Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14547
- Subject:
- NM_009744.4
- Aligned Length:
- 2126
- Identities:
- 1873
- Gaps:
- 23
Alignment
Query 1 ATGGCCTCGCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTCACCCGCCATGCCAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGTCT 74
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCCTCCCCGGCTGACAGCTGTATCCAGTTTACCCGGCACGCTAGTGATGTTCTTCTCAACCTTAATCGCCT 74
Query 75 CCGGAGTCGAGACATCTTGACTGATGTTGTCATTGTTGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAAACGGTCC 148
|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 75 CCGGAGTCGGGACATCTTGACGGACGTTGTCATCGTGGTGAGCCGTGAGCAGTTTAGAGCCCATAAGACAGTGC 148
Query 149 TCATGGCCTGCAGTGGCCTGTTCTATAGCATCTTTACAGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTGATCAATCTA 222
|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TCATGGCCTGCAGCGGCCTGTTCTACAGTATCTTCACTGACCAGTTGAAATGCAACCTTAGTGTAATCAATCTA 222
Query 223 GATCCTGAGATCAACCCTGAGGGATTCTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTCGGCTCAATTTGCGGGA 296
||||||||.||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||||
Sbjct 223 GATCCTGAAATCAGCCCTGAGGGGTTTTGCATCCTCCTGGACTTCATGTACACATCTAGGCTCAACCTGAGGGA 296
Query 297 GGGCAACATCATGGCTGTGATGGCCACGGCTATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTGGACACTTGCCGGAAGT 370
.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct 297 AGGCAATATCATGGCGGTGATGACCACAGCCATGTACCTGCAGATGGAGCATGTTGTCGACACATGCAGGAAGT 370
Query 371 TTATTAAGGCCAGTGAAGCAGAGATGGTTTCTGCCATCAAGCCTCCTCGTGAAGAGTTCCTCAACAGCCGGATG 444
|.||.|||||||||||||||||.||||...||||..|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 TCATCAAGGCCAGTGAAGCAGAAATGGCCCCTGCACTTAAACCTCCCCGTGAAGAGTTCCTGAACAGCCGGATG 444
Query 445 CTGATGCCCCAAGACATCATGGCCTATCGGGGTCGTGAGGTGGTGGAGAACAACCTGCCACTGAGGAGCGCCCC 518
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|...|.||
Sbjct 445 CTGATGCCCCATGACATCATGGCCTACCGAGGTCGTGAGGTCGTGGAGAACAATATGCCACTGAGAAATACTCC 518
Query 519 TGGGTGTGAGAGCAGAGCCTTTGCCCCCAGCCTGTACAGTGGCCTGTCCGCACCGCCAGCCTCTTATTCCATGT 592
.|||||||||||||||||.|||||.||....|||||||||||||||||..||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 519 CGGGTGTGAGAGCAGAGCTTTTGCTCCTCCTCTGTACAGTGGCCTGTCAACACCACCAGCCTCTTATCCCATGT 592
Query 593 ACAGCCACCTCCCTGTCAGCAGCCTCCTCTTCTCCGATGAGGAGTTTCGGGATG---TCCGGATGCCTGTGGCC 663
|||||||.|||||..||||||.|.||||||||||.|||||||||.|.||.|||| .|||.||||||||||||
Sbjct 593 ACAGCCATCTCCCGCTCAGCACCTTCCTCTTCTCTGATGAGGAGCTCCGAGATGCCCCCCGAATGCCTGTGGCC 666
Query 664 AACCCCTTCCCCAAGGAGCGGGCACTCCCATGTGATAGTGCCAGGCCAGTCCCTGGTGAGTACAGCCGGCCGAC 737
|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||.|||||||..||||||.|||.||||..|
Sbjct 667 AACCCTTTTCCCAAGGAGCGTGCCCTCCCCTGCGACAGTGCCAGGCAAGTCCCTAATGAGTATAGCAGGCCAGC 740
Query 738 TTTGGAGGTGTCCCCCAATGTGTGCCACAGCAATATCTATTCACCCAAGGAAACAATCCCAGAAGAGGCACGAA 811
..|||||||||||||||.|.||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 CATGGAGGTGTCCCCCAGTTTGTGTCACAGCAACATCTACTCGCCCAAGGAGGCAGTCCCAGAGGAGGCTCGGA 814
Query 812 GTGATATGCACTACAGTGTGGCTGAGGGCCTCAAACCTGCTGCCCCCTCAGCCCGAAATGCCCCCTACTTCCCT 885
||||.||.||||||||||||.|||||||||.|||.|||||||.|||.||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 815 GTGACATACACTACAGTGTGCCTGAGGGCCCCAAGCCTGCTGTCCCTTCTGCTCGGAATGCTCCATACTTCCCC 888
Query 886 TGTGACAAGGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCCTCCTCGGAAGATGAGATTGCCATGCATTTCGAGCCCCCCAA 959
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGACAAAGCCAGCAAAGAAGAAGAGAGACCTTCTTCGGAGGATGAGATTGCCCTGCATTTCGAGCCCCCCAA 962
Query 960 TGCACCCCTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCACAGAGCCCCCAGAAATCTGACTGCCAGCCCAACTCGCCCA 1033
