Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14534
• Subject: NM_007458.2
• Aligned Length: 3055
• Identities: 2532
• Gaps: 232

Alignment

Query    1  ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGCGATGGGATGCGGGGGCTCGCGGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGTAAGAG  74
            ||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCCGGCTGTATCCAAAGGCGATGGCATGCGTGGGCTCGCCGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGCAAGAG  74

Query   75  CAAAGAGGCGGAAATTAAGAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCT  148
            |||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct   75  CAAAGAGGCTGAGATCAAGAGGATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGTTCCAAGTTCAAAGGGGACAAGGCCT  148

Query  149  TGGATGGCTACAGTAAGAAAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT  222
            ||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATGGCTACAGTAAAAAGAAGTATGTGTGTAAGCTGCTCTTCATATTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT  222

Query  223  GGGCACATGGAGGCTGTGAATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTC  296
            ||.||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  GGACATATGGAGGCCGTGAACCTGCTAAGCTCTAACAAGTACACGGAGAAGCAGATAGGGTACCTGTTCATCTC  296

Query  297  TGTGCTGGTGAACTCGAACTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCA  370
            .||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  AGTCCTGGTGAACTCGAACTCAGAACTGATCCGGCTCATCAACAACGCTATCAAGAATGACCTGGCCAGTCGCA  370

Query  371  ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCC  444
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  371  ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCTTGCACTGTATCGCTAACGTGGGCAGCCGTGAGATGGGCGAGGCTTTTGCT  444

Query  445  GCTGACATCCCCCGCATCCTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCT  518
            ||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  GCAGACATTCCCCGAATCCTGGTGGCTGGGGACAGCATGGACAGTGTGAAGCAGAGTGCCGCCCTATGCCTACT  518

Query  519  TCGACTGTACAAGGCCTCGCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATG  592
            .|||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||
Sbjct  519  GCGACTCTACAAGGCCTCGCCCGACTTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCACGTGTAGTGCACTTGCTCAATG  592

Query  593  ACCAGCACATGGGTGTGGTCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTC  666
            |.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  ATCAGCACATGGGAGTGGTCACAGCTGCTGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAATCCGGATGACTTC  666

Query  667  AAGACGTGCGTCTCTCTGGCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTA  740
            |||||.||..||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACCTGTATCTCCCTGGCTGTGTCTCGCTTAAGCCGGATCGTCTCCTCAGCCTCCACTGACCTCCAGGACTA  740

Query  741  CACCTACTACTTCGTCCCAGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCTTCCAG  814
            |||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|..||||
Sbjct  741  CACTTACTACTTCGTTCCTGCACCCTGGCTCTCTGTGAAGCTACTGCGGCTGCTCCAGTGTTACCCACCACCAG  814

Query  815  AGGATGCGGCTGTGAAGGGGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAA  888
            |||||||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  AGGATGCAGCCGTGAAAGGGCGGTTAGTGGAGTGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCTCCCAAG  888

Query  889  TCCAAGAAGGTGCAGCATTCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGA  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAAGAAGGTGCAGCACTCCAACGCCAAGAACGCTATCCTCTTTGAGACCATTAGCCTCATCATCCACTATGA  962

Query  963  CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGC  1036
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTCCGCGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACTAACCTGC  1036

Query 1037  GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1037  GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCACGAGGCCGTCAAGACCCACATT  1110

Query 1111  GACACCGTCATCAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGC  1184
            ||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1111  GATACAGTTATTAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGTGTGAGGCAGCGGGCGGCTGATCTCCTGTATGC  1184

Query 1185  CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1185  CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATTGTGTCAGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACTGCTGACTATGCCA  1258

Query 1259  TCCGCGAGGAGATCGTCCTGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC  1332
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGAGAGGAGATCGTGCTGAAGGTGGCCATCCTGGCTGAGAAGTATGCAGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC  1332

Query 1333  ACCATCCTCAACCTCATCCGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGT  1406
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333  ACCATCCTCAACCTCATCCGCATCGCGGGCGACTATGTGAGCGAGGAGGTGTGGTACCGCGTGCTGCAGATCGT  1406

Query 1407  CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1407  CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGTTATGCTGCCAAGACAGTGTTTGAGGCCCTCCAGGCCCCAGCCTGTCATG  1480

Query 1481  AGAACATGGTGAAGGTTGGCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGC  1554
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  AGAACATGGTGAAGGTCGGTGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACTTGATTGCTGGGGACCCACGCTCCAGC  1554

Query 1555  CCCCCAGTGCAGTTCTCCCTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTC  1628
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||.|||||||
Sbjct 1555  CCACCAGTGCAGTTCTCGCTGCTGCACTCCAAGTTCCACCTGTGCAGCGTGGCCACCCGCGCTCTGTTGCTGTC  1628

Query 1629  CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAGNGGNGNTCTGCGGGCCGGCTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| .||.|.||||||.|||||||||
Sbjct 1629  CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCTGAGACCAAGGCCACCATCCA-AGGGGTTCTGCGTGCCGGCTCC  1701

Query 1703  CAGCTGCGCAATGCTGACGTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCAC  1776
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1702  CAGCTGCGAAATGCCGACGTGGAGCTACAGCAGCGGGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCCGTAGCCAGCAC  1775

