Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14427
• Subject: XM_006503154.2
• Aligned Length: 1817
• Identities: 1361
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCAGGCAACCTTTCCCAGCCCGAGTCCAGCCTCCCTGCCATTGCTCCCTTGCCTGATTCAGACCCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCACAAGCCCTGCTGTTAGCCCGACAGAGAGAGTACAAGGCGGCTGCTCTCGATGCCAAGCGGGCTGGAGATC  148

Query    1  --------------------ATGAGGATTGGGAAGAGATTCGGTGCTGTCCTGGAGGCCCTGGAGAAGGGGCAG  54
                                ||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TAGACCGTGCTCGGGAGCTCATGAGGATCGGGAAGAGATTTGGTACTGTCCTAGAGGCCCTGGAAAAGGGTCAG  222

Query   55  CCCGTGGATCTGAGTGCCATGCCCCCGGCACCTGAGGATCTGAAG-----CCCCAGCAGGCTTCTCAGGCTCCC  123
            ||.|||||.|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||     ||||  |||||||||.||||..||
Sbjct  223  CCTGTGGACCTGAGTGGCATGCCCCCAGCACCTGCGGATCTGAAGGCCCTCCCC--CAGGCTTCTAAGGCCTCC  294

Query  124  ACAGCACCCTCAGTCATTCCCCCAGCCGTGGAGCGAGTGCAGCCAGTGATGGCCCCTGACGTCCCAGCAACCCC  197
            .|||||.||..||.|.|..|||||||.||.||||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||
Sbjct  295  TCAGCAACCCAAGGCCTGTCCCCAGCAGTAGAGCAAATGCAGCCAGTGATGGCCTCTGACCTCCCAGCCACCCC  368

Query  198  AGTGGCCCCTACAGAGTC-ACAGACAGTGCTGGATGCCCTGCAGCAGAGGCTGAACAAGTACCGCGAGGCGGGC  270
            ||||||||||.|.|||.| ||| ||||||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  369  AGTGGCCCCTGCGGAGCCAACA-ACAGTGCTGGATGCTTTACAGCAAAGGCTGAACAAGTATCGTGAGGCAGGC  441

Query  271  ATCCAGGCCCGGAGTGG----TGGGGACGAGCGCAAGGCTCGGATGCATGAGCGCATTGCCAAGCAATATCAAG  340
            |||||||||||    ||    ||||||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  442  ATCCAGGCCCG----GGCCAATGGGGATGAGCGCAAGGCCAGGATGCACGATCGCATTGCCAAGCAATATCAGG  511

Query  341  ATGCTATTCGAGCACACCGAGCAGGACGGAAAGTCAACTTTGCTGAATTGCCTGTTCCTCCAGGATTTCCCCCC  414
            |||||.|||||||.||.|..|||||||.||||||..|||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  512  ATGCTGTTCGAGCTCATCAGGCAGGACAGAAAGTTGACTTTGCCGAGTTACCTGTTCCTCCAGGATTTCCTCCC  585

Query  415  ATCCCTGGCCTGGAGTCCACTATGGGTGTTGAGGAGGACGCAGTGGCAGCGACATTGGCAGCTGCAGAGAAACT  488
            |||||||||||||||.|||..|..|||..||||.||||..||||||||||.||.||.|||.||||..|.|||||
Sbjct  586  ATCCCTGGCCTGGAGCCCAGGAAAGGTAGTGAGCAGGATTCAGTGGCAGCAACTTTAGCAACTGCCCAAAAACT  659

Query  489  GGCCTCTGCAGAGGATTCAGCCCCGGCTGATAAAGACGAGGACGAGGGTGAGCCCCCAGCACAGGCCCCAGTGG  562
            |||||   ||||.|||.||||||.||..|||   |||||.||.|||.||||..|.|||||||||||||||.|||
Sbjct  660  GGCCT---CAGAAGATGCAGCCCTGGTAGAT---GACGACGAGGAGAGTGACACTCCAGCACAGGCCCCATTGG  727

Query  563  CCAAGAAACCTGCACGGCCCACAGTCCCTTCATCCCAGCGCCTGCCTGAGCCCAGGGCCTCAAGTTCTAAGGAG  636
            |||||||.||.||.|.|.|....|||.||.|||||||.|..|||.|||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  728  CCAAGAAGCCAGCGCAGACTCTGGTCTCTCCATCCCATCTTCTGACTGAGCCCAAGGCTTCAAGTTCTAAGGAG  801

Query  637  TCACCGAGTCCATCTGTGCGGGAGCAGCTGGCACTGCTGGAGGCACGGAAACTGCAGTATCAGCGGGCAGCCCT  710
            ||||.||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  802  TCACTGAGTCCATCTGTTCGGGAGCAGGTGACACTGCTGGAGGCTCGGAAACTGCAATACCAGCGAGCAGCTCT  875

