Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14427
Subject:
NM_001330585.2
Aligned Length:
854
Identities:
517
Gaps:
333

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MMPGPRPRKGPQARGQGVAAAKQMGLFMEFGPEDMLLGMDEAEDDEDLEAELLALTGEAQTTGKKPAPKGQAPL  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  PMAHIEKLAADCMRDVEEEEEEEGLEEDAELLTELQEVLGVDEETEPLDGDEVADPGGSEEENGLEDTEPPVQT  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  AVLTASAPAAQAGASQGLHALLEERIHNYREAAASAKEAGEAAKARRCERGLKTLESQLASVRRGRKINEDEIP  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 223  PPVALGKRPLAPQEPANRSPETDPPAPPALESDNPSQPETSLPGISAQPVSDLDPDPRALLSSRQREYKVAALS  296

Query   1  -------------MRIGKRFGAVLEALEKGQPVDLSAMPPAPEDLKPQQASQAPTAPSVIPPAVERVQPVMAPD  61
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AKRAGELDRARELMRIGKRFGAVLEALEKGQPVDLSAMPPAPEDLKPQQASQAPTAPSVIPPAVERVQPVMAPD  370

Query  62  VPATPVAPTESQTVLDALQQRLNKYREAGIQARSGGDERKARMHERIAKQYQDAIRAHRAGRKVNFAELPVPPG  135
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  VPATPVAPTESQTVLDALQQRLNKYREAGIQARSGGDERKARMHERIAKQYQDAIRAHRAGRKVNFAELPVPPG  444

Query 136  FPPIPGLESTMGVEEDAVAATLAAAEKLASAEDSAPADKDEDEGEPPAQAPVAKKPARPTVPSSQRLPEPRASS  209
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  FPPIPGLESTMGVEEDAVAATLAAAEKLASAEDSAPADKDEDEGEPPAQAPVAKKPARPTVPSSQRLPEPRASS  518

Query 210  SKESPSPSVREQLALLEARKLQYQRAALQAKRSQDLEQAKAYLRVAKWLEAQIIQARSGRPVDLSKVPSPLTDE  283
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  SKESPSPSVREQLALLEARKLQYQRAALQAKRSQDLEQAKAYLRVAKWLEAQIIQARSGRPVDLSKVPSPLTDE  592

Query 284  EGDFILIHHEDLRLSQKAEEVYAQLQKMLLEQQEKCLLFSKQFMHQGNVAETTRFEKLAQDRKKQLEILQLAQA  357
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  EGDFILIHHEDLRLSQKAEEVYAQLQKMLLEQQEKCLLFSKQFMHQGNVAETTRFEKLAQDRKKQLEILQLAQA  666

Query 358  QGLDPPTHHFELKTFQTVRIFSELNSTEMHLIIVRGMNLPAPPGVTPDDLDAFVRFEFHYPNSDQAQKSKTAVV  431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  QGLDPPTHHFELKTFQTVRIFSELNSTEMHLIIVRGMNLPAPPGVTPDDLDAFVRFEFHYPNSDQAQKSKTAVV  740

Query 432  KNTNSPEFDQLFKLNINRNHRGFKRVIQSKGIKFEIFHKGSFFRSDKLVGTAHLKLERLENECEIREIVEVLDG  505
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  KNTNSPEFDQLFKLNINRNHRGFKRVIQSKGIKFEIFHKGSFFRSDKLVGTAHLKLERLENECEIREIVEVLDG  814

Query 506  RKPTGGKLEVKPMASTRR----------------------  523
           |||||||||||  ...|.                      
Sbjct 815  RKPTGGKLEVK--VRLREPLSGQDVQMVTENWLVLEPRGL  852