Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14427
• Subject: XM_017000559.1
• Aligned Length: 1637
• Identities: 1579
• Gaps: 49

Alignment

Query    1  ATGAGGATTGGGAAGAGATTCGGTGCTGTCCTGGAGGCCCTGGAGAAGGGGCAGCCCGTGGATCTGAGTGCCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGATTGGGAAGAGATTCGGTGCTGTCCTGGAGGCCCTGGAGAAGGGGCAGCCCGTGGATCTGAGTGCCAT  74

Query   75  GCCCCCGGCACCTGAGGATCTGAAGCCCCAGCAGGCTTCTCAGGCTCCCACAGCACCCTCAGTCATTCCCCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCCCGGCACCTGAGGATCTGAAGCCCCAGCAGGCTTCTCAGGCTCCCACAGCACCCTCAGTCATTCCCCCAG  148

Query  149  CCGTGGAGCGAGTGCAGCCAGTGATGGCCCCTGACGTCCCAGCAACCCCAGTGGCCCCTACAGAGTCACAGACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGGAGCGAGTGCAGCCAGTGATGGCCCCTGACGTCCCAGCAACCCCAGTGGCCCCTACAGAGTCACAGACA  222

Query  223  GTGCTGGATGCCCTGCAGCAGAGGCTGAACAAGTACCGCGAGGCGGGCATCCAGGCCCGGAGTGGTGGGGACGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTGGATGCCCTGCAGCAGAGGCTGAACAAGTACCGCGAGGCGGGCATCCAGGCCCGGAGTGGTGGGGACGA  296

Query  297  GCGCAAGGCTCGGATGCATGAGCGCATTGCCAAGCAATATCAAGATGCTATTCGAGCACACCGAGCAGGACGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGCAAGGCTCGGATGCATGAGCGCATTGCCAAGCAATATCAAGATGCTATTCGAGCACACCGAGCAGGACGGA  370

Query  371  AAGTCAACTTTGCTGAATTGCCTGTTCCTCCAGGATTTCCCCCCATCCCTGGCCTGGAGTCCACTATGGGTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCAACTTTGCTGAATTGCCTGTTCCTCCAGGATTTCCCCCCATCCCTGGCCTGGAGTCCACTATGGGTGTT  444

Query  445  GAGGAGGACGCAGTGGCAGCGACATTGGCAGCTGCAGAGAAACTGGCCTCTGCAGAGGATTCAGCCCCGGCTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGAGGACGCAGTGGCAGCGACATTGGCAGCTGCAGAGAAACTGGCCTCTGCAGAGGATTCAGCCCCGGCTGA  518

Query  519  TAAAGACGAGGACGAGGGTGAGCCCCCAGCACAGGCCCCAGTGGCCAAGAAACCTGCACGGCCCACAGTCCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAAGACGAGGACGAGGGTGAGCCCCCAGCACAGGCCCCAGTGGCCAAGAAACCTGCACGGCCCACAGTCCCTT  592

Query  593  CATCCCAGCGCCTGCCTGAGCCCAGGGCCTCAAGTTCTAAGGAGTCACCGAGTCCATCTGTGCGGGAGCAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATCCCAGCGCCTGCCTGAGCCCAGGGCCTCAAGTTCTAAGGAGTCACCGAGTCCATCTGTGCGGGAGCAGCTG  666

Query  667  GCACTGCTGGAGGCACGGAAACTGCAGTATCAGCGGGCAGCCCTGCAGGCCAAGCGCAGCCAGGACCTGGAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCACTGCTGGAGGCACGGAAACTGCAGTATCAGCGGGCAGCCCTGCAGGCCAAGCGCAGCCAGGACCTGGAGCA  740

Query  741  GGCCAAAGCCTATCTGCGGGTAGCCAAATGGCTTGAGGCTCAGATCATCCAGGCCCGATCTGGCAGACCTGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCAAAGCCTATCTGCGGGTAGCCAAATGGCTTGAGGCTCAGATCATCCAGGCCCGATCTGGCAGACCTGTTG  814

