Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14382
• Subject: XM_006534522.3
• Aligned Length: 954
• Identities: 840
• Gaps: 2

Alignment

Query   1  ATGGCTCTCCCTATCATTGTAAAATGGGGTGGACAGGAGTATTCAGTGACCACACTTTCAGAAGATGATACTGT  74
           |||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCACTCCCCATCATAGTGAAATGGGGTGGGCAGGAGTACTCAGTGACCACGCTCTCAGAAGATGATACTGT  74

Query  75  GCTCGATCTCAAACAGTTTCTCAAGACCCTTACAGGAGTTCTTCCAGAACGCCAAAAGTTACTTGGACTCAAAG  148
           |||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  75  GCTGGATCTTAAACAGTTCCTCAAGACCCTTACGGGAGTGCTCCCAGAACGCCAGAAGTTACTAGGGCTCAAAG  148

Query 149  TTAAAGGCAAACCTGCAGAAAATGATGTTAAGCTTGGAGCTCTCAAACTGAAACCAAATACTAAAATCATGATG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTAAAGGCAAACCTGCAGAAAATGATGTTAAGCTTGGAGCTCTCAAACTGAAACCAAATACTAAAATCATGATG  222

Query 223  ATGGGAACTCGTGAGGAGAGCTTGGAAGATGTCTTAGGTCCACCCCCTGACAATGATGATGTTGTTAATGACTT  296
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct 223  ATGGGAACTCGAGAGGAGAGCTTGGAAGATGTCTTATGTCCTCCTCCTGACAATGATGATGTCATCAATGATTT  296

Query 297  TGATATTGAAGATGAAGTAGTTGAAGTAGAAAATAGGGAAGAAAACCTACTGAAAATTTCTCGCAGAGTGAAAG  370
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|.|||||||||||.||.|
Sbjct 297  TGACATTGAAGATGAAGTAGTTGAAGTAGAAAATAGGGAGGAAAACCTCCTGAAGGTCTCTCGCAGAGTCAAGG  370

Query 371  AGTACAAAGTGGAAATTTTGAATCCTCCCAGGGAAGGGAAAAAGCTTTTGGTGCTAGATGTTGATTATACATTA  444
           |||||||.|||||..|..||||.||||||.||||.||.||.|||||..|||||||.||||||||.||||||.|.
Sbjct 371  AGTACAAGGTGGAGGTGCTGAACCCTCCCCGGGAGGGCAAGAAGCTCCTGGTGCTGGATGTTGACTATACACTG  444

Query 445  TTTGACCACAGGTCTTGTGCAGAGACTGGGGTAGAATTAATGCGGCCATATCTTCATGAATTTCTAACATCTGC  518
           |||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TTTGATCATAGGTCTTGTGCAGAGACTGGGGTAGAGCTAATGAGACCATATCTTCATGAATTTCTAACATCTGC  518

Query 519  CTATGAAGATTATGACATTGTTATTTGGTCTGCAACAAATATGAAGTGGATTGAAGCTAAAATGAAAGAGCTGG  592
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ATATGAAGATTATGACATTGTTATTTGGTCTGCAACAAATATGAAGTGGATTGAAGCTAAAATGAAAGAGCTGG  592

Query 593  GAGTGAGCACAAATGCAAATTATAAGATTACTTTCATGTTGGATAGTGCTGCTATGATAACAGTACATACTCCA  666
           |.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 593  GCGTGAGCACAAATGCCAACTATAAGATTACCTTCATGCTGGACAGTGCGGCCATGATCACTGTGCACACGCCC  666

Query 667  AGGAGAGGATTAATAGACGTAAAGCCTCTTGGTGTTATATGGGGAAAGTTTTCGGAGTTTTACAGCAAGAAAAA  740
           .|||||||..|.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 667  CGGAGAGGGCTCATTGACGTGAAGCCTCTTGGTGTCATTTGGGGAAAGTTTTCTGAATTCTACAGCAAAAAGAA  740

Query 741  CACCATTATGTTTGATGACATAGGGAGAAATTTTCTAATGAACCCACAGAATGGACTAAAGATAAGGCCTTTTA  814
           ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 741  CACCATTATGTTTGATGATATAGGAAGAAATTTTCTAATGAATCCACAAAATGGACTGAAGATAAGGCCTTTCA  814

Query 815  TGAAAGCGCACCTAAATCGTGATAAAGACAAAGAACTTTTAAAATTAACTCAGTACCTCAAGGAGATAGCAAAA  888
           |||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||..|.||..|.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 815  TGAAAGCTCATCTAAACCGTGATAAAGACAAGGAACTGGTGAAGCTCACTCAGTACCTCAAGGAGATCGCTAAG  888

Query 889  TTAGATGACTTTTTGGATCTAAATCACAAATATTGGGAAAGATATCTCTCAAAGA--CAAGGACAG  952
           .|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||  |||||||||
Sbjct 889  CTTGATGACTTCTTGGAGCTGAATCACAAGTACTGGGAGAGGTATCTATCAAAGAAGCAAGGACAG  954