|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 TGCACCCTTGAACCGGAAGGGTCTGGTTAGTCCCCAGAGTCCCCAGAAATCCGACTGCCAGCCCAACTCACCCA 1036
Query 1034 CAGAGTCCTGCAGCAGTAAGAATGCCTGCATCCTCCAGGCTTCTGGCTCCCCTCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC 1107
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAGTCCTGCAGCAGCAAGAACGCCTGCATCCTTCAGGCCTCTGGCTCTCCGCCAGCCAAGAGCCCCACTGAC 1110
Query 1108 CCCAAAGCCTGCTTGCCAACT--------------TTC-TTGTACTCAACAGCCTCAACCAGAATGCCAAACCA 1166
||.|||||||| ||||| ||| |.||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1111 CCGAAAGCCTG-----CAACTGGAAGAAGTATAAGTTCATCGTTCTCAACAGCCTCAATCAGAATGCCAAACCC 1179
Query 1167 GAGGGGCCTGAGCAGGCTGAGCTGGGCCGCCTTTCCCCACGAGCCTACACGGCCCCACCTGCCTGCCAGCCACC 1240
|||||..||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1180 GAGGGCTCTGAGCAGGCAGAGCTGGGTCGCCTCTCCCCTCGAGCCTACCCTGCACCGCCCGCTTGCCAGCCGCC 1253
Query 1241 CATGGAGCCTGAGAACCTTGACCTCCAGTCCCCAACCAAGCTGAGTGCCAGCGGGGAGGACTCCACCATCCCAC 1314
.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1254 TATGGAGCCCGCGAACCTTGATCTCCAGTCCCCGACCAAGCTCAGTGCCAGTGGGGAGGACTCTACCATCCCCC 1327
Query 1315 AAGCCAGCCGGCTCAATAACATCGTTAACAGGTCCATGACGGGCTCTCCCCGCAGCAGCAGCGAGAGCCACTCA 1388
|||||||||||||||||||..||||.|||||||||.||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1328 AAGCCAGCCGGCTCAATAATCTCGTGAACAGGTCCCTGGCAGGCTCCCCCCGAAGCAGCAGTGAGAGTCACTCA 1401
Query 1389 CCACTCTACATGCACCCCCCGAAGTGCACGTCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATGCAGAGATGTGCCTCCA 1462
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1402 CCACTCTACATGCACCCCCCAAAGTGCACATCCTGCGGCTCTCAGTCCCCACAGCATACAGAGATGTGCCTCCA 1475
Query 1463 CACCGCTGGCCCCACGTTCCCTGAGGAGATGGGAGAGACCCAGTCTGAGTACTCAGATTCTAGCTGTGAGAACG 1536
.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1476 TACTGCTGGGCCCACGTTCCCGGAGGAGATGGGGGAAACCCAGTCAGAGTATTCGGATTCTAGCTGTGAGAATG 1549
Query 1537 GGGCCTTCTTCTGCAATGAGTGTGACTGCCGCTTCTCTGAGGAGGCCTCACTCAAGAGGCACACGCTGCAGACC 1610
||.|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1550 GGACCTTCTTCTGCAACGAATGTGACTGCCGTTTCTCTGAGGAGGCCTCGCTCAAGAGGCACACGCTGCAGACG 1623
Query 1611 CACAGTGACAAACCCTACAAGTGTGACCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAA 1684
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 CACAGTGACAAACCATACAAATGTGATCGCTGCCAGGCCTCCTTCCGCTACAAGGGCAACCTCGCCAGCCACAA 1697
Query 1685 GACCGTCCATACCGGTGAGAAACCCTATCGTTGCAACATCTGTGGGGCCCAGTTCAACCGGCCAGCCAACCTGA 1758
|||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1698 GACTGTCCACACGGGTGAGAAACCCTATCGCTGTAACATTTGTGGAGCGCAGTTCAATCGGCCAGCCAACCTGA 1771
Query 1759 AAACCCACACTCGAATTCACTCTGGAGAGAAGCCCTACAAATGCGAAACCTGCGGAGCCAGATTTGTACAGGTG 1832
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1772 AGACCCACACTCGAATTCACTCTGGAGAAAAGCCCTACAAATGTGAAACCTGTGGGGCCAGGTTTGTTCAGGTG 1845
Query 1833 GCCCACCTCCGTGCCCATGTGCTTATCCACACTGGTGAGAAGCCCTATCCCTGTGAAATCTGTGGCACCCGTTT 1906
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1846 GCCCACCTCCGTGCCCACGTGCTCATCCACACTGGAGAGAAGCCGTACCCCTGTGAAATCTGTGGCACTCGCTT 1919
Query 1907 CCGGCACCTTCAGACTCTGAAGAGCCACCTGCGAATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTA 1980
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 CCGGCACCTTCAGACTCTGAAGAGCCATCTGCGCATCCACACAGGAGAGAAACCTTACCATTGTGAGAAGTGTA 1993
Query 1981 ACCTGCATTTCCGTCACAAAAGCCAGCTGCGACTTCACTTGCGCCAGAAGCATGGCGCCATCACCAACACCAAG 2054
|||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 ACCTGCACTTTCGTCACAAAAGCCAACTGCGACTTCATTTGCGCCAGAAGCACGGCGCCATCACCAACACCAAG 2067
Query 2055 GTGCAATACCGCGTGTCAGCCACTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC 2108
|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 GTGCAATACCGCGTGTCGGCCGCTGACCTGCCTCCGGAGCTCCCCAAAGCCTGC 2121