Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14287
• Subject: NM_001350269.2
• Aligned Length: 1641
• Identities: 1639
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGACTAAGAATAAGACAAGAGCCCAGGCCAAAACTGAAAAAAAGGCTGCTATACAAGCTAAAGCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGGACTAAGAATAAGACAAGAGCCCAGGCCAAAACTGAAAAAAAGGCTGCTATACAAGCTAAAGCTGG  74

Query   75  AGCAGAGAGGGAGGCTACTGGTGTTGTTAGGCCTGTAGCCAAGACCAGGGCCAAAGCAAAAGCCAAGACAGGGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAGAGAGGGAGGCTACTGGTGTTGTTAGGCCTGTAGCCAAGACCAGGGCCAAAGCAAAAGCCAAGACAGGGT  148

Query  149  CTAAGACAGATGCAGTAGCAGAGATGAAGGCAGTGTCTAAGAACAAGGTTGTTGCTGAGACGAAGGAAGGAGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTAAGACAGATGCAGTAGCAGAGATGAAGGCAGTGTCTAAGAACAAGGTTGTTGCTGAGACGAAGGAAGGAGCT  222

Query  223  CTGTCAGAGCCTAAGACTCTGGGCAAAGCCATGGGAGATTTCACTCCCAAGGCTGGGAATGAGTCCACCAGCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTCAGAGCCTAAGACTCTGGGCAAAGCCATGGGAGATTTCACTCCCAAGGCTGGGAATGAGTCCACCAGCTC  296

Query  297  CACATGTAAAAATGAGGCTGGTACTGATGCCTGGTTCTGGGCTGGGGAAGAGGCCACTATCAATTCCTGGTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACATGTAAAAATGAGGCTGGTACTGATGCCTGGTTCTGGGCTGGGGAAGAGGCCACTATCAATTCCTGGTTCT  370

Query  371  GGAATGGAGAAGAGGCTGGTAATAGTTTCAGCACTAAGAATGATAAACCTGAAATTGGTGCCCAGGTCTGTGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAATGGAGAAGAGGCTGGTAATAGTTTCAGCACTAAGAATGATAAACCTGAAATTGGTGCCCAGGTCTGTGCT  444

Query  445  GAGGAGTTGGAACCTGCGGCTGGGGCCGATTGCAAACCTAGGTCAGGGGCTGAGGAGGAGGAGGAAGAGAATGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGAGTTGGAACCTGCGGCTGGGGCCGATTGCAAACCTAGGTCAGGGGCTGAGGAGGAGGAGGAAGAGAATGT  518

Query  519  TATTGGGAACTGGTTTTGGGAAGGAGATGATACTAGTTTTGACCCTAATCCTAAACCTGTGAGCAGGATAGTTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATTGGGAACTGGTTTTGGGAAGGAGATGATACTAGTTTTGACCCTAATCCTAAACCTGTGAGCAGGATAGTTA  592

Query  593  AGCCTCAGCCTGTGTATGAAATTAATGAAAAAAATAGGCCCAAGGACTGGTCTGAGGTAACTATCTGGCCCAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTCAGCCTGTGTATGAAATTAATGAAAAAAATAGGCCCAAGGACTGGTCTGAGGTAACTATCTGGCCCAAT  666

Query  667  GCCCCTGCTGTAACTCCAGCTGTGTTAGGATTTAGATCACAGGCACCATCTGAGGCAAGCCCTCCTTCATATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCCTGCTGTAACTCCAGCTGTGTTAGGATTTAGATCCCAGGCACCATCTGAGGCAAGCCCTCCTTCATATAT  740

Query  741  TGTTCTGGCCTCCGCTGAAGAAAATGCCTGTTCTTTGCCTGTGGCAACAGCTTGCCGCCCTTCTAGGAACACTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTTCTGGCCTCCGCTGAAGAAAATGCCTGTTCTTTGCCTGTGGCAACAGCTTGCCGCCCTTCTAGGAACACTC  814

