Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14276
- Subject:
- XM_017016667.2
- Aligned Length:
- 1719
- Identities:
- 1531
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT 74
Query 75 CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC 148
Query 149 TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC 222
Query 223 GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT 296
Query 297 CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC 370
Query 371 GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC 444
Query 445 GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA 518
Query 519 GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC 592
Query 593 CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG 666
Query 667 GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC 740
Query 741 CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA 814
Query 815 GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC 888
Query 889 TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC 962
Query 963 CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC 1036
Query 1037 GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG 1110
Query 1111 CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC 1184
Query 1185 CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT 1258
Query 1259 TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGAGGAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGAGGAGAAG 1332
Query 1333 CAGCAGCG---GAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTGCCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAA 1403
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCAGCGGAAGAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTGCCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAA 1406
Query 1404 CCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGGCGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCG 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGGCGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCG 1480
Query 1478 GGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGA---------------GATG----GG------ 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|| ||
Sbjct 1481 GGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCGAGAG 1554
Query 1527 ------GGCAACA------------------------------------------------------------- 1533
||||.||
Sbjct 1555 TGTAATGGCACCATCTCAGCTCACTGCGACCTGCGCCTCCCACGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCA 1628
Query 1534 -------------------------------------------------------------------------- 1533
Sbjct 1629 AAGTGCTGGCATGACACGTGTGCATCACCATGCTCAGCTAATTTTTTTGCATCTTTTTGTAGAGATGGGGGTTT 1702
Query 1534 ----------------- 1533
Sbjct 1703 CACCCTGTTGCCCAGGC 1719