Query  815  ATCTGTCCAAGGTGCCTTCGCCCTTGACGGATGAGGAGGGTGACTTCATCCTCATCCACCATGAGGACCTGCGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCTGTCCAAGGTGCCTTCGCCCTTGACGGATGAGGAGGGTGACTTCATCCTCATCCACCATGAGGACCTGCGA  888

Query  889  CTCTCCCAGAAGGCGGAGGAGGTGTATGCCCAGCTGCAAAAAATGCTTCTGGAGCAACAAGAGAAGTGCCTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCTCCCAGAAGGCGGAGGAGGTGTATGCCCAGCTGCAAAAAATGCTTCTGGAGCAACAAGAGAAGTGCCTGCT  962

Query  963  GTTCTCCAAGCAGTTCATGCACCAGGGCAACGTGGCTGAGACCACCCGATTTGAGAAGCTTGCTCAGGACCGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCTCCAAGCAGTTCATGCACCAGGGCAACGTGGCTGAGACCACCCGATTTGAGAAGCTTGCTCAGGACCGCA  1036

Query 1037  AGAAACAGCTGGAGATCCTGCAGCTGGCCCAGGCTCAGGGCCTCGACCCTCCCACCCACCACTTTGAGTTGAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAACAGCTGGAGATCCTGCAGCTGGCCCAGGCTCAGGGCCTCGACCCTCCCACCCACCACTTTGAGTTGAAG  1110

Query 1111  ACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAGAAATGCATCTGATCATTGTCCGGGGAATGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACATTCCAGACTGTGAGGATCTTCTCAGAACTCAACAGCACAGAAATGCATCTGATCATTGTCCGGGGAATGAA  1184

Query 1185  CCTCCCAGCCCCTCCAGGGGTGACTCCCGATGACCTGGATGCTTTTGTGCGGTTTGAGTTTCACTACCCTAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCCCAGCCCCTCCAGGGGTGACTCCCGATGACCTGGATGCTTTTGTGCGGTTTGAGTTTCACTACCCTAACT  1258

Query 1259  CGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTGAAGAACACAAACTCTCCAGAATTTGATCAACTCTTCAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGACCAGGCTCAAAAAAGCAAAACAGCTGTGGTGAAGAACACAAACTCTCCAGAATTTGATCAACTCTTCAAA  1332

Query 1333  CTAAACATCAACCGAAACCACCGGGGCTTCAAGAGGGTGATCCAGAGCAAAGGCATCAAGTTTGAGATCTTCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTAAACATCAACCGAAACCACCGGGGCTTCAAGAGGGTGATCCAGAGCAAAGGCATCAAGTTTGAGATCTTCCA  1406

Query 1407  CAAAGGGTCCTTCTTCAGAAGCGACAAGCTGGTTGGCACAGCACACCTGAAACTGGAGCGGCTGGAGAATGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAAGGGTCCTTCTTCAGAAGCGACAAGCTGGTTGGCACAGCACACCTGAAACTGGAGCGGCTGGAGAATGAGT  1480

Query 1481  GTGAGATCAGAGAAATTGTGGAGGTCCTGGATGGAAGGAAGCCCACCGGGGGGAAGCTGGAGGTGAAGCCGATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||  
Sbjct 1481  GTGAGATCAGAGAAATTGTGGAGGTCCTGGATGGAAGGAAGCCCACCGGGGGGAAGCTGGAGGTGAAGGTGA--  1552

Query 1555  GCCAGCACCAGGAG---ATGAGTCAGGCCGCGACTGTGCAG---------GAGA--------------------  1596
               .||..|.||||   .|||||  ||||..|| |||||||         ||||                    
Sbjct 1553  ---GGCTGCGGGAGCCTCTGAGT--GGCCAGGA-TGTGCAGATGGTCACTGAGAACTGGCTGGTTCTGGAGCCC  1620

Query 1597  ---------  1596
                     
Sbjct 1621  AGGGGCTTG  1629