Query  815  GCTCATGCTCACAGCCTATCCCTGAGTGTCGTTTTGATTCTGACCCCTGCATCCAGACCATAGATGAGATTAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTCATGCTCACAGCCTATCCCTGAGTGTCGTTTTGATTCTGACCCCTGCATCCAGACCATAGATGAGATTAGA  888

Query  889  CGTCAAATCAGGATCAGGGAGGTAAATGGGATTAAGCCATTTGCTTGTCCTTGCAAAATGGAATGCTATATGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGTCAAATCAGGATCAGGGAGGTAAATGGGATTAAGCCATTTGCTTGTCCTTGCAAAATGGAATGCTATATGGA  962

Query  963  TTCTGAGGAATTTGAAAAACTTGTTAGCTTACTTAAGTCAACTACTGATCCTCTTATTCATAAAATAGCACGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCTGAGGAATTTGAAAAACTTGTTAGCTTACTTAAGTCAACTACTGATCCTCTTATTCATAAAATAGCACGGA  1036

Query 1037  TTGCAATGGGTGTCCATAATGTTCACCCATTTGCCCAAGAGTTTATTAACGAAGTAGGTGTAGTGACACTTATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAATGGGTGTCCATAATGTTCACCCATTTGCCCAAGAGTTTATTAACGAAGTAGGTGTAGTGACACTTATT  1110

Query 1111  GAAAGCTTGCTCAGTTTTCCTTCCCCTGAAATGAGAAAAAAGACTGTAATTACTCTGAATCCTCCTTCTGGGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAAGCTTGCTCAGTTTTCCTTCCCCTGAAATGAGAAAAAAGACTGTAATTACTCTGAATCCTCCTTCTGGGGA  1184

Query 1185  TGAAAGACAACGCAAAATTGAATTACATGTTAAGCATATGTGTAAAGAAACCATGTCATTTCCTTTGAACTCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAAGACAACGCAAAATTGAATTACATGTTAAGCATATGTGTAAAGAAACCATGTCATTTCCTTTGAACTCAC  1258

Query 1259  CGGGACAGCAATCTGGATTAAAGATACTAGGACAACTGACTACTGATTTTGTCCATCACTACATTGTTGCCAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGGACAGCAATCTGGATTAAAGATACTAGGACAACTGACTACTGATTTTGTCCATCACTACATTGTTGCCAAT  1332

Query 1333  TACTTTTCAGAGCTTTTCCATTTGCTGTCCTCAGGAAATTGCAAAACCAGAAATCTTGTTTTGAAACTACTTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACTTTTCAGAGCTTTTCCATTTGCTGTCCTCAGGAAATTGCAAAACCAGAAATCTTGTTTTGAAACTACTTTT  1406

Query 1407  AAATATGTCTGAAAATCCAACTGCAGCCAGAGACATGATCAATATGAAGGCATTGGCAGCATTAAAACTCATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAATATGTCTGAAAATCCAACTGCAGCCAGAGACATGATCAATATGAAGGCATTGGCAGCATTAAAACTCATCT  1480

Query 1481  TTAACCAGAAAGAGGCAAAAGCCAATCTTGTTAGTGGTGTGGCCATATTTATTAACATAAAGGAGCATATCAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAACCAGAAAGAGGCAAAAGCCAATCTTGTTAGTGGTGTGGCCATATTTATTAACATAAAGGAGCATATCAGA  1554

Query 1555  AAAGGCTCAATTGTAGTTGTTGATCACTTGAGTTATAATACACTCATGGCCATTTTCAGGGAAGTT-AAGAGAT  1627
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1555  AAAGGCTCAATTGTAGTTGTTGATCACTTGAGTTATAATACACTCATGGCCATTTTCAGGGAAGTTAAAGAGAT  1628

Query 1628  TATTGAAACAATG  1640
            |||||||||||||
Sbjct 1629  TATTGAAACAATG  1641