Query 1777  CGACGTCCTGGCCACGGTGCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGA  1850
            |||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1776  CGATGTTCTGGCTACGGTGCTAGAAGAAATGCCCCCATTTCCCGAGCGGGAGTCGTCCATCTTGGCCAAGCTGA  1849

Query 1851  AACGCAAGAAGGGGCCAGGGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAAC  1924
            |.|||||||||||.||.|||||.|.|||.|||||.||.||..||||.||||||.||||||||||.||||||||.
Sbjct 1850  AGCGCAAGAAGGGCCCTGGGGCAGCCAGTGCCCTAGATGACAGCCGCAGGGACACCAGCAGCAATGACATCAAT  1923

Query 1925  GGGGGCATGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGC  1998
            |||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1924  GGGGGTGTGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACCCCCTCACCCTCCGCGGACCTCTTAGGGCTGCGGGCAGC  1997

Query 1999  CCCTCCCCCGGCAGCACCCCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTC---GATGGCCCGG  2069
            |||||||||.||.||||||||||||.|.|.|||   .||||||||.||||||||.||||||   ||.|||||..
Sbjct 1998  CCCTCCCCCTGCTGCACCCCCGGCTCCCGTAGG---CGGGAACCTCCTGGTGGATGTCTTCTCTGACGGCCCCA  2068

Query 2070  CCGCCCAGCCCAGCCTGGGGCCCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAG----------------------------  2115
            |.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||                            
Sbjct 2069  CTGCACAGCCCAGCCTGGGGCCCACTCCTGAGGAGGCCTTCCTCAGCGAGCTGGAGCCCCCTGCCCCTGAGAGC  2142

Query 2116  --------------------------------------CCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGA  2151
                                                  ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2143  CCCATGGCTTTGTTGGCTGACCCAGCTCCAGCTGCTGACCCAGGTCCTGAGGACATAGGCCCTCCCATTCCAGA  2216

Query 2152  AGCCGATGAGTTGCTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCG  2225
            |||.|||||..||.||||||||||.|||||||||||.|..||||||.||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2217  AGCAGATGAACTGTTGAATAAGTTCGTGTGTAAGAATAGTGGGGTCTTGTTTGAGAACCAGCTGCTGCAGATTG  2290

Query 2226  GAGTCAAGTCAGAGTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTC  2299
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2291  GAGTCAAGTCTGAGTTCCGGCAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACTTCTGTGCAGTTC  2364

Query 2300  CAGAATTTCTCACCCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGC  2373
            |||||.||||..|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 2365  CAGAACTTCTTGCCCACCGTGGTCCATCCTGGGGACCTCCAGACTCAGCTGGCGGTGCAGACCAAGCGTGTGGC  2438

Query 2374  GGCGCAGGTGGACGGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCC  2447
            |||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2439  GGCACAAGTGGACGGTGGCGCACAGGTGCAGCAAGTACTCAACATTGAGTGTCTGCGAGACTTCCTGACGCCGC  2512

Query 2448  CGCTGCTGTCCGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAAC  2521
            |.|||.||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513  CACTGTTGTCGGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCACCGCCCAGTCCCTCACTCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAAC  2586

Query 2522  AAGTTCTTCCAGCCCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACA  2595
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|..||
Sbjct 2587  AAATTCTTCCAGCCCACAGAGATGGCGGCCCAAGACTTTTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCCCTGCA  2660

Query 2596  GGAGGCGCAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTG  2669
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661  GGAGGCACAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCGATGGATGCTGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTG  2734

Query 2670  GCTCTGCTCTCCTGGACAATGTGGACCCCAACCCTGGTGACAGAGAAGACACCAGGGTTTGGGGGATGCCTGGG  2743
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||       |||||         .||||.||| || ||||.
Sbjct 2735  GCTCTGCTCTTCTGGACAATGTGGATCCCAACCCT-------GAGAA---------CTTTGTGGG-TG-CTGGA  2790

Query 2744  ACTTTCCTCC-------GGCCTTTTGTATTTTTATTTTTGTTCATCTGCTGCTGTTTACATTCTGGGG-----G  2805
            |   ||.|||       ||||                        ||||.|           .|||||     |
Sbjct 2791  A---TCATCCAGACGAAGGCC------------------------CTGCAG-----------GTGGGGTGTCTG  2826

Query 2806  GTTAGG-GGGAGTCCCCCTCCCTCCCTTTCCCC---CCCAA-----------------GCACAGAGGGGAGAGG  2858
            .||.|| .||||           |||..|.|||   |||||                 ||.||           
Sbjct 2827  CTTCGGCTGGAG-----------CCCAATGCCCAGGCCCAAATGTACCGTCTAACCCTGCGCA-----------  2878

Query 2859  GGCCAGGGAAGTGGATGTCTCCTCCCCTCCCACCCCACCCTGTTGT---AGCCCCTCCTACCCCGCCC-NCA--  2926
              ||||..|||.|..|||   |||||.||.|           ||||   |||..||       .|||| .||  
Sbjct 2879  --CCAGCAAAGAGCCTGT---CTCCCGTCAC-----------TTGTGTGAGCTGCT-------GGCCCAGCAGT  2929

Query 2927  TCCAGGGGCTGTGTATTATTG  2947
            ||                   
Sbjct 2930  TC-------------------  2931