Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14311
• Subject: XM_017020033.2
• Aligned Length: 2054
• Identities: 1945
• Gaps: 106

Alignment

Query    1  ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA  74

Query   75  ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG  148

Query  149  TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA  222

Query  223  TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGTAGACT--CCAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATCAC  294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||  |.||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  223  TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGT-CACTCACGAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATC-C  294

Query  295  AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA  368

Query  369  TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC  442
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  369  TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTG------------------------------------------------  394

Query  443  AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG  516
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  395  ------------------------------------------------------AGGACAAAGATATTATTGAG  414

Query  517  GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC  488

Query  591  GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC  562

Query  665  TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG  636

Query  739  AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC  710

Query  813  GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC  784

Query  887  TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA  858

Query  961  AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG  932

Query 1035  GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA  1006

Query 1109  AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTAAG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1007  AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTACG  1080

Query 1183  CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT  1154

Query 1257  TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA  1228

Query 1331  ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG  1302

Query 1405  GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC  1376

Query 1479  CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC  1450

Query 1553  CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA  1524

Query 1627  ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC  1598

Query 1701  GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA  1672

Query 1775  CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA  1746

Query 1849  AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747  AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC  1820

Query 1923  TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821  TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA  1894

Query 1997  CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT  2052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895  CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT  1950