Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14547
• Subject: NM_001706.5
• Aligned Length: 2123
• Identities: 2099
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT  74

Query   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC  148

Query  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA  222

Query  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA  296

Query  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT  370

Query  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG  444

Query  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC  518

Query  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCGCACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCACACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT  592

Query  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATGTCCGGATGCCTGTGGCCAAC  666

Query  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGACTTT  740

Query  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAAGTG  814

Query  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCTTGT  888

Query  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCATGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAATGC  962

Query  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCACAG  1036

Query 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGACCCC  1110

Query 1111  AAAGCCTGCTTGCCAACT--------------TTC-TTGTACTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCAGAG  1169
            ||||||||     |||||              ||| |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCCTG-----CAACTGGAAGAAATACAAGTTCATCGTGCTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCAGAG  1179

Query 1170  GGGCCTGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCAT  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  GGGCCTGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACCCAT  1253

Query 1244  GGAGCCTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GGAGCCTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCACAAG  1327

Query 1318  CCAGCCGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCA  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  CCAGCCGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCACCA  1401

Query 1392  CTCTACATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACAC  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  CTCTACATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCACAC  1475

Query 1466  CGCTGGCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGG  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  CGCTGGCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACGGGG  1549

Query 1540  CCTTCTTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCAC  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  CCTTCTTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACCCAC  1623

Query 1614  AGTGACAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGAC  1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624  AGTGACAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAAGAC  1697

Query 1688  CGTCCATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAA  1761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698  CGTCCATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGAAAA  1771

Query 1762  CCCACACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCC  1835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772  CCCACACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTGGCC  1845

Query 1836  CACCTCCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCG  1909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846  CACCTCCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTTCCG  1919

Query 1910  GCACCTTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACC  1983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920  GCACCTTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTAACC  1993

Query 1984  TGCATTTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTG  2057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994  TGCATTTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAGGTG  2067

Query 2058  CAATACCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068  CAATACCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC  2118