Query  711  GCAGGCCAAGCGCAGCCAGGACCTGGAGCAGGCCAAAGCCTATCTGCGGGTAGCCAAATGGCTTGAGGCTCAGA  784
            |||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||.|..|.||.|||||.|||.|.|||||||||||||
Sbjct  876  GCAAGCCAAGCGCAGGCAGGATCTTGAGCAGGCCAAATCCCACTTACGAGTAGCTAAAAGTCTTGAGGCTCAGA  949

Query  785  TCATCCAGGCCCGATCTGG-CAGACCTGTTGATCTGTCCAAGGTGCCTTCGCCCTTGACGGATGAGGAGGGTGA  857
            ||||||||||||||.|||| || |||..|||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  950  TCATCCAGGCCCGAGCTGGTCA-ACCCATTGATCTCTCCAAGGTGCCTTCACCGTTGACAGATGAAGAGGGGGA  1022

Query  858  CTTCATCCTCATCCACCATGAGGACCTGCGACTCTCCCAGAAGGCGGAGGAGGTGTATGCCCAGCTGCAAAAAA  931
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1023  CTTCATCCTCATTCACCATGAGGATCTGCGACTCTCCCAGAAGGCTGAGGAGGTGTATGCCCAGCTACAGAAAA  1096

Query  932  TGCTTCTGGAGCAACAAGAGAAGTGCCTGCTGTTCTCCAAGCAGTTCATGCACCAGGGCAACGTGGCTGAGACC  1005
            ||||.|.||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1097  TGCTCCAGGAGCAGCAAGCGAAGTGCCTGCTATTCTCCAAGCAGTACATGCACCAGGGAAATGTGGCTGAGACC  1170

Query 1006  ACCCGATTTGAGAAGCTTGCTCAGGACCGCAAGAAACAGCTGGAGATCCTGCAGCTGGCCCAGGCTCAGGGCCT  1079
            ||.||.|||||||.||||||..|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1171  ACTCGGTTTGAGAGGCTTGCGGAGGACCGAAAGAAACAGCTTGAGATCCTGCAGCTAGCCCAAGCCCAGGGCCT  1244

Query 1080  CGACCCTCCCACCCACCACTTTGAGTTGAAGACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAG  1153
            .||||||||.|..||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  TGACCCTCCTAGTCATCACTTTGAGCTGAAGACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAG  1318

Query 1154  AAATGCATCTGATCATTGTCCGGGGAATGAACCTCCCAGCCCCTCCAGGGGTGACTCCCGATGACCTGGATGCT  1227
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 1319  AAATGCATCTGATCATCGTGCGGGGAATGAACCTCCCAGCCCCGCCAGGAGTGACTCCGGATGACTTGGATGCT  1392

Query 1228  TTTGTGCGGTTTGAGTTTCACTACCCTAACTCGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTGAAGAACAC  1301
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1393  TTTGTACGGTTTGAGTTTCACTACCCTAACTCGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTAAAAAATAC  1466

Query 1302  AAACTCTCCAGAATTTGATCAACTCTTCAAACTAAACATCAACCGAAACCACCGGGGCTTCAAGAGGGTGATCC  1375
            .||.||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|.|||.|||||||
Sbjct 1467  CAATTCTCCAGAATTTGAACAAGTTTTCAAGCTAAACATCAATCGAAACCACCGAGGCTTTAGGAGAGTGATCC  1540

Query 1376  AGAGCAAAGGCATCAAGTTTGAGATCTTCCACAAAGGGTCCTTCTTCAGAAGCGACAAGCTGGTTGGCACAGCA  1449
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1541  AGAGCAAAGGAATCAAATTTGAGATCTTCCACAAAGGATCCTTTTTTAGAAGTGACAAGCTGGTTGGCACAGCA  1614

Query 1450  CACCTGAAACTGGAGCGGCTGGAGAATGAGTGTGAGATCAGAGAAATTGTGGAGGTCCTGGATGGAAGGAAGCC  1523
            |||.|||||.||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||..|||||||..|||||||.||.|||||
Sbjct 1615  CACTTGAAATTGGAAAGGCTGGAGAAGGAGTGTGAGATCAGAGAGATCATGGAGGTTTTGGATGGCAGAAAGCC  1688

Query 1524  CACCGGGGGGAAGCTGGAGGTGAAGCCGATG--------GCC----AGCA-CCAGGAGATGAGTCAGGCCGCGA  1584
            |||.|||||||||||||||||||||..||.|        |||    |||| ||||||..||   |||.|.|..|
Sbjct 1689  CACTGGGGGGAAGCTGGAGGTGAAGGTGAGGCTTCGGGAGCCTCTGAGCAGCCAGGACGTG---CAGACGGTCA  1759

Query 1585  CTGTGCAGGAGA-----------------------------  1596
            ||      ||||                             
Sbjct 1760  CT------GAGAACTGGCTGGTCCTGGAGCCTCGGGGCCTG  1794