCCATCATGAAG  2208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTGGCATGGTCTCAGGAGCCAGTCCCGCAGGCCCCGGCTTCCTGGGCAGCCAGCCCCAAGCAGCCATCATGAAG  2220

Query 2209  CAGATGCTCATTGATCAGCGGGCCCAGTTGATAGAGCAGCAGAAGCAACAGTTCCTGCGGGAGCAAAG---GCA  2279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
Sbjct 2221  CAGATGCTCATTGATCAGCGGGCCCAGTTGATAGAGCAGCAGAAGCAACAGTTCCTGCGGGAGCAAAGGCAGCA  2294

Query 2280  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATTTTGGCGGAACAGCAGTTGCAGCAATCACATCTACCCCGGCAGCACCTCC  2353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATTTTGGCGGAACAGCAGTTGCAGCAATCACATCTACCCCGGCAGCACCTCC  2368

Query 2354  AGCCACAGCGGAATCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAATCAGTTTCAAGGTTCTCCCCAGGATATAGCAGCCGTA  2427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCCACAGCGGAATCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAATCAGTTTCAAGGTTCTCCCCAGGATATAGCAGCCGTA  2442

Query 2428  AGAAGCCAAGCAGCCCTCCAGAGCATGCGAACGTCACGGCTGATGGCACAGAACGCAGGCATGATGGGAATAGG  2501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGAAGCCAAGCAGCCCTCCAGAGCATGCGAACGTCACGGCTGATGGCACAGAACGCAGGCATGATGGGAATAGG  2516

Query 2502  ACCCTCCCAGAACCCTGGGACGATGGCCACCGCAGCTGCGCAGTCGGAGATGGGACTGGCCCCTTATAGCACCA  2575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACCCTCCCAGAACCCTGGGACGATGGCCACCGCAGCTGCGCAGTCGGAGATGGGACTGGCCCCTTATAGCACCA  2590

Query 2576  CGCCTACCAGCCAACCAGGAATGTACAATATGAGCACAGGCATGACCCAAATGTTGCAGCATCCAAACCAAAGT  2649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGCCTACCAGCCAACCAGGAATGTACAATATGAGCACAGGCATGACCCAAATGTTGCAGCATCCAAACCAAAGT  2664

Query 2650  GGCATGAGCATCACACATAACCAAGCCCAGGGACCGAGGCAACCTGCCTCTGGGCAGGGGGTTGGAATGGTGAG  2723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGCATGAGCATCACACATAACCAAGCCCAGGGACCGAGGCAACCTGCCTCTGGGCAGGGGGTTGGAATGGTGAG  2738

Query 2724  TGGCTTTGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCAGCCATTACCCAGCAACATCCACAGATGAAAGGGCCAGTAGGCC  2797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGGCTTTGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCAGCCATTACCCAGCAACATCCACAGATGAAAGGGCCAGTAGGCC  2812

Query 2798  AGGCCTTGCCTAGGCCCCAAGCCCCTCCAAGGCTGCAGAGCCTTATGGGAACAGTCCAGCAAGGAGCACAAAGC  2871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGGCCTTGCCTAGGCCCCAAGCCCCTCCAAGGCTGCAGAGCCTTATGGGAACAGTCCAGCAAGGAGCACAAAGC  2886

Query 2872  TGGCAACAGAGGAGCTTGCAGGGCATGCCTGGGAGGACTAGTGGAGAATTGGGACCATTCAACAATGGCGCCAG  2945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TGGCAACAGAGGAGCTTGCAGGGCATGCCTGGGAGGACTAGTGGAGAATTGGGACCATTCAACAATGGCGCCAG  2960

Query 2946  CTACCCTCTTCAAGCTGGGCAGCCGAGACTGACCAAGCAGCACTTCCCACAGGGACTGAGCCAGTCAGTCGTGG  3019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTACCCTCTTCAAGCTGGGCAGCCGAGACTGACCAAGCAGCACTTCCCACAGGGACTGAGCCAGTCAGTCGTGG  3034

Query 3020  ATGCTAACACGGGCACAGTGAGGACCCTCAACCCAGCTGCCATGGGTCGGCAGATGATGCCATCGCTCCCGGGG  3093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATGCTAACACGGGCACAGTGAGGACCCTCAACCCAGCTGCCATGGGTCGGCAGATGATGCCATCGCTCCCGGGG  3108

Query 3094  CAGCAAGGCACCAGCCAGGCGATGGCCAATGGTCATGTCTGGCCTGAGCCAGGGAGTCCCAGGCATGCCAGCGT  3167
            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CAGCAAGGCACCAGCCAGGCGA-GGCCAATGGTCATGTCTGGCCTGAGCCAGGGAGTCCCAGGCATGCCAGCGT  3181

Query 3168  TCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATACCCAGTGGCAGCTTTGCTCCAAGCAGCCAGAGCCAAGCCTATGAG  3241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182  TCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATACCCAGTGGCAGCTTTGCTCCAAGCAGCCAGAGCCAAGCCTATGAG  3255

Query 3242  CGGAATGCCCCTCAGGACGTGTCATACAATTACAGTGGCGACGGAGCTGGGGGTTCCTTCCCTGGCCTCCCGGA  3315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3256  CGGAATGCCCCTCAGGACGTGTCATACAATTACAGTGGCGACGGAGCTGGGGGTTCCTTCCCTGGCCTCCCGGA  3329

Query 3316  CGGTGCAGACCTTGTGGACTCCATCATCAAAGGCGGGCCAGGGGACGAGTGGATGCAGGAGCTTGATGAATTGT  3389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3330  CGGTGCAGACCTTGTGGACTCCATCATCAAAGGCGGGCCAGGGGACGAGTGGATGCAGGAGCTTGATGAATTGT  3403

Query 3390  TTGGTAACCCC  3400
            |||||||||||
Sbjct 3404  TTGGTAACCCC  3414