Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14562
• Subject: NM_001363990.1
• Aligned Length: 1435
• Identities: 1431
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74

Query   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148

Query  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222

Query  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296

Query  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370

Query  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444

Query  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518

Query  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592

Query  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666

Query  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATC  740
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCC-TATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATC  739

Query  741  TGATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCATTAAGCACCCCTGGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  740  TGATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCCTTAAGCACCCCTGGATC  813

Query  815  TCGCACCGCTCCACCGTGGCATCGTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  888
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TCGCACCGCTCCACCGTGGCATCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  887

Query  889  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAA  961

Query  963  ACAAGAAGAGCGATGGTGTGAAGGAATCCTCAGAGAGCACCAACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ACAAGAAGAGCGATGGTGTGAAGGAATCCTCAGAGAGCACCAACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTG  1035

Query 1037  CGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAAGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAAGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACAC  1109

Query 1111  GAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGCCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGCCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCC  1183

Query 1185  ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATC  1257

Query 1259  CACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGCATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGCATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCC  1331

Query 1333  ACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  ACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCGGGATGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA  1405

Query 1407  GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC  1435
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC  1434